| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5783618 | 85 (0.910) | 6 (0.070) | 5/228 | NT | 7.1% | coding (2037/3309 nt) | kefA | intermediate mechanosensitive channel protein |
| ? | NC_002947 | = 5783629 | 80 (0.940) | coding (2048/3309 nt) | kefA | intermediate mechanosensitive channel protein | |||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
GTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAGCCGCCTTCGTGCGCGG > NC_002947/5783469‑5783767 | tggcCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTgg < 1:165067/150‑1 (MQ=255) ggcCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACGTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTggg < 1:2083784/150‑1 (MQ=255) ggcCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTggg < 1:357230/150‑1 (MQ=255) cGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGt > 2:1395856/1‑150 (MQ=255) tctcACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGAGTGAGTCATATCTTCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTa < 2:1882218/147‑1 (MQ=255) cACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCGG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCg < 1:1245354/150‑1 (MQ=255) aCCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGCCGCGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAgaga > 1:1882218/1‑147 (MQ=255) ccAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGtt > 1:2399993/1‑150 (MQ=255) cAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTc < 2:549645‑M2/150‑2 (MQ=255) cAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTc < 1:1646898‑M2/150‑2 (MQ=255) ggcCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTca > 2:263604‑M2/2‑148 (MQ=255) ccTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTcacc < 2:1387396‑M2/150‑5 (MQ=255) tCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATNGGCGTGGTGCTGACNTGCTNTGCGCTAATGGCCTGGATGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTaaccgca < 1:589907‑M2/150‑8 (MQ=255) ggCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGaacgctacccccaccgccct < 2:2241986‑M1/150‑21 (MQ=255) ggCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGaacgctacccccaccgccct < 2:1586628‑M1/150‑21 (MQ=255) ggCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTcaccgccct > 2:2218008‑M2/1‑141 (MQ=255) cACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTcaccgccctgc < 2:1165748‑M2/150‑12 (MQ=255) aaGACGACGTGTAGGGAATGAGCGTAGAGCAGACCGTCTATGCTCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCg < 2:1098074/149‑1 (MQ=255) aGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCCCACGGTG‑‑GCCGAGCTGGACACCGCAGTGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCCTCGc > 2:664029/1‑150 (MQ=255) aGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGc < 1:1165748/150‑1 (MQ=255) gacgTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTggg < 1:1733415/119‑1 (MQ=255) gacgTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTggg > 2:1733415/1‑119 (MQ=255) gacgTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTg > 1:667187/1‑150 (MQ=255) ttGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTACCCATCGCCCTGTtcgtc < 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tAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGa > 2:1867533/1‑150 (MQ=255) aTGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAg < 1:2398911/150‑1 (MQ=255) tGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTAcc > 2:2070359/1‑150 (MQ=255) gctgctCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGa < 2:1646898/150‑1 (MQ=255) tgctCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGc < 1:402140/113‑1 (MQ=255) 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acCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTcaccgcc < 2:1638622‑M2/42‑8 (MQ=255) acCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGctactac > 2:1252436/1‑84 (MQ=255) acCTCGCTG‑‑TTACGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTcaccgcc > 1:1638622‑M2/1‑35 (MQ=255) cTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACAACCTGTACCTGCTGCTGTTCTTGTTGGTGAt > 2:1439376/1‑150 (MQ=255) tCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCg < 1:702781/64‑1 (MQ=255) tCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATc > 2:794612/1‑150 (MQ=255) cTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGaa < 1:781442/150‑1 (MQ=255) tG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTc > 2:2134567/1‑107 (MQ=255) tG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTc < 1:2134567/107‑1 (MQ=255) tG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAg < 1:244151/150‑1 (MQ=255) tG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAg < 1:2070359/150‑1 (MQ=255) tG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCAGCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTCCTACGCGGCTCTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAg < 2:667187/150‑1 (MQ=255) gCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCCTCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGATGTTCTGTATGGTGATCTAAGCCGCCt > 2:1098602/1‑150 (MQ=255) gCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAGCCGCCt < 2:71210/150‑1 (MQ=255) cAGGGCGGTGaacgctacccccaccgccctgcggaacagcgaggtgtcacggtgtgccgggctgctgagcagcagacggctgagcagccaggccattagcgcatagcaggtcagcaccacgccgatgcccaacacgtcgtctgccagtgc < 1:99103‑M1/150‑141 (MQ=255) gggCGGTGGGGGTAGCGTTcaccgccctgcggaacagcgaggtgtcacggtgtgccgggctgctgagcagcagacggctga > 2:725595‑M2/1‑19 (MQ=255) gggCGGTGGGGGTAGCGTTcaccgccctgcggaacagcgaggtgtcacggtgtgccgggctgctgagcagcagacggctga < 1:725595‑M2/81‑63 (MQ=255) tgcGGTTaacgctacccccaccgccctgcggaacagcgaggtgtcacggtgtgccgggctgctgagcagcagacggctgagcatccaggccattagcgcanagcangtcagcaccacgccnatgcccaacacgtcgtctgccagtgccga < 1:589907‑M1/149‑144 (MQ=255) ggCGGTGaacgctacccccaccgccctgcgtaacagcgaggt > 1:1638622‑M1/1‑7 (MQ=255) ggCGGTGaacgctacccccaccgccctgcggaacagcgaggt < 2:1638622‑M1/42‑36 (MQ=255) ggCGGTGGGGGTAGCGTTcaccgccctgcggaacagcgaggtgtcacgg > 2:639710‑M2/1‑18 (MQ=255) ggCGGTGGGGGTAGCGTTcaccgccctgcggaacagcgaggtgtcacgg < 1:639710‑M2/49‑32 (MQ=255) ggCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAGCCGCCTTCGt < 2:2259677/150‑1 (MQ=255) ggTGaacgctacccccaccgccctgcggaacagcgaggtgtcacggtgtgccgggctgctgagcagcagacggctgagcagccaggccattagcgcatagcaggtcagcaccacgccgatgcccaacacgtcgtctgccagtgccgaagg < 2:1387396‑M1/150‑147 (MQ=255) gaacgctacccccaccgccctgcggaacagcgaggtgtcacggtgtgccgggctgctgagcagcagacggctgagcagccaggccattagcgcatagcaggtcagcaccacgccgatgcccaacacgtcgtctgccagtgccgaaggctg < 1:2423485‑M1/150‑150 (MQ=255) gaacgctacccccaccgccctgcggaacagcgaggtgtcacggtgtgccgggctgctgagcagcagacggctgagcagccaggccattagcgcatagcaggtcagcaccacgccgatgcccaacacgtcgtctgccagtgccgaaggctg < 2:549645‑M1/150‑150 (MQ=255) | GTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAGCCGCCTTCGTGCGCGG > NC_002947/5783469‑5783767 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |