New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | 5843224 = | 70 (0.780) | coding (296/486 nt) | PP_5121 | hypothetical protein |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATCCCGGTGGTCCTGGCCGGTACACAGGCCACCGATGCGCCGGTGTTGCGCAGCCTCGACAACAAGCTGGCGTCGTTGTCGCCGGAAATGCTCAAGCTCACCCGGCAATTGTTCGACGTGCTCAGCCTGCCGCTGACTC‑GCGGCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCACGCCTCGTTGCTGCAACTGC > NC_002947/5843045‑5843343 | ttcggggcgttcgtaccaggccatttgcagcagttgcagcaacgaggcgtgccccatgcgtagcaggttcagcgagctgtcctgccagcgttgcaggaacgccgtgacctgcgtggcgccagcttggccccagctgccccagacgccggt < 1:754778‑M1/1‑1 (MQ=255) cgacgacCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATCCCGGTGGTCCTGGCCGGTACACAGGCCACCGATGCGCCGGTGTTGCGCAGCCTCGACAACAAGCTGGCGTCGTTGTCGCCGGAAATGCTCAAGCTCACCCGGCAATTGTTCGACGTGCt > 1:420822/1‑150 (MQ=255) tcggggcgttcgtaccaggccatttgcagcagttgcagcaacgaggcgtgccccatgcgtagcaggttcagcgagctgtcctgccagcgttgcaggaacgccgtgacctgcgtggcgccagcttggccccagctgccccatacgccggTc > 2:1856865‑M1/149‑150 (MQ=255) 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ccccTGCTGCGTGCGCTGATCCCGGTGGTCCTGGCCGGTACACAGGCGACCGATGCGCCGGTGTTGCGCAGCCTCGACAACAAGCTGGCGTCGTTGTCGCCGGAAATGCTCAAGCTCACCCGGCAATTGTTCGACGTGCTCAGCCTGCCg > 1:555656/1‑150 (MQ=255) ccccTGCTGCGTGCGCTGATCCCGGTGGTCCTGGCCGGTACACAGGCCACCGATGCGCCGGTGTTGCGCAGCCTCGACAACAAGCTGGCGTCGTTGTCGCCGGAAATGCTCAAGCTCACCCGGCTATTGTTCGACGTGCTCAGCCTGCCg > 1:1726927/1‑150 (MQ=255) ccTGCTGCGTGCGCTGATCCCGGTGGTCCTGGCCGGTACACAGGCCACCGATGCGCCGGTGTTGCGCAGCCTCGACAACAAGCTGGCGTCGTTGTCGCCGGAAATGCTCAAGCTCACCCGGCAATTGTTCGACGTGCTCAGCCTGCCGCt > 2:251235/1‑150 (MQ=255) ccTGCTGCGTGCGCTGATCCCGGTGGTCCTGGCCGGTACACAGGCCACCGATGCGCCGGTGTTGCGCAGCCTCGACAACAAGCTGGCGTCGTTGTCGCCGGAAATGCTCAAGCTCACCCGGCAATTGTTCGACGTGCTCAGCCTGCCGCt > 1:1248571/1‑150 (MQ=255) actgctgCGTGCGCTGATCCCGGTGGTCCTGGCCGGTACACAGGCCACCGATGCGCCGGTGTTGCGCAGCCTCGACAACAAGCTGGCGTCGTTGTCGCCGGAAATGCTCAAGCTCACCCGGCAATTGCTCGACGTGCTCAGCCTGCCGcc > 2:1676011/2‑149 (MQ=255) 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(MQ=255) aCCCGGCAATTGTTCGACGTGCTCAGCCTGCCGCTGACTC‑GCGGCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGgc < 1:594949/84‑1 (MQ=255) ccGGCAATTGTTCGACGTGCTCAGCCTGCCGCTGACTC‑GCGGCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGc < 2:58173/99‑1 (MQ=255) ccGGCAATTGTTCGACGTGCTCAGCCTGCCGCTGACTC‑GCGGCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGc > 1:58173/1‑99 (MQ=255) ccGGCAATTGTTCGACGTGCTCAGCCTGCCGCTGACTC‑GCGGCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGTGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCa > 1:1399784/1‑150 (MQ=255) ccGGCAATTGTTCGACGTGCTCAGCCTGCCGCTGACTC‑GCGGCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCa > 1:977062/1‑150 (MQ=255) cGGCAATTGTTCGACGTGCTCAGCCTGCCGCTGACTC‑GCGGCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCACAGCTGTCATGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCAc > 2:2410163/1‑150 (MQ=255) aTTGTTCGACGTGCTCAGCCTGCCGCTGACTC‑GCGGCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGCACCTGTTATGCATGGGGCACGCCTc < 2:810742/150‑1 (MQ=255) aTTGTTCGACGTGCTCAGCCTGCCGCTGACTC‑GCGGCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCACGCCTc > 1:1633231/1‑150 (MQ=255) ccagacgccggTCAGCGGGCCGC‑GAGTCAGCGGCAGGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCACGCCTCGtt < 1:219175‑M1/139‑1 (MQ=255) cGACGTGCTCAGCCTGCCGCTGACTC‑GCGGCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCACGCCTCGTtgct < 2:541233/150‑1 (MQ=255) gACGTGCTCAGCCTGCCGCTGACTC‑GCGGCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCACGCCTCGTtgctg > 2:607594/1‑150 (MQ=255) aCGTGCTCAGCCTGCCGCTGACTC‑GCGGCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACgg < 2:111585/84‑1 (MQ=255) aCGTGCTCAGCCTGCCGCTGACTC‑GCGGCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACgg > 1:111585/1‑84 (MQ=255) aCGTGCTCAGCCTGCCGCTGACTC‑GCGGCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCAt > 2:595695/1‑130 (MQ=255) aCGTGCTCAGCCTGCCGCTGACTC‑GCGGCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCAt < 1:595695/130‑1 (MQ=255) gTGCTCAGCCTGCCGCTGACTC‑GCGGCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGTGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCACGCCTCGTTGCTGCaa < 2:1399784/150‑1 (MQ=255) tGCTCAGCCTGCCGCTGACTC‑GCGGCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCACGCCTCGTTGCTGCAAc < 1:2200669/150‑1 (MQ=255) TCAGCCTGCCGCTGACTC‑GCGGCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCACGCCTCGTTGCTGCAActgc > 1:1469095‑M1/1‑150 (MQ=255) | CGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATCCCGGTGGTCCTGGCCGGTACACAGGCCACCGATGCGCCGGTGTTGCGCAGCCTCGACAACAAGCTGGCGTCGTTGTCGCCGGAAATGCTCAAGCTCACCCGGCAATTGTTCGACGTGCTCAGCCTGCCGCTGACTC‑GCGGCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCACGCCTCGTTGCTGCAACTGC > NC_002947/5843045‑5843343 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |