New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5856874 | 137 (1.470) | 8 (0.090) | 7/240 | NT | 5.6% | coding (745/1392 nt) | PP_5133 | membrane protein |
? | NC_002947 | = 5856913 | 139 (1.550) | coding (784/1392 nt) | PP_5133 | membrane protein |
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
TGGCGACCCGGCGCTATGGCTTTGTCTGGGAAACCACCTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGCCGTGAACGCCTGACGCTGGACCTGGGC > NC_002947/5856725‑5857023 | tGGCGACCCGGCGCTATGGCTTTGTCTGGGAAACCACCTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCCCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCC > 1:516064‑M1/1‑150 (MQ=255) gCGACCCGGCGCTATGGCTTTGTCTGGGAAACCACCTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTg > 2:1654403/1‑150 (MQ=255) gCGACCCGGCGCTATGGCTTTGTCTGGGAAACCACCTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTg > 1:58756/1‑150 (MQ=255) ccGGCGCTATGGCTTTGTCTGGGAAACCACCTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGc > 1:1444409/1‑150 (MQ=255) ccGGCGCTATGGCTTTGTCTGGGAAACCACCTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGCCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTCCCAGc > 2:193241/1‑150 (MQ=255) gcgcTATGGCTTTGTCTGGGAAACCACCTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCt < 2:69733/150‑1 (MQ=255) gcgcTATGGCTTTGTCTGGGAAACCACCTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCt > 1:2033761/1‑150 (MQ=255) tATGGCTTTGTCTGGGAAACCACCTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGAc > 1:193555/1‑150 (MQ=255) aTGGCTTTGTCTGGGAAACCACCTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTg < 1:2383942/137‑1 (MQ=255) aTGGCTTTGTCTGGGAAACCACCTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTg > 2:2383942/1‑137 (MQ=255) gCTTTGTCTGGGAAACCACCTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTgg > 1:601152/1‑150 (MQ=255) gCTTTGTCTGGGAAACCACCTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTgg < 1:103408/150‑1 (MQ=255) gCTTTGTCTGGGAAACCACCTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTg > 2:550732/1‑149 (MQ=255) gCTTTGTCAGGGAAACCACCTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTgg > 1:359489/1‑150 (MQ=255) tttGTCTGGGAAACCACCTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGcc > 1:1888665/1‑150 (MQ=255) ttGTCTGGGAAACCACCTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGccc < 2:2033761/150‑1 (MQ=255) tGGGAAACCACCTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGt < 1:37901/140‑1 (MQ=255) tGGGAAACCACCTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGAGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAg > 1:1451170/1‑150 (MQ=255) gggAAACCACCTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAgg > 1:1039843/1‑150 (MQ=255) gAAACCACCTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGcc > 2:423851/1‑150 (MQ=255) accaccTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTgg < 2:1039843/150‑1 (MQ=255) ccaccTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTggg > 2:393207/1‑150 (MQ=255) caccTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCt > 1:322328/1‑126 (MQ=255) caccTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCt < 2:322328/126‑1 (MQ=255) caccTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGc > 1:859308/1‑144 (MQ=255) caccTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGc < 2:859308/144‑1 (MQ=255) cccTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGcc < 2:2295942/149‑1 (MQ=255) ccTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGACCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCa > 2:925496/1‑150 (MQ=255) cgccgcCGACCCGCTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCagctggcccaggcctggcgggccacgtccagggctggcaggct < 2:50229‑M1/150‑44 (MQ=255) gccgccGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGACAGCCTGCCA‑‑‑‑GCCagctggcccaggcctggcgggccacgtccagggctg < 1:550970‑M1/150‑37 (MQ=255) gccgccGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CAGCCTGCCagctggcccaggcctggcgggccacgtccagggctggcag < 1:731406‑M1/150‑41 (MQ=255) gccgccGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTggctg > 1:613198‑M2/1‑145 (MQ=255) gccgACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CAGCCTGCCagctggcccaggcctggcgggccacgtccagggctggcaggct < 2:526819‑M1/150‑44 (MQ=255) ccGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCgtg > 1:1448432/1‑150 (MQ=255) ccGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCgtg > 1:1550599/1‑150 (MQ=255) ccGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCgtg < 1:1690214/150‑1 (MQ=255) ccGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCCACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCagctggcccaggcctggcgggccacgtccagggctggcaggctgtcgcc < 1:1973603‑M1/146‑50 (MQ=255) gTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCgtggt > 2:2186736/1‑150 (MQ=255) cactcaCCCGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCt < 1:521667/147‑1 (MQ=255) attcaCCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTg < 2:2219913/150‑1 (MQ=255) ttcaCCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTgg > 2:1108268/1‑150 (MQ=255) ttcaCCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCGGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTgg > 1:1619925/1‑150 (MQ=255) cccTGACCCACGCACTGGGCGCCCTCCCGGCGTGGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGtat < 1:183913/149‑1 (MQ=255) aCCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGtat > 2:1964278/1‑150 (MQ=255) cTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATAc > 2:716932/1‑150 (MQ=255) aCCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGc < 1:274233/150‑1 (MQ=255) aCCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGc > 1:207354/1‑150 (MQ=255) ccccAGCACTGGGCTCCTTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTTCCGCCCGTAGTCTTTATCCCCGCCAGCCGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑CCCTTCCGCTCCTGGTGGTGTCCCGCCAGGCCTGGACCAGGTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGcc < 2:598833/150‑1 (MQ=255) cAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTg < 1:1732753/90‑1 (MQ=255) cAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCgtggtgg > 2:1717899/1‑135 (MQ=255) cAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGc < 1:1717899/136‑1 (MQ=255) aaGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCgtggtg < 1:2214984/134‑1 (MQ=255) aaGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCACCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGa < 1:2139867/91‑1 (MQ=255) aaGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCACCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGa > 2:2139867/1‑91 (MQ=255) aGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCctgct < 2:359489/150‑1 (MQ=255) aGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCctgct > 2:1417098/1‑150 (MQ=255) aCTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGcc < 1:2151087/150‑1 (MQ=255) cTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCct < 1:785039/143‑1 (MQ=255) tGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGcccc > 2:1283802/1‑150 (MQ=255) gcCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCctg < 1:1064388/150‑1 (MQ=255) ccTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCctgct < 2:207354/150‑1 (MQ=255) cTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTg > 1:2020389/1‑81 (MQ=255) tCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCctgctgc > 1:477257/1‑150 (MQ=255) cccGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCctgctgct < 1:1247834/150‑1 (MQ=255) gtcgtTGCTGGGCTTAGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAACGGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGc > 1:1358264/1‑150 (MQ=255) ttGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCggg > 1:2227059/1‑150 (MQ=255) tGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCATGCTGCTGGc > 2:906912/1‑142 (MQ=255) tGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCGGCTGCCCCGCATGCTGCTGGc < 1:906912/142‑1 (MQ=255) ggCTTCGTCGGGCACGGCGAAGCCCTGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGc < 2:1575664/150‑1 (MQ=255) ggCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTg < 1:1632890/60‑1 (MQ=255) ggCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCCTGGCGCTGGTGTAAGACCTGCTTCCGCCCGTGCTGCCTGCCGGGTTagtc > 2:1722649/1‑147 (MQ=255) cTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCt < 1:1403830/150‑1 (MQ=255) tCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCtgt > 2:2110687/1‑150 (MQ=255) ccGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGtggcgctggc < 1:694853/150‑1 (MQ=255) ccGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGtggcgctggc > 1:2347515/1‑150 (MQ=255) aGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGgcgccagcgccacag < 1:1108268/150‑4 (MQ=255) gCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGc > 1:1903573/1‑150 (MQ=255) cATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGCCg > 1:1348336/1‑150 (MQ=255) cATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGCCg > 2:1472284/1‑150 (MQ=255) aTGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGCCGt < 2:1358264/150‑1 (MQ=255) tGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTggctgctcggcgtggatcatggcttcgtcgggcacggcgaagcccagcaacgacgggagggcgcccagtgcttgggtcaggtgaatg < 2:1432368‑M2/150‑88 (MQ=255) tGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGCCGTg > 2:97516/1‑150 (MQ=255) tCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGCCGTGAAc > 2:2126426/1‑150 (MQ=255) cgcgCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGCCGTGAACGc > 1:1619680/1‑150 (MQ=255) cgcgCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGCCGTGAACGc < 1:925496/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGCCGTGAACGcc < 2:1068226/150‑1 (MQ=255) cAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGtggcgctggc < 2:748927/128‑1 (MQ=255) cAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGCCGTGAACGCCTGAc > 1:248689/1‑150 (MQ=255) cAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGCCGTGAACGCCTGAc > 1:276713/1‑150 (MQ=255) gcggcgA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGCCGTGAACGCCTGACGc > 2:912340/1‑150 (MQ=255) ggcgA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTggctgtcgccgctggcgcggatcatggcttcgtcgggcacggcgaagcccagcaacgacgggagggcgcccagtgcttgggtcaggtgaatgaacgg > 2:1973603‑M2/1‑49 (MQ=255) a‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTggctgtcgccgctggcgcggatcatggcttcgtcgggcacggcgaagcccagcaacgacgggagggcgcccagtgcttgggtcaggtgaatgagcgggtcggcggcg < 2:50229‑M2/150‑108 (MQ=255) ctgccagctggcccaggcctggcgggccacgtccagggctggcaggctgtcgccgctggcgcggatcatggcttcgtcgggcacggcgaagcccagcaacgacgggagggcgcccagtgcttgggtcaggtgaatgaacgggtcggcggc > 2:311413‑M1/3‑5 (MQ=255) gccagctggcccaggcctggcgggccacgtccagggctggcaggctgtcgccgctggcgcggatcatggcttcgtcgggcacggcgaagcccagcaacgacgggagggcgcccagtgcttgggtcaggtgaatgaacgggtcggcggcga < 2:572742‑M1/150‑148 (MQ=255) ccTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGc < 2:1079676/82‑1 (MQ=255) ccTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGc > 1:1079676/1‑82 (MQ=255) ccTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCCGGTGATGAATGTGACCCATGCTCCAAGTCCTGGAACTCCTGACGCTGGAGCTggg > 2:1842976/1‑150 (MQ=255) cTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTggcaggctgtcgccgctggcgcggatcatggcttcgtcgggcacggcgaagcccagcaacgacgggagggcgcccagtgcttgggtcaggtgaatgaacgggtcggcggc < 1:731406‑M2/150‑111 (MQ=255) cTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGCCGTGAACGCCTGACGCTGGACCTGGGc > 2:1933087/1‑150 (MQ=255) cTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGCCGTGAACGCCTGACGCTGGACCTGGGc < 1:396229/150‑1 (MQ=255) | TGGCGACCCGGCGCTATGGCTTTGTCTGGGAAACCACCTTGCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑‑GCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGCCGTGAACGCCTGACGCTGGACCTGGGC > NC_002947/5856725‑5857023 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |