New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5903842 | 72 (0.770) | 8 (0.100) | 5/218 | NT | 10.5% | intergenic (+42/+65) | PP_5176/spuH | hypothetical protein/spermidine/putrescine ABC transporter permease |
? | NC_002947 | = 5903870 | 73 (0.900) | intergenic (+70/+37) | PP_5176/spuH | hypothetical protein/spermidine/putrescine ABC transporter permease |
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
GAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCCTGCTGA > NC_002947/5903693‑5903991 | gtgtgtGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTcac < 1:57598/150‑1 (MQ=255) tgtgtgGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTcacc > 2:1581277/1‑150 (MQ=255) tgtgGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTcaccac > 1:2309119/1‑150 (MQ=255) gtgGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCAAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGACAGAAGTATCAGGGACTATCAACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACcaca > 1:771507/1‑150 (MQ=255) tgGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACaa < 2:587996/150‑1 (MQ=255) tgGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACaa < 1:1926570/150‑1 (MQ=255) gTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTcacagccttc < 2:1471279/150‑8 (MQ=255) gTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCCGACGTATCAGGTATTAGTCTCCTTGTGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGacctcacagccttcaggg < 1:1223502‑M1/150‑19 (MQ=255) gTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAg < 1:1581277/150‑1 (MQ=255) gTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGacctcacagccttcaggg < 1:790514‑M1/150‑19 (MQ=255) tAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAgg > 1:1747571/1‑150 (MQ=255) aTTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTcc > 1:857821‑M2/1‑148 (MQ=255) aTTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTcc < 2:1728598‑M2/150‑3 (MQ=255) ttgCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgt < 2:1636049‑M1/150‑35 (MQ=255) ttgCCAAGCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTccctgt > 1:275293‑M2/1‑144 (MQ=255) tgCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCGTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGacctcaaagatgtcagggttgtggtgagccctgtg < 1:324122‑M1/150‑36 (MQ=255) gCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgg < 1:1088597‑M1/150‑37 (MQ=255) cAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGG < 1:389326‑M1/112‑1 (MQ=255) aTCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTTCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGGGGTccctgtgggagc < 2:204061‑M2/150‑13 (MQ=255) cccTTGAGGGCTGGATTGATCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGTCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTccctgtgggagcgg > 2:1261557‑M2/1‑136 (MQ=255) ttGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGG > 2:962832‑M1/1‑105 (MQ=255) ttGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGG < 1:962832‑M1/105‑1 (MQ=255) tGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGt < 2:1972290/150‑1 (MQ=255) aGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTTTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGc < 1:63095/150‑1 (MQ=255) aTTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgg > 1:206357‑M1/1‑94 (MQ=255) aTTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgg < 2:206357‑M1/130‑37 (MQ=255) aTTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGaaa > 1:516958/1‑150 (MQ=255) tGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAgg < 1:2099549/150‑1 (MQ=255) tGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAgg < 2:1142937/150‑1 (MQ=255) tCAGGAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGaa < 2:774979/106‑1 (MQ=255) tCAGGAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGaa > 1:774979/1‑106 (MQ=255) tCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGaa < 1:814477/106‑1 (MQ=255) tCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTccctgtgggagcgggc < 1:1395756‑M2/133‑17 (MQ=255) tCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTccctgtgggagcgggc > 2:1395756‑M2/1‑117 (MQ=255) tCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTcc > 1:1945694‑M2/1‑117 (MQ=255) tCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTcc < 2:1945694‑M2/119‑3 (MQ=255) aGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAg > 2:1403489/1‑150 (MQ=255) aGAAGTATCAGGGACTACCCACATTGGGAGGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGCACCCTTCGCGGGGATGGACGCTAACACTGGGCTCACAGCAACCCTGACGGCTGTGAGGTTCTAGTGGGCCGGGTCGTGCCAGCGgaacacccag > 2:499163/1‑143 (MQ=255) aaGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCAGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCcg > 1:1820813/1‑136 (MQ=255) tATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAg < 1:399721/150‑1 (MQ=255) tATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAg > 2:776447/1‑150 (MQ=255) tCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACaa < 1:1394857/90‑1 (MQ=255) tCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACaa > 2:1394857/1‑90 (MQ=255) tCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGc > 1:1586882/1‑150 (MQ=255) tCAGGGACTACCAACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTccctgtgggagcgggc > 1:1307836‑M2/1‑108 (MQ=255) aGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGaa < 2:1527266/95‑1 (MQ=255) gggACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGa < 2:1062495/150‑1 (MQ=255) tCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCATGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGTCGACGCAGcc > 1:1929633/1‑150 (MQ=255) acaTTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAg < 1:11467/130‑1 (MQ=255) acaTTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACGGCCAGGGCAGGCCGGCGCAGCCAcc > 2:1961689/1‑150 (MQ=255) acaTTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGAAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGGCAGGCCGACGCCGCCAcc > 1:108232/1‑150 (MQ=255) aTGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCCGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCgg < 2:2309119/150‑1 (MQ=255) tATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAgg < 2:1310638/111‑1 (MQ=255) tATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCtt < 2:1747571/150‑1 (MQ=255) tGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGa < 2:516958/150‑1 (MQ=255) gCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTccctgtgggagcgggc < 2:835703‑M2/93‑17 (MQ=255) gCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTccctgtg < 1:2161977‑M2/84‑8 (MQ=255) gCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTccctgtg > 2:2161977‑M2/1‑77 (MQ=255) gCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTg > 1:555928/1‑96 (MQ=255) cTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGa < 2:1125040/73‑1 (MQ=255) cTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGa > 1:1125040/1‑73 (MQ=255) ggAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTccctgtgggagc < 2:375164‑M2/73‑13 (MQ=255) aGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCtt > 1:1925428/1‑128 (MQ=255) aGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCtt < 2:1925428/128‑1 (MQ=255) gCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTgg < 2:553129/150‑1 (MQ=255) ccTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCGCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTGTGGGAAGCCCAGCCACCTCCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGc > 2:1881487/1‑150 (MQ=38) agcgGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAg > 2:937509/2‑93 (MQ=255) agcgGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAg < 1:937509/92‑1 (MQ=255) cgGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTgcagc > 1:351783/1‑150 (MQ=255) aTGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCct < 1:1961689/150‑1 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGGacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggctccagcaccgattcaaagccataccgcatcccaatgttggtagtccctga > 1:1307836‑M1/1‑16 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGGacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggctccagcaccgattcaaagccataccgcatcccaatgtggatagtccctgatacttctga < 1:1395756‑M1/133‑118 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGGacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggctccagcaccgattcaaagccataccgcatcccaatgtggatagtccctga < 2:1307836‑M1/124‑109 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGGacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggctccagcaccgattcaaagc < 2:835703‑M1/93‑78 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGGacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggctccagcaccgattcaaagc > 1:835703‑M1/1‑16 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTccctgtgggagc < 2:1520341‑M2/55‑13 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTccctgtgggagc > 1:1520341‑M2/1‑43 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGGacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgggagcggacatgcccgcgaaggctccagcaccgattcaaagccataccgcatcccaatgtggatagtccctgatacttctgatcaatccagccctcaaggg > 2:1261557‑M1/1‑14 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTc > 1:164347/1‑150 (MQ=255) gCTCCCACAGGGacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggctcc > 1:375164‑M1/1‑12 (MQ=255) gCTCCCACAGGGacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggctcc < 2:375164‑M1/73‑62 (MQ=255) gCTCCCACAGGGacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgggagcggg > 1:1520341‑M1/1‑12 (MQ=255) ccACAGGGacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggctccagcaccgattcaaagccataccgcatcccaatgtggatagtccctgatacttctgaccactccagccctcaagggattggc > 2:850540‑M1/1‑8 (MQ=255) ccACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTccctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggctccagcaccgattcaaagccataccgcatcccaatgtggatagtccctgatacttctgaccaatccagccctcaagggattggc < 2:548970‑M2/150‑115 (MQ=255) ccACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTccctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggctccagcaccgattcaaagccataccgcatcccaatgtggatagtccctgatacttctgaccaatccagccctcaagggattggc < 1:1088597‑M2/150‑115 (MQ=255) ccACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTccctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggctccagcaccgattcaaagccataccgcatcccaatgtggatagtccctgatacttctgaccaat > 1:206357‑M2/1‑36 (MQ=255) cacaGGGacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggctccagcaccgattcaaagccataccgcatcccaatgtggatagtccctgatacttctgaccaatcccgcactcaagggattggca > 2:771507‑M1/1‑7 (MQ=255) cacaGGGacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggctccagcaccgattcaaagc < 1:2161977‑M1/84‑78 (MQ=255) cacaGGGacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggctccagcaccgattcaaagc > 2:2161977‑M1/1‑7 (MQ=255) cacaGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGcc > 2:463052/1‑150 (MQ=255) cacaGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGAGTGACCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGcc > 2:585337/1‑150 (MQ=255) acaGGGacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggctccagcaccgattcaaagccataccgcatcccaatgtggatagtccctgatacttctgaccaatccagccctcaagggcttggcaa > 1:275293‑M1/1‑6 (MQ=255) acaGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTccctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggctccagcaccgattcaaagccataccgcatcccaatgtggatagtccctgatacttctgaccaatccagccctcaagggattggcaa < 2:1636049‑M2/150‑117 (MQ=255) aGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCctgc > 2:2330428/1‑150 (MQ=255) ggacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggctccagcaccgattcaaagccataccgcatcccaatgtggatagtccctgatacttctgaccaatccagccctcaagggattggcaacaat < 2:1728598‑M1/150‑149 (MQ=255) ggacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggctccagcaccgattcaaagccataccgcatcccaatgtggatagtccctgatacttctgaccaatccagccctcaagggattggcaacaat > 1:857821‑M1/1‑2 (MQ=255) ggacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggctccagcaccgattcaaagccataccgcatcccaatgtggatagtccctgatacttctga > 1:1945694‑M1/1‑2 (MQ=255) gCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGc < 2:2333280/105‑1 (MQ=255) gCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGc > 1:2333280/1‑105 (MQ=255) gCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCCTGCTGa > 2:206853/1‑150 (MQ=255) | GAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCCTGCTGA > NC_002947/5903693‑5903991 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |