New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 5981424 = | 78 (0.840) | 5 (0.060) | 5/238 | NT | 6.4% | coding (2013/5049 nt) | PP_5242 | GAF domain‑containing sensor histidine kinase |
? | NC_002947 | 5981454 = | 73 (0.820) | coding (2043/5049 nt) | PP_5242 | GAF domain‑containing sensor histidine kinase |
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
TGCGATGAACACCTGCTTCGGCAAGTGCTCGCCCAACCGCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAG‑GCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGT > NC_002947/5981275‑5981572 | tGCGATGAACACCTGCTTCGGCAAGTGCTCGCCCAACCGCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGccc < 2:1800531/150‑1 (MQ=255) cGATGAACACCTGCTTCGGCAAGTGCTCGCCCAACCGCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACTGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGt < 2:2158791/150‑1 (MQ=255) gcggcttcgcgtaaaagctgcaggaacgcttcgcagtcatccgctgcaaacccgcaggggctggcgcgttgtagctggctggcgagctcgaacaacacctcgtgcgttcgccctggccaagcctggcgcatggccagggcgataCGTGCa > 1:2223546‑M1/145‑150 (MQ=255) acacCTGCTTCGGCAAGTGCTCGCCCAACCGCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑Ca > 1:2410235/1‑150 (MQ=255) cTGCTTCGGCAAGTGCTCGCCCAACCGCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAgcgc > 1:2053024/1‑150 (MQ=255) ttCGGCAAGTGCTCGCCCAACCGCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCt > 2:1884522/1‑150 (MQ=255) gTGCTCGCCCAACCGCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCtgcat < 2:1431611/150‑1 (MQ=255) tGCTCGCCCAACCGCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCtgcatg > 1:97286/1‑150 (MQ=255) cTCGCCCAACCGCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCtgcatgca < 2:1090363/150‑1 (MQ=255) cTCGCCCAACCGCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCtgcatgca > 2:2234341/1‑150 (MQ=255) tCGCCCAACCGCCAGGCGAACCCTTGAGAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCAc < 2:145339/150‑1 (MQ=255) tCGCCCAACCGCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCAc < 2:214494/150‑1 (MQ=255) tCGCCCAACCGCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCAc < 1:507479/150‑1 (MQ=255) gCCCAACCGCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCg < 1:686235/138‑1 (MQ=255) gCCCAACCGCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCg > 2:686235/1‑138 (MQ=255) gCCCAACCGCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGt > 2:1108537/1‑150 (MQ=255) cccAACCGCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTa < 2:2404551/150‑1 (MQ=255) cccAACCGCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTa > 2:35790/1‑150 (MQ=255) ccAACCGCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTAT > 2:839412‑M1/1‑150 (MQ=255) cAACCGCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGCGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATC > 1:2430088‑M1/1‑150 (MQ=255) cAACCGCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATC > 2:486572‑M1/1‑150 (MQ=255) ccGCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCC > 2:231234‑M1/1‑150 (MQ=255) gCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCT < 1:839412‑M1/150‑1 (MQ=255) gCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCT > 1:578904‑M1/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTG > 2:2311534‑M1/1‑150 (MQ=255) cAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGG < 2:696169‑M1/150‑1 (MQ=255) aGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCtgcatg > 1:1264793/1‑134 (MQ=255) aGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCtgcatg < 2:1264793/134‑1 (MQ=255) 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1:2022736/135‑1 (MQ=255) ccGGGTGATGGAAGCCGCTTTCGCGTTCACGCCCGTTCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTAACGCCCTGGCCATGCGCCAG‑GCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGccc < 1:1108537/150‑1 (MQ=255) gggTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAG‑GCTTGGCCAGGGCGAAc < 2:2197406/100‑1 (MQ=255) gTGATGGGGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAG‑GCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGc < 2:2430088/150‑1 (MQ=255) gTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAG‑GCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGc > 1:372083/1‑150 (MQ=255) gATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAG‑GCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCgg < 2:2287517/150‑1 (MQ=255) gAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CCGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAG‑GCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGttt < 1:1540998/150‑1 (MQ=255) gAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAG‑GCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGttt < 2:97286/150‑1 (MQ=255) ggCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAG‑GCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGc < 1:249093/150‑1 (MQ=255) gCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAG‑GCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCa < 1:1297435/150‑1 (MQ=255) ttATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAG‑GCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGa < 1:35790/150‑1 (MQ=255) tGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAG‑GCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGa < 2:899890/150‑1 (MQ=255) ccagggcgataCGTGCATGCAGCGAGGCGCGCTGG‑TGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAG‑GCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCgg < 1:2288627‑M1/123‑1 (MQ=255) ttaCGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAG‑GCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCg > 2:1808265/3‑150 (MQ=255) tCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAG‑GCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCg > 1:1927621/1‑150 (MQ=255) gCCCGTGCAC‑CAGCGTGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGTCCATGCGCCAG‑GCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGc < 2:15219/150‑1 (MQ=255) cccGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAG‑GCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCg < 1:1018846/150‑1 (MQ=255) ccGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAG‑GCTTGGCCAGGGCGAACGCACGa < 2:2005065/76‑1 (MQ=255) ccGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAG‑GCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGt > 1:1359853/1‑150 (MQ=255) | TGCGATGAACACCTGCTTCGGCAAGTGCTCGCCCAACCGCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAG‑GCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGT > NC_002947/5981275‑5981572 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |