New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 1225139 = | 82 (0.880) | 5 (0.060) | 4/240 | NT | 6.1% | coding (292/747 nt) | gltJ | glutamate/aspartate ABC transporter permease |
? | NC_002947 | 1225162 = | 74 (0.830) | coding (269/747 nt) | gltJ | glutamate/aspartate ABC transporter permease |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
TTGGGCAGCGCCTGGATACCGGTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCA‑GTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCGAGGAGCGACCCCAGCAGCAGCGCGATGAT > NC_002947/1225015‑1225310 | ttGGGCAGCGCCTGGATACCGGTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTcc < 1:767316/150‑1 (MQ=255) tcctcggtgtcatgcgtaccgtaccgaaccgcctggtatcgggtatcgccaccgcctacgtggaactgttccgcaacgtgccactgctggtgcaactgttcatctggtacttcctggtaccggaCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTcc > 2:2449405‑M1/125‑150 (MQ=255) gggCAGCGCCTGGATACCGGTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCgg < 2:2253895/150‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCTGGATACCGGTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGt > 1:2114129/1‑150 (MQ=255) gcgcCTGGATACCGGTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCa < 1:1826028/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGGATACCGGTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCa < 1:373313/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGGATACCGGTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCa < 1:127422/150‑1 (MQ=255) cgggATACCGGTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGaa < 2:458366/148‑1 (MQ=255) atgcgtaccgtaccggcccgcctggtatcgggtatcgccaccgcctacgtggaactgttccgcaacgtgccactgctggtgcaactgttcatctggtacttcctggtaccggaCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGaa > 2:2274467‑M1/114‑150 (MQ=255) aTACCGGTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTAc < 1:1072389/150‑1 (MQ=255) tACCGGTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTAcc < 1:1601019/150‑1 (MQ=255) aCCGGTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCa < 2:1530730/150‑1 (MQ=255) gTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCa > 2:1268201/1‑136 (MQ=255) gTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCa < 1:1268201/136‑1 (MQ=255) gCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGCTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGACTGCTGGCACCAGGGCCGTGATCAGGAGGTACCAGATGAACa > 2:1204083/1‑150 (MQ=255) aCTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGt > 1:384331/1‑150 (MQ=255) cTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGtt < 2:151765/150‑1 (MQ=255) gCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCCGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCa < 2:1492603/150‑1 (MQ=255) 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gACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACcagca‑g < 2:2114129/150‑1 (MQ=255) aCGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGATTATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCA‑Gt < 1:1204083/150‑1 (MQ=255) cgcgcgGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCA‑GTGGc < 1:599902/150‑1 (MQ=255) gcggcgGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGAGCAGCGCCGAAGGGGTCGGGTTGCGGACGTGCTAGCACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCACCA‑GTGGCACg > 2:750145/1‑150 (MQ=255) ggTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCA‑GTGGCACGTTGCg < 2:697274/150‑1 (MQ=255) 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gCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCA‑GTGGCACGTTGc < 1:1473188/140‑1 (MQ=255) gCCCAGGAAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTg < 1:406792/120‑1 (MQ=255) gCCCAGGAAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTg > 2:406792/1‑120 (MQ=255) cccAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCA‑GTGGCACGTTGCGGAACAGTTcc < 2:1724399/150‑1 (MQ=255) ggCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCA‑GTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGt < 2:1586148/150‑1 (MQ=255) gCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCA‑GTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTa < 2:430575/150‑1 (MQ=255) 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GCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCA‑GTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCGAGGAGc < 1:1142038‑M1/146‑1 (MQ=255) GCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCA‑GTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCGAGGAGCGAcc < 1:108355‑M1/150‑1 (MQ=255) aaGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCA‑GTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCGAGGAGCGAcccc > 2:644013/1‑150 (MQ=255) aGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCA‑GTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCGAGGAGCGACCCca < 1:228895/150‑1 (MQ=255) gCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCA‑GTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCGAGGAGCGACCCcag < 2:1050189/150‑1 (MQ=255) cTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCA‑GTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCGAGGAGCGACCCcagca < 1:644013/150‑1 (MQ=255) ttCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCA‑GTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCGAGGAGCGACCCcagcag > 2:683995/1‑150 (MQ=255) ttCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCA‑GTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCGAGGAGCGACCCcagcag > 1:37219/1‑150 (MQ=255) ttCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTGGTACCAGCA‑GTGGCTCGTTGCGGAACAGTTACCCACGCCCTCGACCTGTAGCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCGGGGAGCGACGCcagcag > 1:2388343/1‑150 (MQ=255) tGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCA‑GTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCg < 1:1870776/82‑1 (MQ=255) tGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCA‑GTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCg > 2:1870776/1‑82 (MQ=255) tGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCA‑GTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCGAGGAGCGACCCcagcagcag > 2:661363/1‑150 (MQ=255) gcagcaGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCA‑GTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCGAGGAGCGACCCCAGCAGCAgcg > 1:621743/1‑150 (MQ=255) agcagGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCA‑GTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCGAGGAGCGACCCCAGCAGCAGcgcg > 2:1966691/1‑150 (MQ=255) gcaggTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCA‑GTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCGAGGAGCGACCCCAGCAGCAGCGCga < 1:998656‑M2/145‑1 (MQ=255) ggTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCA‑GTGGCACTTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCGAGGAGCGACCCCAGCAGCAGCGCgatga > 1:551091‑M2/3‑150 (MQ=255) gTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCA‑GTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCGAGGAGCGACCCCAGCAGCAGCGCgatgat > 1:51020‑M2/2‑150 (MQ=255) gTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCA‑GTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCGAGGAGCGACCCCAGCAGCAGCGCgatgat > 1:1384825‑M2/2‑150 (MQ=255) gTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCA‑GTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCGAGGAGCGACCCCAGCAGCAGCGCgatgat > 2:1016914‑M2/2‑150 (MQ=255) | TTGGGCAGCGCCTGGATACCGGTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCA‑GTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCGAGGAGCGACCCCAGCAGCAGCGCGATGAT > NC_002947/1225015‑1225310 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |