New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_002947 | = 1722478 | 88 (0.940) | 6 (0.070) | 6/242 | NT | 6.6% | coding (1069/3066 nt) | PP_1517 | RND family transporter |
? | NC_002947 | = 1722503 | 85 (0.940) | coding (1094/3066 nt) | PP_1517 | RND family transporter |
CGGCATGGCGCTGCGCAAGGTTTCGGATCAGCCGGCGGCGGTGAAGGCCGGCGTGGGCGAGTTCGTACAGGTGCTGGTCGAGGCGTTGGTCATTGTGCTGCTGGTGAGCTTCTTCTCGCTGGGCCTGCGCACTGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTGCCGCCATGCACTACTTCGGCATCGGCCTGCACAAGATTTCCCTTGGCGCGCTGGTGCTGGCCCTGGGCTTGCTGGTGGACGACGCGATCATTGCCGTGGAGATGATGGCGAT > NC_002947/1722354‑1722647 | cGGCATGGCGCTGCGCAAGGTTTCGGATCAGCCGGCGGCGGTGAAGGCCGGCGTGGGCGAGTTCGTACAGGTGCTGGTCGAGGCGTTGGTCATTGTGCTGCTGGTGAGCTTCTTCTCGCTGGGCCTGCGCACTGGCCTGGTGGTGGCGCt < 1:2176175/150‑1 (MQ=255) cGGCATGGCGCTGCGCAAGGTTTCGGATCAGCCGGCGGCGGTGAAGGCCGGCGTGGGCGAGTTCGTACAGGTGCTGGTCGAGGCGTTGGTCATTGTGCTGCTGGTGAGCTTCTTCTCGCTGGGCCTGCGCACTGGCCTGGTGGTGGCGCt < 1:1704260/150‑1 (MQ=255) ggCATGGCGCTGCGCAAGGTTTCGGATCAGCCGGCGGCGGTGAAGGCCGGCGTGGGCGAGTTCGTACAGGTGCTGGTCGAGGCGTTGGTCATTGTGCTGCTGGTGAGCTTCTTCTCGCTGGGCCTGCGCACTGGCCTGGTGGTGGTGCTg < 2:617012‑M2/150‑2 (MQ=255) gCATGGCGCTGCGCAAGGTTTCGGATCAGCCGGCGGCGGTGAAGGCCGGCGTGGGCGAGTTCGTACAGGTGCTGGTCGAGGCGTTGGTCATTGTGCTGCTGGTGAGCTTCTTCTCGCTGGGCCTGCGCACTGGCCTGGTGGTGGCGCTgg < 2:263878‑M2/150‑3 (MQ=255) gCATGGCGCTGCGCAAGGTTTCGGATCAGCCGGCGGCGGTGAAGGCCGGCGTGGGCGAGTTCGTACAGGTGCTGGTCGAGGCGTTGGTCATTGTGCTGCTGGTGAGCTTCTTCTCGCTGGGCCTGCGCACTGGCCTGGTGGTGGCGCTgg > 1:2036367‑M2/1‑148 (MQ=255) gcTGCGCAAGGTTTCGGATCAGCCGGCGGCGGTGAAGGCCGGCGTGGGCGAGTTCGTACAGGTGCTGGTCGAGGCGTTGGTCATTGTGCTGCTGGTGAGCTTCTTCTCGCTGGGCCTGCGCACTGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTcc > 1:538358/1‑150 (MQ=255) gcTGCGCAAGGTTTCGGATCAGCCGGCGGCGGTGAAGGCCGGCGTGGGCGAGTTCGTACAGGTGCTGGTCGAGGCGTTGGTCATTGTGCTGCTGGTGAGCTTCTTCTCGCTGGGCCTGCGCACTGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTcc > 2:1858844/1‑150 (MQ=255) tGCGCAAGGTTTCGGATCAGCCGGCGGCGGTGAAGGCCGGCGTGGGCGCGTACGTACAGGACCTGGTCGAGGCGTTGGTCATGTTGCCGCTGGGGAGCTGCTTCTCGCGGGGCCTGCGCACTGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGc < 2:2101158/150‑1 (MQ=255) aaGGTTTCGGATCAGCCGGCGGCGGTGAAGGCCGGCGTGGGCGAGTTCGTACAGGTGCTGGTCGAGGCGTTGGTCATTGTGCTGCTGGTGAGCTTCTTCTCGCTGGGCCTGCGCACTGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGgtg > 1:1149166/1‑150 (MQ=255) ggTTTCGGATCAGCCGGCGGCGGTGAAGGCCGGCGTGGGCGAGTTCGTACAGGTGCTGGTCGAGGCGTTGGTCATTGTGCTGCTGGTGAGCTTCTTCTCGCTGGGCCTGCGCACTGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGtt < 2:2147093/150‑1 (MQ=255) aTCAGCCGGCGGCGGTGAAGGCCGGCGTGGGCTAGTTCGTACAGGTGCTGGTCGAGGCGTTGGTCATTGTGCTGCTGGTGAGCTTCTTCTCGCTGGGCCTGCGCACTGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGa < 1:184857/150‑1 (MQ=255) aTCAGCCGGCGGCGGTGAAGGCCGGCGTGGGCGAGTTCGTACAGGTGATTTGCCTGCCGTTGGTCATTGTGCTGCTGGTGAGCTTCTTCTCGCTGGGCCTGCGCACTGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGa < 2:665688/150‑1 (MQ=255) aGCCGGCGGCGGTGAAGGCCGGCGTGGGCGAGTTCGTACAGGTGCTGGTCGAGGCGTTGGTCATTGTGCTGCTGGTGAGCTTCTTCTCGCTGGGCCATCTCACTGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCt < 1:768800/150‑1 (MQ=255) ccggcggTGAAGGCCGGCGTGGGCGAGTTCGTACAGGTGCTGGTCGAGGCGGTGGTCATTGTGCTGCTGGTGAGCTTCTTCTCGCTGGGCCTGCGCACTGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTgcc > 2:1912672/2‑150 (MQ=255) ggcggTGAAGGCCGGCGTGGGCGAGTTCGTACAGGTGCTGGTCGAGGCGTTGGTCATTGTGCTGCTGGTGAGCTTCTTCTCGCTGGGCCTGCGCACTGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTgccgc > 1:1123013/1‑150 (MQ=255) ggCCGGCGTGGGCGAGTTCGTACAGGTGCTGGTCGAGGCGTTGGTCATTGTGCTGCTGGTGAGCTTCTTCTCGCTGGGCCTGCGCACTGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTGCCGCCATGCacta > 2:2225455/1‑150 (MQ=255) cGTGGGCGAGTTCGTACAGGTGCTGGTCGAGGCGTTGGTCATTGTGCTGCTGGTGAGCTTCTTCTCGCTGGGCCTGCGCACTGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTGCCGCCATGCACTACTTCgg < 2:2047144/150‑1 (MQ=255) gCGAGTTCGTACAGGTGCTGGTCGAGGCGTTGGTCATTGTGCTGCTGGTGAGCTTCTTCTCGCTGGGCCTGCGCACTGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTGCCGCCATGCACTACTTCGGCATCg < 1:1302430/150‑1 (MQ=255) 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cAGGTGCTGGTCGAGGCGTTGGTCATTGTGCTGCTGGTGAGCTTCTTCTCGCTGGGCCTGCGCACTGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTGCCGCCATGCACTACTTCGGCATCGGCCTGCACAAg > 1:48610/1‑150 (MQ=255) aGGTGCTGGTCGAGGCGTTGGTCATTGTGCTGCTGGTGAGCTTCTTCTCGCTGGGCCTGCGCACTGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTGCCGCCATGCACTACTTCGGCATCGGCCTGCACAAGa > 1:932962/1‑150 (MQ=255) aGGTGCTGGTCGAGGCGTTGGTCATTGTGCTGCTGGTGAGCTTCTTCTCGCTGGGCCTGCGCACTGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTGCCGCCATGCACTACTTCGGCATCGGCCTGCACAAGa > 2:2224148/1‑150 (MQ=255) aGGTGCTGGTCGAGGCGTTGGTCATTGTGCTGCTGGTGAGCTTCTTCTCGCTGGGCCTGCGCACTGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTGCCGCCATGCACTACTTCGGCATCGGCCTGCACAAGa < 2:2442977/150‑1 (MQ=255) gTGCTGGTCGAGGCGTTGGTCATTGTGCTGCTGGTGAGCTTCTTCTCGCTGGGCCTGCGCACTGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTGCCGCCATGCACTACTTCGGCATCGGCCTGcaca > 2:463504/1‑145 (MQ=255) 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cTGCGCACTGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTGCCGCCATGCACTACTTCGGCATCGGCCTGCACAAGATTTCCCTTGGCGCGCTGGTGCTGGCCCTGGGCTTGCTGGTGGACGACGCGATCAtt > 1:1915268/1‑150 (MQ=255) tGCGCACTGGCCTGGTGGTGGCGCTggcccagcgagaagaagctcaccagcagcacaatgac < 2:1530146‑M2/62‑38 (MQ=255) tGCGCACTGGCCTGGTGGTGGCGCTggcccagcgagaagaagctcaccagcagcacaatgac > 1:1530146‑M2/1‑25 (MQ=255) gcgcACTGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTGCCGCCATGCACTACTTCGGCATCGGCCTGCACAAGATTTCCCTTGGCGCGCTGGTGCTGGCCCTGGGCTTGCTGGTGGACGACGCGATCATTGc < 1:1429108/150‑1 (MQ=255) gcgcACTGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTGCCGCCATGCACTACTTCGGCATCGGCCTGCACAAGATTTCCCTTGGCGCGCTGGTGCTGGCCCTGGGCTTGCTGGTGGACGACGCGATCATTGc < 1:344513/150‑1 (MQ=255) aCTGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTGCCGCCATGCACTACTTCGGCATCGGCCTGCACAAGATTTCCCTTGGCGCGCTGGTGCTGGCCCTGGGCTTGCTGGTGGACGACGCGATCATTGCCGTg > 1:977986/1‑150 (MQ=255) aCTGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTGCCGCCATGCACTACTTCGGCATCGGCCTGCACAAGATTTCCCTTGGCGCGCTGGTGCTGGCCCTGGGCTTGCTGGTGGACGACGCGATCATTGCCGTg < 2:1432993/150‑1 (MQ=255) tGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTGCCGCCATGCACTACTTCGGCATCGGCCTGCACAAGATTTCCCTTGGCGCGCTGGTGCTGGCCCTGGGCTTGCtggt < 1:219365/126‑1 (MQ=255) tGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTGCCGCCATGCACTACTTCGGCATCGGCCTGCACAAGATTTCCCTTGGCGCGCTGGTGCTGGCCCTGGGCTTGCtggt > 2:219365/1‑126 (MQ=255) tGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTGCCGCCATGCACTACTTCGGCATCGGCCTGCACAAGATTTCCCTTGGCGCGCTGGTGCTGGCCCTGGGCTTGCTGGTGGACGACGCGATCATTGCCGTGga > 1:270561/1‑150 (MQ=255) tGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTGCCGCCATGCACTACTTCGGCATCGGCCTGCACAAGATTTCCCTTGGCGCGCTGGTGCTGGCCCTGGGCTTGCTGGTGGACGACGCGATCATTGCCGTGga < 1:523197/150‑1 (MQ=255) gCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTGCCGCCATGCACTACTTCGGCATCGGCCTGCACAAGATTTCCCTTGGCGCGCTGGTGCTGGCCCTGGGCTTGCTGGTGGACGACGCGATCATTGCCGTGgaga > 2:1362557/1‑150 (MQ=255) gCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTGCCGCCATGCACTACTTCGGCAGCGGCCTGCACAAGATTTCCCTTGGCGCGCTAGTGCTGGCCCTGGGCTTGCTGGTGGACGACGCGATCATTGCAGTGgcga > 2:1227667/1‑150 (MQ=255) cTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTGCCGCCATGCACTACTTCGGCATCGGCCTGCACAAGATTTCCCTTGGCGCGCTGGTGCTGGCCCTGGGCTTGCTGGTGGACGACGCGATCATTGCCGTGGAgatg > 1:802442/1‑150 (MQ=255) gtggtggCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTGCCGCCATGCACTACTTCGGCATCGGCCTGCACAAGATTTCCCTTGGCGCGCTGGTGCTGGCCCTGGGCTTGCTGGTGGACGACGCGATCATTGCCGTGGAGatgatg < 1:1912672/150‑1 (MQ=255) gtggtccCGCTGGCGATACAGCGTGTGTTGGCCATGACCTTTGCCGCCATGCACTACGTCGGCATCGGCCTGCACAAGATTTCCCTTGGCGCGCTGGTGCTGGCCCTGGGCTTGCTGGTGGACGACGCGATCATCGCCGTGGAgctgagt > 2:147034/1‑148 (MQ=255) ggtggCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTAACTCTCCATGCACTACTTCGGCATCGGCCTGCACAAGATTTCCCTTGGCGCGCTGGTGCTGGCCCTGGGCTTGCTGGTGGACGACGCGATCATTGCCGTGGAGATGATGGc < 1:1205457/150‑1 (MQ=255) tggCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTGCCGCCATGCACTACTTCGGCATCGGCCTGCACAAGATTTCCCTTGGCGCGCTGGTGCTGGCCCTGGGCTTGCTGGTGGACGACGCGATCATTGCCGTGGAGATGATGGCGa < 1:913552/150‑1 (MQ=255) tggCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTGCCGCCATGCACTACTTCGGCATCGGCCTGCACAAGATTTCCCTTGGCGCGCTGGTGCTGGCCCTGGGCTTGCTGGTGGACGACGCGATCATTGCCGTGGAGATGATGGCGa < 2:1991607/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTGCCGCCATGCACTACTTCGGCATCGGCCTGCACAAGATTTCCCTTGGCGCGCTGGTGCTGGCCCTGGGCTTGCTGGTGGACGACGCGATCATTGCCGTGGAGATGATGGCGAt < 2:1739621/150‑1 (MQ=255) | CGGCATGGCGCTGCGCAAGGTTTCGGATCAGCCGGCGGCGGTGAAGGCCGGCGTGGGCGAGTTCGTACAGGTGCTGGTCGAGGCGTTGGTCATTGTGCTGCTGGTGAGCTTCTTCTCGCTGGGCCTGCGCACTGGCCTGGTGGTGGCGCTGGCCATTCCGCTGGTGTTGGCCATGACCTTTGCCGCCATGCACTACTTCGGCATCGGCCTGCACAAGATTTCCCTTGGCGCGCTGGTGCTGGCCCTGGGCTTGCTGGTGGACGACGCGATCATTGCCGTGGAGATGATGGCGAT > NC_002947/1722354‑1722647 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |