New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 1798196 = | 78 (0.840) | 12 (0.140) | 9/238 | NT | 14.0% | coding (77/1128 nt) | lpxB | lipid‑A‑disaccharide synthase |
? | NC_002947 | 1798247 = | 73 (0.820) | coding (128/1128 nt) | lpxB | lipid‑A‑disaccharide synthase |
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
CTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCGAAGAAAAGCCCGACGTATTCATC > NC_002947/1798099‑1798395 | cTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCACCCCGACGTGCGTTTCCTCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATg > 2:2254735/1‑150 (MQ=255) cTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATg > 1:1429226/1‑150 (MQ=255) gcttgagcagttcgcgcaggcgccccagtacctcgactagccccatgacggccaggcgctccatggggaaataggattgcaggccctcggcctcccTCAAGGCGC‑GCCACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATgg > 1:334724‑M1/97‑150 (MQ=255) ttgaccagttcgcgcaggcgccccagtacctcgactagccccatgacggccaggcgctctatggggaaataggattgcaggccctcggcctccgtcgaggggccgccaaccccgatgaaacgcacgtcgtggtggcgcgccttgatggca > 2:367440‑M2/146‑148 (MQ=255) cgGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAgg < 2:2218026/150‑1 (MQ=255) tCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAg < 2:1049855/150‑1 (MQ=255) aCGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAggg > 1:2063155/1‑150 (MQ=255) gcTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTg > 2:1356124/1‑150 (MQ=255) gcTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTg < 2:781669/150‑1 (MQ=255) tGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCt < 2:35057/150‑1 (MQ=255) gCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTAt < 2:2063155/150‑1 (MQ=255) cccAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTGGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGCTGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTAtt > 2:86304/1‑150 (MQ=255) ccAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTAttt > 1:1930805/1‑150 (MQ=255) ccAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTAttt > 1:2370748/1‑150 (MQ=255) tGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATg < 1:1288857/150‑1 (MQ=255) tGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATg < 1:2290347/150‑1 (MQ=255) gTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAgg < 1:563055/118‑1 (MQ=255) gTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAgg > 2:563055/1‑118 (MQ=255) gTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCt > 2:691652/1‑128 (MQ=255) 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ccaaccccgatgaaacgcacgtcggggtggcgcgccttgaTGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTgg < 1:1313665‑M2/72‑1 (MQ=255) ccaaccccgatgaaacgcacgtcggggtggcgcgccttgaTGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTgg > 2:1313665‑M2/41‑112 (MQ=255) cACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGctgctg < 2:782126/150‑1 (MQ=255) aCCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTc < 1:697334/89‑1 (MQ=255) aCCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTc > 2:697334/1‑89 (MQ=255) accccgatgaaacgcacgtcggggtggcgcgccttgaGGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGCGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATc < 2:334724‑M2/113‑1 (MQ=255) ccGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATcc < 1:359142/150‑1 (MQ=255) aCGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGa < 2:326920/150‑1 (MQ=255) gTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATg < 1:1852806/84‑1 (MQ=255) gTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATg > 2:1852806/1‑84 (MQ=255) tttCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGAt > 2:640166/1‑150 (MQ=255) aTCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCgaa > 2:2191622/1‑150 (MQ=255) aTCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCgaa < 1:1195503/150‑1 (MQ=255) tCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCgaag > 1:910851/1‑150 (MQ=255) gggTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAg > 1:2281607/1‑83 (MQ=255) gggTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAg < 2:2281607/83‑1 (MQ=255) ggcCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCGAAGAAAAGCCCGAc > 2:1905541/1‑150 (MQ=255) gcCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGaa < 2:624305/95‑1 (MQ=255) gcCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGaa > 1:624305/1‑95 (MQ=255) cccTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGAAATCCACAAACCCCAAGGATTGCCTGGCCTTGTTGGGGCTAGTCTCGGTCATCGGCATCATGTGCGAAGGGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCGAAGAAAAGCCCGACGTa > 1:2388124/1‑150 (MQ=255) cttgaTGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAgctgc < 2:639104‑M2/108‑1 (MQ=255) cttgaTGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAgctgc > 1:639104‑M2/6‑113 (MQ=255) aTGGAGGACGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGAGTGCGCGAACTGCTCCTGCAACCTGCTCAACTGATCCAGACCCTGATCGAAGAAAAGCCCGACGTATTCATc < 1:2254735‑M2/149‑1 (MQ=255) | CTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCGAAGAAAAGCCCGACGTATTCATC > NC_002947/1798099‑1798395 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |