New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 2281779 = | 89 (0.950) | 6 (0.070) | 5/240 | NT | 6.7% | coding (558/894 nt) | PP_2009 | 1‑aminocyclopropane‑1‑carboxylate deaminase |
? | NC_002947 | 2281796 = | 81 (0.900) | coding (575/894 nt) | PP_2009 | 1‑aminocyclopropane‑1‑carboxylate deaminase |
AGGGGGCGGCGGGCTGGCCGGTGCGCAGGGCTGCGCACTGATCATGCAGCAGGCGCGCGCGCAGATCGCGGGATTGGGCTGGTCAGACCATGACGCCTGGTGGCTGGCTGCCGGAACGGGGACTACCTTGGCCGGCCTTGTACTGGCCGAG‑GCGGGTGCACATGCCGTGCATGGCGCGCTGGCAGTGCCCAGGGATCATGGGGTGCCAGAGACGGTGGCAGCACTGGCCGGCACGCACGGCTACCAGCTACACGACGCCTGCCGTGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTACT > NC_002947/2281647‑2281943 | attttccgaaaccgccacggcaggcgtcgtgtagctggtagccgtgcgtgccggccagtgctgccaccgtctctggcaccccatgatccctgggcactgccagcgcgccatgcacggcatgtgcacccgcctCGGCCTTGTACTGGCCGa > 2:771187‑M1/133‑150 (MQ=255) ggggCGGCGGGCTGGCCGGTGCGCAGGGATCCGCCCTGCTCCTGCAGCAGCCGCGCCCGCAGAGGGCGGGATTGGGCTGGTCAGACCATGACGCCTGGTTGCTGGCTGCCGGAACGGGGACTACCTTGGCCGGCCTTGTACTGGCCGAg‑g < 2:1104698/150‑1 (MQ=255) gcggcgGGCTGGCCGGTGCGCAGGGCTGCGCACTGATCATGCAGCAGGCGCGCGCGCAGATCGCGGGATTGGGCTGGTCAGACCATGACGCCTGGTGGCTGGCTGCCGGAACGGGGACTACCTTGGCCGGCCTTGTACTGGCCGAG‑GCgg < 2:2011397/150‑1 (MQ=255) 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gCCGGTGCGCAGGGCTGCGCACTGATCATGCAGCAGGCGCGCGCGCAGATCGCGGGATTGGGCTGGTCAGACCATGACGCCTGGTGGCTGGCTGCCGGAACGGGGACTACCTTGGCCGGCCTTGTACTGGCCGAG‑GCGGGTGCACATGcc > 1:15439/1‑150 (MQ=255) ccGGTGCGCAGGGCTGCGCACTGATCATGCAGCAGGCGCGCGCGCAGATCGCGGGATTGGGCTGGTCAGACCATGACGCCTGGTGGCTGGCTGCCGGAACGGGGACTACCTTGGCCGGCCTTGTACTGGCCGAG‑GCGGGTGCACATGCCg > 1:444573/1‑150 (MQ=255) cGGTGCGCAGGGCTGCGGACTGATCATGCAGCAGGCGCGCGCGCAGATCGCGGGATTGGGCGGGTCAGACCATGACGCCTGGTGGCTGGCTGCCGGAACGGGGACTACCTTGGCCGGCCTTGTACTGGCCGAG‑GCGGGTGCACATGCCGt > 1:1909396/1‑150 (MQ=255) cGGTGCGCAGGGCTGCGCACTGATCATGCAGCAGGCGCGCGCGCAGATCGCGGGATTGGGCTGGTCAGACCATGACGCCTGGTGGCTGGCTGCCGGAACGGGGACTACCTTGGCCGGCCTTGTACTGGCCGAG‑GCGGGTGCACATGCCGt < 2:184451/150‑1 (MQ=255) cGGTGCGCAGGGCTGCGCACTGATCATGCAGCAGGCGCGCGCGCAGATCGCGGGATTGGGCTGGTCAGACCATGACGCCTGGTGGCTGGCTGCAGGAGCAATGTTGACCTTGGCCGGCCTTGTACTGGCCGAG‑GCGGGCGCACATGCCGt > 2:1638556/1‑150 (MQ=255) 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2:1876265/100‑1 (MQ=255) ggAACGGGGACTACCTTGGCCGGCCTTGTACTGGCCGAG‑GCGGGTGCACATGCCGTGCATGGCGCGCTGGCAGTGCCCAGGGATCATGGGGTGCCAgaga > 1:1876265/1‑100 (MQ=255) gAACGGGGACTACCTTGGCCGGCCTTGTACTGGCCGAG‑GCGGGTGCACATGCCGTGCATGGCGCGCTGGCAGTGCCCAGGGATCATGGGGTGCCAGAGACGGTGGCAGCACTGGCCGGCACGCACGGCTACCAGCTACACGACGCCTGcc > 2:429732/1‑150 (MQ=255) ggggACTACCTTGGCCGGCCTTGTACTGGCCGAG‑GCGGGTGCACATGCCGTGCATGGCGCGCTGGCAGTGCCCAGGGATCATGGGGTGCCAGAGACGGTGGCAGCACTGGCCGGCACGCACGGCTACCAGCTACACGACGCCTGCCGTgg < 1:594252/150‑1 (MQ=255) gggACTACCTTGGCCGGCCTTGTACTGGCCGAG‑GCGGGTGCACATGCCGTGCATGGCGCGCTGGCAGTGCCCAGGGATCATGGGGTGCCAGAGACGGTGGCAGCATTGGCCGGCACGCACGGCTACCAGCTACACGATGCCTGCCGTGGc < 2:1909396/150‑1 (MQ=255) tACCTTGGCCGGCCTTGTACTGGCCGAG‑GCGGGTGCACATGCCGTGCATGGCGCGCTGGCAGTGCCCAGGGATCATGGGGTGCCAGAGACGGTGGCAGCACTGGCCGGCACGCACGGCTAcc > 2:1410333/1‑122 (MQ=255) tACCTTGGCCGGCCTTGTACTGGCCGAG‑GCGGGTGCACATGCCGTGCATGGCGCGCTGGCAGTGCCCAGGGATCATGGGGTGCCAGAGACGGTGGCAGCACTGGCCGGCACGCACGGCTAcc < 1:1410333/122‑1 (MQ=255) aCCTTGGCCGGCCTTGTACTGGCCGAG‑GCGGGTGCACATGCCGTGCATGGCGCGCTGGCAGTGCCCAGGGATCATGGGGTGCCAGAGACGGTGGCAGCACTGGCCGGCACGCACGGCTACCAGCTACACGACGCCTGCCGTGGCGGTTTc < 2:538856/150‑1 (MQ=255) ccTTGGCCGGCCTTGTACTGGCCGAG‑GCGGGTGCACATGCCGTGCATGGCGCGCTGGCAGTGCCCAGGGATCATGGGGTGCCAGAGACGGTGGCAGCACTGGCCGGCACGCACGGCTACCAGCTACACGACGCCTGCCGTGGCGGTTTCg > 1:2116959/1‑150 (MQ=255) ccgcctcggccagtacaaggccgAG‑GCGGGTGCACATGCCGTGCATGGCGCGCTGGCAGTGCCCAGGGATCATGGGGTGc > 1:448372‑M2/24‑80 (MQ=255) ccgcctcggccagtacaaggccgAG‑GCGGGTGCACATGCCGTGCATGGCGCGCTGGCAGTGCCCAGGGATCATGGGGTGc < 2:448372‑M2/57‑1 (MQ=255) ccgcctcggccagtacaaggccgAG‑GCGGGTGCACATGCCGTGCATGGCGCGCTGGCAGTGCCCAGGGATCATGGGGTGCCAGAGACGGTGGCAGCACTGGCCGGCACGCACGGCTACCAGCTACACGACGCCTGCCGTGGCGGTTTCgg > 1:2183575‑M2/24‑150 (MQ=255) gcctcggccagtacaaggccgAG‑GCGGGTGCACATGCCGTGCATGGCGCGCTGGCAGTGCCCAGGGATCATGGGGTGcc > 2:1082318‑M2/22‑79 (MQ=255) gcctcggccagtacaaggccgAG‑GCGGGTGCACATGCCGTGCATGGCGCGCTGGCAGTGCCCAGGGATCATGGGGTGcc < 1:1082318‑M2/58‑1 (MQ=255) tcggccagtacaaggccgAG‑GCGGGTGCACATGCCGTGCATGGCGCGCTGGCAGTGCCCAGGGATCATGGGGTGCCAGAGACGGTGGCAGCACTGGCCGGCACGCACGGCTACCAGCTACACGACGCCTGCCGTGGCGGTTTCGGAAAAt > 2:771187‑M2/19‑150 (MQ=255) ccggccTTGTACTGGCCGAG‑GCGGGTGCACATGCCGTGCATGGCGCGCTGGCAGTGCCCAGGGATCATGGGGTGCCAGAGACGGTGGCAGCACTGGCCGGCACGCACGGCTACCAGCTACACGACGCCTGCCGTGGCGGTTTCGGAAAAt > 1:1470539/1‑150 (MQ=255) CGGCCTTGTACTGGCCGAG‑GCGGGTGCACATGCCGTGCATGGCGCACTGGCAGTGCCCAGGGATCATGGGGTGCCAGAGACGGTGGCAGCACTGGCCGGCACGCACGGCTACCAGCTACACGACGCCt > 1:408813‑M1/1‑128 (MQ=255) CGGCCTTGTACTGGCCGAG‑GCGGGTGCACATGCCGTGCATGGCGCACTGGCAGTGCCCAGGGATCATGGGGTGCCAGAGACGGTGGCAGCACTGGCCGGCACGCACGGCTACCAGCTACACGACGCCt < 2:408813‑M1/128‑1 (MQ=255) tGTACTGGCCGAG‑GCGGGTGCACATGCCGTGCATGGCGCGCTGGCAGTGCCCAGGGATCATGGGGTGCCAGAGACGGTGGCAGCACTGGCCGGCACGCACGGCTACCAGCTACACGACGCCTGCCGTGGCGGTTTCGGAAAATTcgacga < 2:1025901/150‑1 (MQ=255) gTACTGGCCGAG‑GCGGGTGCACATGCCGTGCATGGCGCGCTGGCAGTGCCCAGGGATCATGGGGTGCCAGAGACGGTGGCAGCACTGGCCGGCACGCACGGCTACCAGCTACACGACGCCTGCCGTGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGAt < 2:232001/150‑1 (MQ=255) cTGGCCGAG‑GCGGGTGCACATGCCGTGCATGGCGCGCTGGCAGTGCCCAGGGAAAATGGAGTTCCAGAGACGGTGGCAGCACTGGCCGGCACGCACGGCTACCAGCTACACGACGCCTGCCGTGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAg > 2:1521866/1‑150 (MQ=255) ccgAG‑GCGGGTGCACATGCCGTGCATGGCGCGCTGGCAGTGCCCAGGGATCATGGGGTGCCAGAGACGGTGGCAGCACTGGCCGGCACGCACGGCTACCAGCTACACGACGCCTGCCGTGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTAc > 1:1559713‑M2/4‑150 (MQ=255) cgAG‑GCGGGTGCACATGCCGTGCATGGCGCGCTGGCAGTGCCCAGGGATCATGGGGTGCCAGAGACGGTGGCAGCACTGGCCGGCACGCACGGCTACCAGCTACAAGACGCCTGCCGTGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTACt < 2:1047104‑M2/148‑1 (MQ=255) | AGGGGGCGGCGGGCTGGCCGGTGCGCAGGGCTGCGCACTGATCATGCAGCAGGCGCGCGCGCAGATCGCGGGATTGGGCTGGTCAGACCATGACGCCTGGTGGCTGGCTGCCGGAACGGGGACTACCTTGGCCGGCCTTGTACTGGCCGAG‑GCGGGTGCACATGCCGTGCATGGCGCGCTGGCAGTGCCCAGGGATCATGGGGTGCCAGAGACGGTGGCAGCACTGGCCGGCACGCACGGCTACCAGCTACACGACGCCTGCCGTGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTACT > NC_002947/2281647‑2281943 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |