New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 4398703 = | 80 (0.860) | 6 (0.070) | 6/236 | NT | 7.2% | coding (198/1314 nt) | PP_3877 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 4398746 = | 78 (0.890) | coding (155/1314 nt) | PP_3877 | hypothetical protein |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
CATCTGCGCCATGTTGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGCAATTGAGTTACGA > NC_002947/4398598‑4398893 | cATCTGCGCCATGTTGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCCCTTCCGCTTCGGCGCGCGCGAGttt > 2:21750/1‑150 (MQ=255) tCTGCGCCATGTTGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTCTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTtct < 1:21750/150‑1 (MQ=255) tGCGCCATGTTGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGTCGGGCGGGCCCTTCAGGCCTGGAGGAGGTTCATGCACGGAGACCGCACTCGCGGTCTCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTcc < 2:268322/150‑1 (MQ=255) tGCGCCATGTTGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCCCTGATGCTCCAGAGCGCTCCGTTCATTCCTTGAGCACTTTCATTCACTTTGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTcc < 2:268496/150‑1 (MQ=255) ccATGTTGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGTGCGCGCGAGTTTCTCCGTCa > 1:1252397/1‑150 (MQ=255) ccATGTTGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCa < 2:2027268/150‑1 (MQ=255) ctggcccagctggaggccgctggtactgcgctcagcgcggagcagctctcacagttcgagcagctcagcacccagttcaaccagctgacggagaaACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTtctc > 2:711486‑M1/96‑143 (MQ=255) ctggcccagctggaggccgctggtactgcgctcagcgcggagcagctctcacagttcgagcagctcagcacccagttcaaccagctgacggagaaACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTtctc < 1:711486‑M1/48‑1 (MQ=255) ggtGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTg < 2:727738/148‑1 (MQ=255) ttGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGTGCGGGCCGTTCAGGCGTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTgg > 2:1945752/1‑150 (MQ=255) ttGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTgg > 2:534735/1‑150 (MQ=255) cagctggaggccgctggtactgcgctcagcgcggagcagctctcacagttcgagcagctcagcacccagttcaaccagctgacggagaaACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCACTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTg > 2:1975120‑M1/90‑150 (MQ=255) aCCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGaa > 1:1419931/1‑150 (MQ=255) cccGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAAc > 1:2281869/1‑150 (MQ=255) ccGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGCCCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCTCGCGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACt > 1:266360/1‑150 (MQ=255) ccGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACt > 1:1767402/1‑150 (MQ=255) tctccGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTggg < 1:514973/147‑1 (MQ=255) gCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTggg < 2:753581/150‑1 (MQ=255) 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gggCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCGCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACtgt < 1:1828625/150‑1 (MQ=255) gggCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGGTCATGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACtgt < 1:405/150‑1 (MQ=255) gCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTTAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCCTCAGCTGGTTGAACTTGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTga > 2:493158/1‑150 (MQ=255) ccGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTgag > 1:278052/1‑150 (MQ=255) gCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGAAAACGCCTTTCTGCGCGCGCGAGTTTCTCCGCAAGATCGTTGGACGGGTTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGagag > 1:1002305/1‑150 (MQ=255) 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tcattcaCGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTgg < 2:639534/150‑1 (MQ=255) ttcaCGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAgcg < 2:255687/124‑1 (MQ=255) ttcaCGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAgcg > 1:255687/1‑124 (MQ=255) ttcaCGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGcc > 2:1922482/1‑150 (MQ=255) ggACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACt < 2:1193485/150‑1 (MQ=255) ggACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACt > 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gcgccgaagcggccgagcgtatggcgaccgcgagtTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGAc < 1:390989‑M2/109‑1 (MQ=255) ccATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAg > 1:606823/1‑150 (MQ=255) aTACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGCACCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTg < 1:1243452/150‑1 (MQ=255) tACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTgg > 2:669290/1‑150 (MQ=255) tACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTgg > 2:9100/1‑150 (MQ=255) aCGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGgc < 2:836462/150‑1 (MQ=255) aCGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGgc < 2:1002305/150‑1 (MQ=255) gCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGgcgc > 2:2319248/1‑150 (MQ=255) tCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAANTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCACCCCGCT‑GAGCGCAGTCCCAGCGACCTCCAGCTGGGCCACGGACACGAGCTGCCCGTTGGTAGTGGCGCGt > 1:603843/1‑150 (MQ=255) ggCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTc < 1:1058159/150‑1 (MQ=255) cGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCt < 1:139544/150‑1 (MQ=255) cGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCt < 2:314077/150‑1 (MQ=255) gCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTa > 2:588961/1‑150 (MQ=255) ttCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGtt < 2:1490539/143‑1 (MQ=255) ttCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGtt > 1:1490539/1‑143 (MQ=255) ttCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACg < 1:989971/150‑1 (MQ=255) cgcgcgcgAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGGACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGAAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGTTAGTGGCGCGTTCGCTACGCAAtt < 1:493158/150‑1 (MQ=255) cgcgcgcgAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGCAAtt < 2:2085165/150‑1 (MQ=255) gcgcgcgAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGCTCTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGc < 1:1947183/140‑1 (MQ=255) gcgcgcgAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGc > 2:1947183/1‑140 (MQ=255) cgcgagtTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGCAATTGAGt < 1:409911‑M2/143‑1 (MQ=255) gcgagtTTCTCCGTCAGTTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGCAATTGAGtt > 1:190313‑M2/7‑150 (MQ=255) gcgagtTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGCAATTGAGtt > 1:967087‑M2/7‑150 (MQ=255) gtTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGCAATTGAGTTACGa > 2:2297185‑M2/3‑150 (MQ=255) | CATCTGCGCCATGTTGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCT‑GAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGCAATTGAGTTACGA > NC_002947/4398598‑4398893 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |