| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 4881304 = | 99 (1.060) | 5 (0.060) | 5/234 | NT | 5.7% | coding (342/1356 nt) | uacT | uric acid permease |
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CGGTGGGCATCCGCATGCCGGTGATGATGGGTGCCAGTTTCGCTGCCGTCGGCAGCATGGTGGCCATGGCCGGCATGCCCGGCGTGGGCCTGCAGGGGATCTTCGGCGCGACCATCGCTGCCGGGTTCTTCGGCATGCTGATCGCGCCGTTCATGTCCAAGGTTGTCCGCTTCTTCCCACCGCTGGTCACCGGTACGGTGATCACCTCGATTGGCCTGTCGCTGTTCCCGGTGGCTGTCAACTGGGCCGGTGGCGGCCATGAAGCAGAAACGTTCGGCTCGCCGATCTACCTGCTGGTG > NC_002947/4881201‑4881499 | cGGTGGGCATCCGCATGCCGGTGATGATGGGTGCCAGTTTCGCTGCCGTCGGCAGCATGGTGGCCATGGCCGGCATGCCCGGCGTGGGCCTGCAGGGGATCTTCGGCGCGACCATCGCTGCCGGGTTCTTCGGCATGCTGATCGCGCCGt > 1:2428570/1‑150 (MQ=255) gTGGGCATCCGCATGCCGGTGATGATGGGTGCCAGTTTCGCTGCCGTCGGCAGCATGGTGGCCATGGCCGGCATGCCCGGCGTGGGCCTGCAGGGGATCTTCGGCGCGACCATCGCTGCCGGGTTCTTCGGCATGCTGATCGCGCCGTTc < 2:2319445/150‑1 (MQ=255) cGCATGCCGGTGATGATGGGTGCCAGTTTCGCTGCCGTCGGCCGCCTGGTGGCCATGGCCGGCATGCCCGGCGTGGGCCTGCAGGGGATCTTCGGCGCGACCATCGCTGCCGGGTTCTTCGGCATGCTGATCGCGCCGTTCATGTCCAAg < 1:1742615/150‑1 (MQ=255) cGCATGCCGGTGATGATGGGTGCCAGTTTCGCTGCCGTCGGCAGCATGGTGGGCATGGTCGGCATGCCCGGCGTGGGCCTGCAGGGGATCTTCGGCGCGACCATCGCTGCCGGGTTCTTCGGCATGCTGATCGCGCCGTTCATGTCCAAg < 2:65864/150‑1 (MQ=255) cGGTGATGATGGGTGCCAGTTTCGCTGCCGTCGGCAGCATGGTGGCCATGGCCGGCATGCCCGGCGTGGGCCTGCAGGGGATCTTCGGCGCGACCATCGCTGCCGGGTTCTGCGGCATGCTGATCGCGCCGTTCATGTCCACGGgtgtgc > 2:604913/1‑148 (MQ=255) gTGATGATGGGTGCCAGTTTCGCTGCCGTCGGCAGCATGGTGGCCATGGCCGGCATGCCCGGCGTGGGCCTGCAGGGGATCTTCGGCGCGACCATCGCTGCCGGGTTCTTCGGCATGCTGATCGCGCCGTTCATGTCCAAGGTTGTCCGc > 1:903283/1‑150 (MQ=255) tgatgaTGGGTGCCCGTTTCGCTGAGGCCGGCGGCAGGGTGCGCAGGGCCGGCATGCCCGGCGTGGGCCTGCAGGGGATCTTCGGCGCGACCATCGCTGCCGGGTTCTTCGGCATGCTGATCGCGCCGTTCATGTCCAAGGTTGTCCGct < 2:623845/150‑1 (MQ=255) atgatgGGTGCCAGTTTCGCTGCCGTCGGCAGCATGGTGGCCATGGCCGGCATGCCCGGCGTGGGCCTGCAGGGGATCTTCGGCGCGACCATCGCTGCCGGGTTCTTCGGCATGCTGATCGCGCCGTTCATGTCCAAGGTTGTCCGc < 2:1572992/147‑1 (MQ=255) atgatgGGTGCCAGTTTCGCTGCCGTCGGCAGCATGGTGGCCATGGCCGGCATGCCCGGCGTGGGCCTGCAGGGGATCTTCGGCGCGACCATCGCTGCCGGGTTCTTCGGCATGCTGATCGCGCCGTTCATGTCCAAGGTTGTCCGc > 1:1572992/1‑147 (MQ=255) gatgGGTGCCAGTTTCGCTGCCGTCGGCAGCATGGTGGCCATGGCCGGCATGCCCGGCGTGGGCCTGCAGGGGATCTTCGGCGCGACCATCGCTGCCGGGTTCTTCGGCATGCTGATCGCGCCGTTCATGTCCAAGGTTGTCCGcttctt < 1:1905295/150‑1 (MQ=255) gatgGGTGCCAGTTTCGCTGCCGTCGGCAGCATGGTGGCCATGGCCGGCATGCCCGGCGTGGGCCTGCAGGGGATCTTCGGCGCGACCATCGCTGCCGGGTTCTTCGGCATGCTGATCGCGCCGTTCATGTCCAAGGTTGTCCGcttctt > 1:1070654/1‑150 (MQ=255) tGCCAGTTTCGCTGCCGTCGGCAGCATGGTGGCCATGGCCGGCATGCCCGGCGTGGGCCTGCAGGGGATCTTCGGCGCGACCATCGCTGCCGGGTTCTTCGGCATGCTGATCGCGCCGTTCATGTCCAAGGTTGTCCGCTTCTTCCCAcc > 1:841435/1‑150 (MQ=255) caccatgCTGCCGACGGCAGCATGGTGGCCATGGCCGGCATGCCCGGCGTGGGCCTGCAGGGGATCTTCGGCGCGACCATCGCTGCCGGGTTCTTCGGCATGCTGATCGCGCCGTTCATGTCCAAGGTTGTCCGc > 1:1598912/7‑135 (MQ=255) caccatgCTGCCGACGGCAGCATGGTGGCCATGGCCGGCATGCCCGGCGTGGGCCTGCAGGGGATCTTCGGCGCGACCATCGCTGCCGGGTTCTTCGGCATGCTGATCGCGCCGTTCATGTCCAAGGTTGTCCGc < 2:1598912/129‑1 (MQ=255) aGTTTCGCTGCCGTCGGCAGCATGGTGGCCATGGCCGGCATGCCCGGCGTGGGCCTGCAGGGGATCTTCGGCGCGACCATCGCTGCCGGGTTCTTCGGCATGCTGATCGCGCCGTTCATGTCCAAGGTTGTCCGCTTCTTCCCACCGCTg > 1:443396/1‑150 (MQ=255) gTTTCGCTGCCGTCGGCAGCATGGTGGCCATGGCCGGCATGCCCGGCGTGGGCCTGCAGGGGATCTTCGGCGCGACCATCGCTGCCGGGTTCTTCGGCATGCTGATCGCGCCGTTCATGTCCAAGGTTGTc > 1:507416/1‑131 (MQ=255) gTTTCGCTGCCGTCGGCAGCATGGTGGCCATGGCCGGCATGCCCGGCGTGGGCCTGCAGGGGATCTTCGGCGCGACCATCGCTGCCGGGTTCTTCGGCATGCTGATCGCGCCGTTCATGTCCAAGGTTGTc < 2:507416/131‑1 (MQ=255) catgCTGCCGACGGCAGCATGGTGGCCATGGCCGGCATGCCCGGTGTGGGCCTGCAGGGGATCTTCGGCGCGACCATCGCTGCCGGGTTCTTCGGCATGCTGATCGCGCCGTTCATGTCCAAGGTTGTCCGCTTCTTCCCACCGCTGGTc > 1:751356/4‑150 (MQ=255) catgCTGCCGACGGCAGCATGGTGGCCATGGCCGGCATGCCCGGCGTGGGCCTGCAGGGGATCTTCGGCGCGACCATCGCTGCCGGGTTCTTCGGCATGCTGATCGCGCCGTTCATGTCCAAGGTTGTCCGCTTCTTCCCACCGCTGGTc > 2:474375/4‑150 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CGGTGGGCATCCGCATGCCGGTGATGATGGGTGCCAGTTTCGCTGCCGTCGGCAGCATGGTGGCCATGGCCGGCATGCCCGGCGTGGGCCTGCAGGGGATCTTCGGCGCGACCATCGCTGCCGGGTTCTTCGGCATGCTGATCGCGCCGTTCATGTCCAAGGTTGTCCGCTTCTTCCCACCGCTGGTCACCGGTACGGTGATCACCTCGATTGGCCTGTCGCTGTTCCCGGTGGCTGTCAACTGGGCCGGTGGCGGCCATGAAGCAGAAACGTTCGGCTCGCCGATCTACCTGCTGGTG > NC_002947/4881201‑4881499 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |