New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 5544518 = | 77 (0.830) | 9 (0.100) | 6/240 | NT | 10.1% | coding (391/426 nt) | rpsF | 30S ribosomal protein S6 |
? | NC_002947 | 5544547 = | 86 (0.960) | coding (362/426 nt) | rpsF | 30S ribosomal protein S6 |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
TTTCACGTCTTCAGCAGTGAAGCGGCAGAATTTACGACGACGGAAGAAACGTGCCATTTAATAGGCTCCTCTAAAGGTCCGTGGATTACTCGTCAGCGTTATCGCTGGAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACGGATAACGGCATCGTTGTAGCGGAAGTTGTCTTCCAGCTCGG > NC_002947/5544398‑5544694 | tttCACGTCTTCAGCAGTGAAGCGGCAGAATTTACGACGACGGAAGAAACGTGCCATTTAATAGGCTCCTCTAAAGGTCCGTGGATTACTCGTCAGCGTTATCGCTGGAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCAt > 1:2134508/1‑150 (MQ=255) tttCACGTCTTCAGCAGTGAAGCGGCAGAATTTACGACGACGGAAGAAACGTGCCATTTAATAGGCTCCTCTAAAGGTCCGTGGATTACTCGTCAGCGTTATCGCTGGAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCAt > 1:1914506/1‑150 (MQ=255) cgatgccgttatccgtaacctggtcatccgtcgcgacgaagccgttaccggccagtccgagatgctgaaggctgaagagaaccgcagcgagcgccgtgagcgtcgcgagcgtcctgagcaTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCAt > 1:2376122‑M1/121‑150 (MQ=255) aCGTCTTCAGCAGTGAAGCGGCAGAATTTACGACGACGGAAGAAACGTGCCATTTAATAGGCTCCTCTAAAGGTCCGTGGATTACTCGTCAGCGTTATCGCTGGAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTc > 2:1582690/1‑150 (MQ=255) ccgttatccgtaacctggtcatccgtcgcgacgaagccgttaccggccagtccgagatgctgaaggctgaagagaaccgcagcgagcgccgtgagcgtcgcgagcgtcctgagcaTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCa > 2:2080141‑M1/116‑150 (MQ=255) cGTCTTCAGCAGTGAAGCGGCAGAATTTACGACGACGGAAGAAACGTGCCATTTAATAGGCTCCTCTAAAGGTCCGTGGATTACTCGTCAGCGTTATCGCTGGAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCa < 2:2134508/150‑1 (MQ=255) gTCTTCAGCAGTGAAGCGGCAGAATTTACGACGACGGAAGAAACGTGCCATTTAATAGGCTCCTCTAGAGATCCGTGGATTACTCGTCAGCGTTATCGCTGGAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAg < 1:147980/150‑1 (MQ=255) gTCTTCAGCAGTGAAGCGGCAGAATTTACGACGACGGAAGAAACGTGCCATTTAATAGGCTCCTCTAAAGGTCCGTGGATTACTCGTCAGCGTTATCGCTGGAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCACCATTCTCAg > 1:100772/1‑150 (MQ=255) cagTGAAGCGGCAGAATTTACGACGACGGAAGAAACGTGCCATTTAATAGGCTCCTCTAAAGGTCCGTGGATTACTCGTCAGCGTTATCGCTGGAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTcg > 1:506904/1‑150 (MQ=255) cAGAATTTACGACGACGGAAGAAACGTGCCATTTAATAGGCTCCTCTAAAGGTCCGTGGATTACTCGTCAGCGTTATCGCTGGAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACg < 2:1788630/150‑1 (MQ=255) cAGAATTTACGACGACGGAAGAAACGTGCCATTTAATAGGCTCCTCTAAAGGTCCGTGGATTACTCGTCAGCGTTATCGCTGGAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACg < 2:1914506/150‑1 (MQ=255) gacgacgGAAGAAACGTGCCATTTAATAGGCTCCTCTAAAGGTCCGTGGATTACTCGTCAGCGTTATCGCTGGAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTg > 2:1468299/1‑150 (MQ=255) gacgacgGAAGAAACGTGCCATTTAATAGGCTCCTCTAAAGGTCCGTGGATTACTCGTCAGCGTTATCGCTGGAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTg > 1:1297174/1‑150 (MQ=255) gacgGAAGAAACGTGCCATTTAATAGGCTCCTCTAAAGGTCCGTGGATTACTCGTCAGCGTTATCGCTGGAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCgg > 2:1308570/1‑150 (MQ=255) acgGAAGAAACGTGCCATTTAATAGGCTCCTCTAAAGGTCCGTGGATTACTCGTCAGCGTTATCGCTGGAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGATGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGt < 2:1405856/150‑1 (MQ=255) cgGAAGAAACGTGCCATTTAATAGGCTCCTCTAAAGGTCCGTGGATTACTCGTCAGCGTTATCGCTGGAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGgcgc < 2:352593/139‑1 (MQ=255) ggAAGAAACGTGCCATTTAATAGGCTCCTCTAAAGGTCCGTGGATTACTCGTCAGCGTTATCGCTGGAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGAAGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTtc > 1:2088550/1‑150 (MQ=255) gaagaaACGTGCCATTTAATAGGCTCCTCTAAAGGTCCGTGGATTACTCGTCAGCGTTATCGCTGGAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTtct > 2:1750656/1‑150 (MQ=255) 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< 2:1894677/144‑1 (MQ=255) ttACTCGTCAGCGTTATCGCTGGAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGc > 1:1894677/1‑144 (MQ=255) cTCGTCAGCGTTATCGCTGGAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTcgcg > 1:338921/1‑150 (MQ=255) tCGTCAGCGTTATCGCTGGAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGa > 1:2209952/1‑150 (MQ=255) gTCAGCGTTATCGCTGGAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCCGCAAGCATCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACg > 1:1841967/1‑150 (MQ=255) tCAGCGTTATCGCTGGAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACgg > 2:1487893/1‑150 (MQ=255) 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2:1946447/150‑1 (MQ=255) gtcgCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCa > 2:605931/1‑122 (MQ=255) gCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCATTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACGGATAACGGCATCGTTGTAGCGGaa < 2:1735427/150‑1 (MQ=255) ccTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAAc > 2:794558/1‑95 (MQ=255) ccTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAAc < 1:794558/95‑1 (MQ=255) ccTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACg > 1:2020896/1‑125 (MQ=255) ccTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACg < 2:2020896/125‑1 (MQ=255) ttCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGa < 1:1823967/106‑1 (MQ=255) ttCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGa > 2:1823967/1‑106 (MQ=255) ttCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACGGATAACGGCATCGTTGTAGCGGAAGtt < 2:1631075/150‑1 (MQ=255) ttCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACGGATAACGGCATCGTTGTAGCGGAAGtt < 2:2304565/150‑1 (MQ=255) ttCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTAGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTTTTACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGAGACAGATGACCAGTGTACGGATAACGGCATCGTTGTAGCGGAAGtt > 1:532324/1‑150 (MQ=255) cggcggAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACGGATAACGGCATCGTTGTAGCGGAAGTTGt < 1:967835/150‑1 (MQ=255) ggcggAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACGGATGACGGCATCGTTGTAGCGGAAGTTGTc > 1:405378/1‑150 (MQ=255) ggcggAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACGGATAACGGCATCGTTGTAGCGGAAGTTgcc < 2:240351/150‑3 (MQ=255) acgacagcaTGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACGGATAACGGCATCGTTGTAGCGGAAGTTGTCTTcc < 2:2376122‑M2/141‑1 (MQ=255) aGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACGGATAACGGCATCGTTGTAGCGGAAGTTGTCTTCCa < 2:168658/150‑1 (MQ=255) tCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACGGATAACGGCATCGTTGTAGCGGAAGTTGTCTTCCAGc > 2:2415585/1‑150 (MQ=255) tCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACGGATAACGGCATCGTTGTAGCGGAAGTTGTCTTCCAGc > 1:321657/1‑150 (MQ=255) tCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACGGATAACGGCATCGTTGTAGCGGAAGTTGTCTTCCAGc > 2:2415985/1‑150 (MQ=255) agcaTGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCt > 1:386827‑M2/5‑85 (MQ=255) agcaTGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCt < 2:386827‑M2/81‑1 (MQ=255) agcaTGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACGGATAACGGCATCGTTGTAGCGGAAGTTGTCTTCCAGCTc > 1:1632895‑M2/5‑150 (MQ=255) caTGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACGGATAACGGCATCGTTGTAGCGGAAGTTGTCTTCCAGCTCgg < 2:1947991‑M2/148‑1 (MQ=255) | TTTCACGTCTTCAGCAGTGAAGCGGCAGAATTTACGACGACGGAAGAAACGTGCCATTTAATAGGCTCCTCTAAAGGTCCGTGGATTACTCGTCAGCGTTATCGCTGGAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACGGATAACGGCATCGTTGTAGCGGAAGTTGTCTTCCAGCTCGG > NC_002947/5544398‑5544694 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |