New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_002947 | = 5655159 | 79 (0.900) | coding (438/1059 nt) | epd | D‑erythrose 4‑phosphate dehydrogenase |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
ATCACCGGCTGGTCGTTCATCGCCGAGTGGATGGTTGTGATCTGCACATATTCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCACCAGGT > NC_002947/5655010‑5655307 | accACCGGCTGGTCGTTCATCGCCGAGTGGATGGTTGTGATCTACACAGATTCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAaggcag < 1:258804/148‑1 (MQ=255) aTCACCGGCTGGTCGTTCATCGCCGAGTGGATGGTTGTGATCTGCACATATTCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAaggcag > 1:1725979/1‑150 (MQ=255) tCACCGGCTGGTCGTTCATCGCCGAGTGGATGGTTGTGATCTGCACATATTCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGg < 2:941600‑M2/150‑2 (MQ=255) 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tGGTCGTTCATCGCCGAGTGGATGGTTGTGATCTGCACATNTTCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCAGGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTg > 1:2366078/1‑150 (MQ=255) ggTCGTTCATCGCCGAGTGGATGACAGAAATCTGCACATATTCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGa < 1:602608/150‑1 (MQ=255) gTCGTTCATCGCCGAGTGGATGGTTGTGATCTGCACATATTCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGAt > 1:2149899/1‑150 (MQ=255) tCGTTCATCGCCGAGTGGATGGTTGTGATCTGCACATATTCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATg < 2:127648/150‑1 (MQ=255) cGTTCATCGCCGAGTGGATGGTTGTGATCTGCACATATTCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGc < 2:2119847/150‑1 (MQ=255) 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cacCAGGCGCTCGCTGCCGGTACGGATCGCGTGGTTGATGCCGTAGTCAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGAACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTtata < 1:603857/150‑1 (MQ=255) cacCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTtata < 1:660161/150‑1 (MQ=255) acCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGgcctggtgtccaacgcctcgtgcac < 2:2158841‑M2/52‑26 (MQ=255) acCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGgcctggtgtccaacgcctcgtgcac > 1:2158841‑M2/1‑27 (MQ=255) acCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGATGTGGTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAg > 1:1181840/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGgcctggtgtccaacgcctcgtgcaccaccaactgcggcgtgccgctgctgcgtgtgctggaccaggcgtttggcatcgaatatgtgcagatcacaaccatccactcggcgatgaacgaccagccg < 1:99173‑M2/150‑126 (MQ=255) cAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACa < 1:2288474/92‑1 (MQ=255) cAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAg < 2:1762296/148‑1 (MQ=255) cAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAg > 1:1762296/1‑148 (MQ=255) gcgcTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCa > 2:1570604/1‑92 (MQ=255) gcgcTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCa < 1:1570604/92‑1 (MQ=255) gcgcTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCAcc > 1:1834876/1‑150 (MQ=255) gctcgctGCCGGTAAGGCAGgcctggtgtccaacgcctcgtgcaccaccaactgcggcgtgccgctgctgcgtgtgctggaccaggcgtttggcatcgaat > 2:181279‑M2/1‑20 (MQ=255) gctcgctGCCGGTAAGGCAGgcctggtgtccaacgcctcgtgcaccaccaactgcggcgtgccgctgctgcgtgtgctggaccaggcgtttggcatcgaat < 1:181279‑M2/101‑82 (MQ=255) gctcgctGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACGACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCgg > 2:1978576/1‑150 (MQ=255) gctcgctGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCgg > 1:1858097/1‑150 (MQ=255) tcgctGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGaa > 1:10706/1‑150 (MQ=255) tGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCt > 2:831174/1‑114 (MQ=255) tGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCt < 1:831174/114‑1 (MQ=255) cGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACGACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCa < 1:1978576/150‑1 (MQ=255) ggTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAg < 2:604580/150‑1 (MQ=255) ggcaggcCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCACCa < 1:800860/150‑1 (MQ=255) gcaggcCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGa < 1:96013/95‑1 (MQ=255) gcaggcCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGa > 2:96013/1‑95 (MQ=255) aggcCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCACCAGGt < 2:2132445/150‑1 (MQ=255) | ATCACCGGCTGGTCGTTCATCGCCGAGTGGATGGTTGTGATCTGCACATATTCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCGGAACACTCCAGCACCAGGT > NC_002947/5655010‑5655307 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |