New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 626190 | 38 (1.080) | 7 (0.210) | 7/260 | 3.1 | 15.5% | coding (338/816 nt) | mtfA | glucose‑regulated peptidase |
? | NC_002947 | = 626200 | 40 (1.190) | coding (328/816 nt) | mtfA | glucose‑regulated peptidase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GCATGTCGAGCTTGTGCGCCAGCTCATGGATGACCAGGTTGTAAGCCTCCCAGCCACCACTGGCCTGCACGCCGTTCCAGGCCAGGATGATCGGCCCCTGTTGCCAGGCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAGTCGTCGGGGTACAGGATGATTTCGTGGAAGCCTTGGTACCAGTTCAGCTCACCCAGGTGAAGCAGCGGTAACTGTGCCTGGGCGGCCAGCATTAGGCGCTGCTCGTCGTCCAGCTC > NC_002947/626041‑626338 | gCATGTCGAGCTTGTGCGCCAGCTCATGGATGACCAGGTTGTAAGCCTCCCAGCCACCACTGGCCTGCACGCCGTTCCAGGCCAGGATGATCGGCCCCTGTTGCCAGGCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCAc > 1:394535/1‑150 (MQ=255) gCATGTCGAGCTTGTGCGCCAGCTCATGGATGACCAGGTTGTAAGCCTCCCAGCCACCACTGGCCTGCACGCCGTTCCAGGCCAGGATGATCGGCCCCTGTTGCCAGGCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCAc > 1:312454/1‑150 (MQ=255) aTGTCGAGCTTGTGCGCCAGCTCATGGATGACCAGGTTGTAAGCCTCCCAGCCACCACTGGCCTGCACGCCGTTCCAGGCCAGGATGATCGGCCCCTGTTGCCAGGCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTg > 2:739545/1‑150 (MQ=255) tCGAGCTTGTGCGCCAGCTCATGGATGACCAGGTTGTAAGCCTCCCAGCCACCACTGGCCTGCACGCCGTTCCAGGCCAGGATGATCGGCCCCTGTTGCCAGGCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCa > 1:202946/1‑150 (MQ=255) tCGAGCTTGTGCGCCAGCTCATGGATGACCAGGTTGTAAGCCTCCCAGCCACCACTGGCCTGCACGCCGTTCCAGGCCAGGATGATCGGCCCCTGTTGCCAGGCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCa > 1:250313/1‑150 (MQ=255) aGCTCATGGATGACCAGGTTGTAAGCCTCCCAGCCACCACTGGCCTGCACGCCGTTCCAGGCCAGGATGATCGGCCCCTGTTGCCAGGCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTgg < 2:312454/150‑1 (MQ=255) gATGACCAGGTTGTAAGCCTCCCAGCCACCACTGGCCTGCACGCCGTTCCAGGCCAGGATGATCGGCCCCTGTTGCCAGGCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCtt > 1:259434/1‑150 (MQ=255) gACCAGGTTGTAAGCCTCCCAGCCACCACTGGCCTGCACGCCGTTCCAGGCCAGGATGATCGGCCCCTGTTGCCAGGCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGaa < 2:118611/150‑1 (MQ=255) ccAGGTTGTAAGCCTCCCAGCCACCACTGGCCTGCACGCCGTTCCAGGCCAGGATGATCGGCCCCTGTTGCCAGGCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAgt > 1:343381/1‑150 (MQ=255) ccAGGTTGTAAGCCTCCCAGCCACCACTGGCCTGCACGCCGTTCCAGGCCAGGATGATCGGCCCCTGTTGCCAGGCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAgt > 1:92254/1‑150 (MQ=255) ggTTGTAAGCCTCCCAGCCACCACTGGCCTGCACGCCGTTCCAGGCCAGGATGATCGGCCCCTGTTGCCAGGCTTCGCCGCTGTGTCCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAgtcgt > 2:369919/1‑150 (MQ=255) aaGCCTCCCAGCCACCACTGGCCTGCACGCCGTTCCAGGCCAGGATGATCGGCCCCTGTTGCCAGGCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAGTCGTCGGGGt > 2:589189/1‑150 (MQ=255) tCCCAGCCACCACTGGCCCGCACGCCGTTCCAGGCCAGGATGATCGACCCCTGTTGCCAGGCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAGTCGTCGGGGTACAgg > 2:144233/1‑150 (MQ=255) cACGCCGTTCCAGGCCAGGATGATCGGCCCCTGTTGCCAGGCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAGTCGTCGGGGTACAGGATGATTTCGTGGAAGCCTTg < 2:742012/150‑1 (MQ=255) cACGCCGTCCCCGCCCAGGATGATCGGCCCCTGTTGTCAGTCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCCTAAAGTCGTCGGGGTACAGGATGATTTCGTGGAAGCCTTg < 1:215642/150‑1 (MQ=255) aCGCCGTTCCAGGCCAGGATGATCGGCCCCTGTTGCCAGGCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAGTCGTCGGGGTACAGGATGATTTCGTGGAAGCCTTgg < 2:701470/150‑1 (MQ=255) gCCGTTCCAGGCCAGGATGATCGGCCCCTGTTGCCAGGCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAGTCGTCGGGGTACAGGATGATTTCGTGGAAGCCTTGGTa > 2:683272/1‑150 (MQ=255) gCCGTTCCAGGCCAGGATGATCGGCCCCTGTTGCCAGGCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAGTCGTCGGGGTACAGGATGATTTCGTGGAAGCCTTGGTa > 1:663110/1‑150 (MQ=255) ccGTTCCAGGCCAGGATGATCGGCCCCTGTTGCCAGGCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAGTCGTCGGGGTACAGGATGATTTCGTGGAAGCCTTGGTAc > 1:618977/1‑150 (MQ=255) ttCCAGGCCAGGATGATCGGCCCCTGTTGCCAGGCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAGTCGTCGGGGTACAGGATGATTTCGTGGAAGCCTTGGTACCAg < 2:394535/150‑1 (MQ=255) ccaggATGATCGGCCCCTGTTGCCAGGCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAGTCGTCGGGGTACAGGATGATTTCGTGGAAGCCTTGGTACCAGTTCAGCt < 1:137558/150‑1 (MQ=255) gCCCCTGTTGCCAGGCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAGTCGTCGGGGTACAGGATGATTTCGTGGAAGCCTTGGTACCAGTTCAGCTCACCCAggccct < 1:815515/150‑5 (MQ=255) ccccTGTTGCCAGGCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAGTCGTCGGGGTACAGGATGATTTCGTGGAAGCCTTGGTACCAGTTCAGCTCACCCAGGTGAag < 2:284284/150‑1 (MQ=255) ttGCCAGGCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAGTCGTCGGGGTACAGGATGATTTCGTAATACCCTTGGTACCAGTTCAGCTCACCCAGGTGAAGCAGCgg > 1:229666/1‑150 (MQ=255) ccAGGCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAGTCGTCGGGGTACAGGATGATTTCGTGGAAGCCTTGGTACCAGTTCAGCTCACCCAGGTGAAGCAGCGGTaa < 1:182203/150‑1 (MQ=255) ccAGGCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAGTCGTCGGGGTACAGGATGATTTCGTGGAAGCCTTGGTACCAGTTCAGCTCACCCAGGTGAAGCAGCGGTaa < 1:739545/150‑1 (MQ=255) aGGCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAGTCGTCGGGGTACAGGATGATTTCGTGGAAGCCTTGGTACCAGTTCAGCTCACCCAGGTGAAGCAGCGGTAACt > 2:714934/1‑150 (MQ=255) gCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAGTCGTCGGGGTACAGGATGATTTCGTGGAAGCCTTGGTACCAGTTCAGCTCACCCAGGTGAAGCAGCGGTAACtgt > 1:248347/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAGTCGTCGGGGTACAGGATGATTTCGTGGAAGCCTTGGTACCAGTTCAGCTCACCCAGGTGAAGCAGCGGTAACTGTGc < 2:250313/150‑1 (MQ=255) cgccgcTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAGTCGTCGGGGTACAGGATGATTTCGTGGAAGCCTTGGTACCAGTTCAGCTCACCCAGGTGAAGCAGCGGTAACTGTGCCt < 2:248347/150‑1 (MQ=255) cgcTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAGTCGTCGGGGTACAGGATGATTTCGTGGAAGCCTTGGTACCAGTTCAGCTCACCCAGGTGAAGCAGCGGTAACTGTGCCTggg > 2:669857/1‑150 (MQ=255) gcTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAGTCGTCGGGGTACAGGATGATTTCGTGGAAGCCTTGGTACCACTTCAGCTCACCCAGGTGAAGCAGCGGTAACTGTGCCTGggc > 1:284509/1‑150 (MQ=255) gtgtTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAGTCGTCGGGGTACAGGATGATTTCGTGGAAGCCTTGGTACCAGTTCGGCTCACCCAGGTGAAGCAGCGGTAACTGTGCCTGggcggc < 2:749111/150‑1 (MQ=255) cGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAGTCGTCGGGGTACAGGATGATTTCGTGGAAGCCTTGGTACCAGTTCAGCTCACCCAGGTGAAGCAGCGGTAACTGTGCCTGGGCGGCCAGCATTa < 1:683272/150‑1 (MQ=255) ccACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAGTCGTCGGGGTACAGGATGATTTCGTGGAAGCCTTGGTACCAGTTCAGCTCACCCAGGTGAAGCAGCGGGAACTTTGCCTGTGCGGCCAGCATTAGgcg > 2:444385/1‑150 (MQ=255) tCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAGTCGTCGGGGGACAGGATGATTTCGTGGAAGCCTTGGTACCAGTTCAGCTCACCCAGGTGAAGCAGCGGTAACTGTGCCTGGGCGGCCAGCATTAGGCGCTGCtcgtcg > 2:468442/1‑150 (MQ=255) ccACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAGTCGTCGGGGTACAGGATGATTTCGTGGAAGCCTTGGTACCAGTTCAGCTCACCCAGGTGAAGCAGCGGTAACTGTGCCTGGGCGGCCAGCATTAGGCGCTGCTcgtcgt > 2:305629/1‑150 (MQ=255) aggCCACTGGCAGCGCGGTGGCGCTGGGGGGTCTTGAAGTCGTCGGGGTACAGGATGATTTCGTGGAAGCCTTGGTACCAGTTCAGCTCACCCAGGTGAAGCAGCGGTAACTGTGCCTGGGCGGCCAGCATTAGGCGCTGCTCGTCGTcc < 2:284509/148‑1 (MQ=255) cACTGGCATCGCGGTGGCGCTGCACGCCTTTGAAGTCGTCGGGGTACAGGATGATTTCGTGGAAGCCTTGGTACCCATCAAGCTCACCCAGGTGAAAGTAAAAAAACTGGCGGTCAGCTTCCAGCATTAGGCGCTGCTCGTCGTCCAGCt < 1:369919/150‑1 (MQ=255) aCTGGCATCGCGGTGGTGCTGGGGGCGCTTGAAATAGACAGGGTACAGGTGGATATCATGGAAGCCTAGGTACCACTTCAGCTCACCCAGGTGAAGCAGCGGTACCTGTGCCAGGGCGACCAGCATTAGGCGCTGCTCGTGGTCCAGCTc > 2:57447/1‑150 (MQ=255) | GCATGTCGAGCTTGTGCGCCAGCTCATGGATGACCAGGTTGTAAGCCTCCCAGCCACCACTGGCCTGCACGCCGTTCCAGGCCAGGATGATCGGCCCCTGTTGCCAGGCTTCGCCGCTGTGTTCGCCGTCCCACACATGCTCCACGCCACTGGCATCGCGGTGGCGCTGGGGGCTCTTGAAGTCGTCGGGGTACAGGATGATTTCGTGGAAGCCTTGGTACCAGTTCAGCTCACCCAGGTGAAGCAGCGGTAACTGTGCCTGGGCGGCCAGCATTAGGCGCTGCTCGTCGTCCAGCTC > NC_002947/626041‑626338 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |