| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5787692 | 52 (1.470) | 8 (0.230) | 8/264 | 2.8 | 13.2% | coding (157/774 nt) | PP_5070 | ParA family protein |
| ? | NC_002947 | = 5787707 | 55 (1.610) | coding (142/774 nt) | PP_5070 | ParA family protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AGGTCGGCCAGCTCGGCAGTGGCGGTGACCACATGCAGGTTGTCGAACGGGGTTTCGTAGATATCGACCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAGGTCCGGTAGCCTTCATTGGCACTGACCGCCGCCAGGTTGCAGGCAATGCTCGACTTGCCCACGCCACCTTTCTGATTGAACACCACG > NC_002947/5787550‑5787840 | aGGTCGGCCAGCTCGGCAGTGGCGGTGACCACATGCAGGTTGTCGAACGGGGTTTCGTAGATATCGACCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTc > 1:31194/1‑150 (MQ=255) gTCGGCCAGCTCGGCAGTGGCGGTGACCACATGCAGGTTGTCGAACGGGGTTTCGTAGATATCGACCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCATCGCCgggctg > 1:129592/1‑146 (MQ=255) tCGGCCAGCTCGGCAGTGGCGGTGACCACATGCAGGTTGTCGAACGGGGTTTCGTAGATATCGACCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCaccggc < 2:377066‑M1/146‑7 (MQ=255) tCGGCCAGCTCGGCAGTGGCGGTGACCACATGCAGGTTGTCGAACGGGGTTTCGTAGATATCGACCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCaccggc > 1:377066‑M1/1‑140 (MQ=255) cGGCCAGCTCGGCAGTGGCGGTGACCACATGCAGGTTGTCGAACGGGGTTTCGTAGATATCGACCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGc > 2:269909/1‑150 (MQ=255) cAGCTCGGCAGTGGCGGTGACCACATGCAGGTTGTCGAACGGGGTTTCGTAGATATCGACCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGt < 1:342886/150‑1 (MQ=255) tGACCACATGCAGGTTGTCGAACGGGGTTTCGTAGATATCGACCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTg > 1:466750/1‑142 (MQ=255) tGACCACATGCAGGTTGTCGAACGGGGCTTCGTAGATATCGACCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTg < 2:466750/142‑1 (MQ=255) cacaTGCAGGTTGTCGAACGGGGTTTCGTAGATATCGACCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGc > 2:555236/1‑150 (MQ=255) cacaTGCAGGTTGTCGAACGGGGTTTCGTAGATATCGACCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGc < 1:555236/150‑1 (MQ=255) ccaaCGGGGTTTCGTAGATATCGACCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCCATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTGCGCCTGGGCATCCAGGt < 2:262212/148‑1 (MQ=255) gAACGGGGTTTCGTAGATATCGACCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTc < 1:140681/150‑1 (MQ=255) gAACGGGGTTTCGTAGATATCGACCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTc < 2:749968/150‑1 (MQ=255) aCGGGGTTTCGTAGATATCGACCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGc < 2:842982/108‑1 (MQ=255) aCGGGGTTTCGTAGATATCGACCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGc > 1:842982/1‑108 (MQ=255) aCGGGGTTTCGTAGATATCGACCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGTCTTCCAGGGCGa > 2:457810/1‑150 (MQ=255) aCGGGGTTTCGTAGATATCGACCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTCTTGTAAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGa > 1:221516/1‑150 (MQ=255) ggggTTTCGTAGATATCGACCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATc > 1:669473/1‑150 (MQ=255) tttCGTAGATATCGACCTTGTTCTCCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCGTGGGCATCCAGGTCGAtaacga > 2:34343/1‑145 (MQ=255) tCGTAGATATCGACCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGACGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAg < 2:31194/150‑1 (MQ=255) gTAGATATCGACCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAGGt > 1:255219/1‑150 (MQ=255) gTAGATATCGACCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCACCGGCCTGACCGGCgaggacatccccatgggcat < 1:330460‑M2/122‑21 (MQ=255) gTAGATATCGACCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCACCGGCCTGACCGGCgaggacatccccatgggcat > 2:330460‑M2/1‑102 (MQ=255) tAGATATCGACCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAGGTc < 1:269909/150‑1 (MQ=255) tAGATATCGACCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAGGTc > 1:785897/1‑150 (MQ=255) gACCTTGTTCTTCTTGCTGAACCGCCCGCTTGAAATGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGTCGTTCAGGCCGGTGAGATATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAGGTCCGCTAGcc < 2:400620/150‑1 (MQ=255) aCCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAGGTCCGGTAGCCt > 2:282797/1‑150 (MQ=255) aCCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAGGTCCGGTAGCCt > 1:313697/1‑150 (MQ=255) gTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCACCGGCCTGACCGGCgaggacatccccatgggcatcg > 1:662422‑M2/1‑87 (MQ=255) gTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCACCGGCCTGACCGGCgaggacatccccatgggcatcg < 2:662422‑M2/109‑23 (MQ=255) ttcttcTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAGGTCCGGTAGCCTTCATTg < 2:255219/150‑1 (MQ=255) cTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAGGTCCGGTAGCCTTCATTGGCACTGAcc > 2:61554/1‑150 (MQ=255) tGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGcc < 1:478338/98‑1 (MQ=255) tGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGcc > 2:478338/1‑98 (MQ=255) tGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAGGTCCGGTAGCCTTCATTGGCACTGAccg > 2:730303/1‑150 (MQ=255) cGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCaccggcctgaccggcga < 1:221907‑M1/69‑18 (MQ=255) cGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCaccggcctgaccggcga > 2:221907‑M1/1‑52 (MQ=255) cGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAGGTCCGGTAGCCTTCATTGGCACTGACCGCCGCCAGGt > 2:111977/1‑150 (MQ=255) gCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAGGTCCGGTAGCCTTCATTGGCACTGACCGCCGCCAGGtt > 1:349651/1‑150 (MQ=255) aaaGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAGGTCCGGTAGCCTTCATTGGCACTGACCGCCGCCAGGTTGCAgg > 1:442053/1‑150 (MQ=255) aaGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAg > 1:14334/1‑106 (MQ=255) aaGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAg < 2:14334/106‑1 (MQ=255) gCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCAAGTTCGCCTGGGCGTCCAGGTCGATCAACAAGGTCCGGTATGCTTCATTGGCACTTAACGCCGCCAGGTTGCAGGCaag > 1:372876/1‑149 (MQ=255) gCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAGGTCCGGTAGCCTTCATTGGCACTGACCGCCGCCAGGTTGCAGGCAATGCTCg > 2:28620/1‑150 (MQ=255) cTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAGGTCCGGTAGCCTTCATTGGCACTGACCGCCGCCAGGTTGCAGGCAATGCTCGa < 1:636144/150‑1 (MQ=255) aagaaATCGGCGATGCCCAT‑GGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAg > 1:156205/1‑79 (MQ=255) aagaaATCGGCGATGCCCAT‑GGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAg < 2:156205/79‑1 (MQ=255) agaaATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGNTGANGTATTGGGTCGAGTTCGACTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAGGTCCGGTAGCCTTCATTGGCACTGACCGCCGCCAGGTTGCAGGCAATGCTCGATTTGc > 1:690516/1‑150 (MQ=255) agaaATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTc < 2:190519/82‑1 (MQ=255) agaaATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTc > 1:190519/1‑82 (MQ=255) aaTCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATcaac > 1:68868/1‑86 (MQ=255) aaTCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATcaac < 2:68868/86‑1 (MQ=255) tCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAGGTCCGGTAGCCTTCATTGGCACTGACCGCCGCCAGGTTGCAGGCAATGCTCGACTTGCCCACg > 2:823602/1‑150 (MQ=255) cGATGCCCATGGGGATGTCCTCgccggtcaggccggtgaggacatccccatgggcatcgccgatttcttcaagcaaagcctttccagcgggccgttcagcaagaagaac > 1:662422‑M1/1‑22 (MQ=255) cGATGCCCATGGGGATGTCCTCgccggtcaggccggtgaggacatccccatgggcatcgccgatttcttcaagcaaagcctttccagcgggccgttcagcaagaagaac < 2:662422‑M1/109‑88 (MQ=255) aTGCCCATGGGGATGTCCTCgccggtcaggccggtgaggacatccccatgggcatcgccgatttcttcaagcaaagcctttccagcgggccgttcagcaagaagaacaaggtcgatatctac < 1:330460‑M1/122‑103 (MQ=255) aTGCCCATGGGGATGTCCTCgccggtcaggccggtgaggacatccccatgggcatcgccgatttcttcaagcaaagcctttccagcgggccgttcagcaagaagaacaaggtcgatatctac > 2:330460‑M1/1‑20 (MQ=255) tGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAGGTCCGGTAGCCTTCATTGGCACTGACCGCCGCCAGGTTGCAGGCAATGCTc > 2:450565/1‑125 (MQ=255) tGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAGGTCCGGTAGCCTTCATTGGCACTGACCGCCGCCAGGTTGCAGGCAATGCTc < 1:450565/125‑1 (MQ=255) tGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAGGTCCGGTAGCCTTCATTGGCACTGACCGCCGCCAGGTTGCAGGCAATGCTCGACTTGCCCACGCCACCTTTCTGAt < 1:34343/150‑1 (MQ=255) tCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAGGTCCGGTAGCCTTCATTGGCACTGAc > 1:818698/1‑92 (MQ=255) tCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAGGTCCGGTAGCCTTCATTGGCACTGAc < 2:818698/92‑1 (MQ=255) cTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAGGTCCGGTAGCCTTCATTGGCACTGACCCCCGCCAGGTTGCAGGCAATGCTCGACTTGCCCACGCCACCTTTCTGATTGAAcaccac > 2:26049/1‑150 (MQ=255) tCGCCGGTCAGGCCGGTgaggacatccccatgggcatcgccgatttcttcaagcaaagcctttccagcg < 1:221907‑M2/69‑53 (MQ=255) tCGCCGGTCAGGCCGGTgaggacatccccatgggcatcgccgatttcttcaagcaaagcctttccagcg > 2:221907‑M2/1‑17 (MQ=255) tCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGCTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAGGTCCGGTAGCCTTCATTGGCACTTACCGCCGCCAGGTTGCAGGCAATGCTCGACTTGCCCACGCCACCGTTCTGATTGAACACCAcg > 1:95412/1‑150 (MQ=255) | AGGTCGGCCAGCTCGGCAGTGGCGGTGACCACATGCAGGTTGTCGAACGGGGTTTCGTAGATATCGACCTTGTTCTTCTTGCTGAACGGCCCGCTGGAAAGGCTTTGCTTGAAGAAATCGGCGATGCCCATGGGGATGTCCTCGCCGGTCAGGCCGGTGAGGTATTGGGTCGAGTTCGCCTGGGCATCCAGGTCGATCAACAAGGTCCGGTAGCCTTCATTGGCACTGACCGCCGCCAGGTTGCAGGCAATGCTCGACTTGCCCACGCCACCTTTCTGATTGAACACCACG > NC_002947/5787550‑5787840 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |