New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2981909 | 47 (1.080) | 3 (0.070) | 3/244 | NT | 5.9% | coding (499/1734 nt) | PP_2607 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 2981934 | 51 (1.230) | coding (474/1734 nt) | PP_2607 | hypothetical protein |
TGCGTTGCCGGTGGTAAGCCGGGTGCCGCGTGGGTGCTGCAGGCGGTCGCGCGCGTAACGCGCCATCAACTTCAGGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTACTCGACCATTTCCAGCGCCCGGCCGAACTGAGTGGCACCGGGTGCATCCGGGTAATAGTCGGGCGAGAGTGGGCGCA > NC_002947/2981760‑2982058 | tGCGTTGCCGGTGGTAAGCCGGGTGCCGCGAGGGTGACGCCAGATGTCTGGCAGAAAACGCGCCATCAATTGGTTACAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGACATGCGGGAGATCCACCCGGTTGACCATCATgcc > 1:192787/1‑150 (MQ=255) gTTGCCGGTGGTAAGCCGGGTGCCGCGTGGGTGCTGCAGGCGGTCGCGCGCGTAACGCGCCATGAACTTCAAGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGAACATCATgccgcc > 2:616286/1‑150 (MQ=255) cGGTGGTAAGCCGGGTGCCGCGTGGGTGCTGCAGGCGGTCGCGCGCGTAACGCGCCATCAACTTCAGGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAAca > 1:896751/1‑150 (MQ=255) ggtggtAAGCCGGGTGCCGCGTGGGTGCTGCAGGCGGTCGCGCGCGTAACGCGCCATCAACTTCAGGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAAcag > 1:307124/1‑150 (MQ=255) gtggtAAGCCGGGTGCCGCGTGGGTGCTGCAGGCGGTCGCGCGCGTAACGCGCCATCAACTTCAGGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAAcagc > 1:651755/1‑150 (MQ=255) ccGCGTGGGTGCTGCAGGCGGTCGCGCGCGTAACGCGCCATCAACTTCAGGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGGGCGGCGCATGCTGAAGAAATGATGGCTCTCCACCATCGCGCCCGCGATGCCGCGCAAGAGCAGCATGCCGGGCGGt < 2:11944/150‑1 (MQ=255) ccGCGTGGGTGCTGCAGGCGGTCGCGCGCGTAACGCGCCATCAACTTCAGGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGt < 2:896751/150‑1 (MQ=255) tgctgcAGGCGGTCGCGCGCGTAACGCGCCATCAACTTCAGGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCaccgcccggcatgctgctgttcggcggcatgatg < 2:760676‑M1/150‑35 (MQ=255) tgctgcAGGCGGTCGCGCGCGTAACGCGCCATCAACTTCAGGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGc < 1:680788/150‑1 (MQ=255) tgcAGGCGGTCGCGCGCGTAACGCGCCATCAACTTCAGGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAgg > 2:1065726/1‑150 (MQ=255) gcAGGCGGTCGCGCGCGTAACGCGCCATCAACTTCAGGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGt < 1:612106/150‑1 (MQ=255) cAGGCGGTCGCGCGCGTAACGCGCCATAAACTTCAGGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTc > 1:260591/1‑150 (MQ=255) cgcgcgTAACGCGCCATCAACTTCAGGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCgt < 2:192787/150‑1 (MQ=255) gcgcgTAACGCGCCATCAACTTCAGGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCgtg > 1:178621/1‑150 (MQ=255) gcgcgTAACGCGCCATCAACTTCAGGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCgtg > 1:178535/1‑150 (MQ=255) gcgcgTAACGCGCCATCAACTTCAGGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCgtg > 2:105574/1‑150 (MQ=255) aCGCGCCATCAACTTCAGGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTTAAGCGTGTGCCCAg < 1:413855/150‑1 (MQ=255) gcgcCATCAACTTCAGGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATACTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGgc > 1:627664/1‑150 (MQ=255) ccATCAACTTCAGGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCt > 2:451911/1‑150 (MQ=255) aaCTTCAGGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCcg > 1:420846/1‑150 (MQ=255) aCTTCAGGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCaccgcccggcatgctgctgttcggcggca > 2:956122‑M1/1‑82 (MQ=255) aCTTCAGGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCaccgcccggcatgctgctgttcggcggca < 1:956122‑M1/111‑30 (MQ=255) ttCAGGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGc > 2:542920/1‑114 (MQ=255) ttCAGGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGc < 1:542920/114‑1 (MQ=255) ttCAGGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCcgtcg > 1:940057/1‑150 (MQ=255) tCAGGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCcgtcgt < 1:82275/150‑1 (MQ=255) aGGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTAc < 2:940057/150‑1 (MQ=255) aaTGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTACTCGa > 1:293743/1‑150 (MQ=255) aTGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTACTCGAc < 1:54198/150‑1 (MQ=255) ccACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTACTCGACCAt > 2:1026284/1‑150 (MQ=255) ccACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTACTCGACCAt > 1:594749/1‑150 (MQ=255) gACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGGACTCGACCATTTCCAgc < 2:651755/150‑1 (MQ=255) aCCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTACTCGACCATTTCCAgcg < 1:105574/150‑1 (MQ=255) cgAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTACTCGACCATTTCCAGCGCCCGGCCGAACTGa < 1:971874/150‑1 (MQ=255) gAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTACTCGACCATTTCCAGCGCCCGGCCGAACTGAg > 2:792683/1‑150 (MQ=255) aaTGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTACTCGACCATTTCCAGCGCCCGGCCGAACTGAGt < 1:898912/150‑1 (MQ=255) tGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTACTCGACCATTTCCAGCGCCCGGCCGAACTGAGTGGCAc > 1:1029543/1‑150 (MQ=255) gAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTACTCGACCATTTCCAGCGCCCGGCCGAACTGAGTGGCAcc > 1:923561/1‑150 (MQ=255) gAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTACTCGACCATTTCCAGCGCCCGGCCGAACTGAGTGGCAcc > 1:695670/1‑150 (MQ=255) aGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTACTCGACCATTTCCAGCGCCCGGCCGAACTGAGTGGCACCg < 1:451911/150‑1 (MQ=255) ggAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTACTCGACCATTTCCAGCGCCCGGCCGAACTGAGTGGCACCgg < 2:627664/150‑1 (MQ=255) aaTGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTACTCGACCATTTCCAGCGCCCGGCCGAACTGAGTGGCACCGGGTg > 1:1052182/1‑150 (MQ=255) cTGGATATCCACCCGGTTGACCATCAGACCACCGAAAAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAAGTCCTTAAAGGGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTACTCGACCATTTCCCGCGCCGGGCCGAACTGAGTGGCACCGGGTGCagc > 1:1055625/1‑148 (MQ=255) tGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTACTCGACCATTTCCAGCGCCCGGCCGAACTGAGTGGCACCGGGTGCATcc > 2:421733/1‑150 (MQ=255) ggATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTACTCGACCATTTCCAGCGCCCGGCCGAACTGAGTGGCACCGGGt > 1:953153/1‑143 (MQ=255) ggATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTACTCGACCATTTCCAGCGCCCGGCCGAACTGAGTGGCACCGGGt < 2:953153/143‑1 (MQ=255) tatatCCTCCCTGTTGACCATCATGCCGCCGAATAGCAGCATGCCGGGCTGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTACTCCACCATTTCCAGCGCCCGGCCGAACTGAGTGGCACCGGGTGCATCCgg < 2:260591/149‑1 (MQ=255) aCCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTACTCGACCATTTCCAGCGCCCGGCCGAACTGAGAGGCACCGGGTGCATCCGGGCAATAg > 2:195065/1‑150 (MQ=255) cccGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTACTCGACCATTTCCAGCGCCCGGCCGAACTGAGTGGCACCGGGTGCATCCGGGTAATAGt > 2:627235/1‑150 (MQ=255) aCCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTACTCGACCATTTCCAGCGCCCGGCCGAACTGAGTGGCACCGGGTGCATCCGGGTAATAGTCGGGCgag > 2:337255/1‑150 (MQ=255) catcatGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTggcatgatggtcaaccgggtggatatccagcatttcctcagcattcgccgctcacccaggtcgctgtggcattgcctgaagttgatggcgcgttacgcgcgcgaccgcctgcagca < 2:760676‑M2/150‑117 (MQ=255) catGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTACTCGACCATTTCCAGCGCCCGGCCGAACTGAGTGGCACCGGGTGCATCCGGGTAATAGTCGGGCGAGAGTgg < 2:293743/150‑1 (MQ=255) catGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTACTCGACCATTTCCAGCGCCCGGCCGAACTGAGTGGCACCGGGTGCATCCGGGTAATAGTCGGGCGAGAGTgg < 1:616286/150‑1 (MQ=255) tGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTggcatgatggtcaaccgggtggatatccagcatttcctcagcattcgccgctcacccaggtcgctgtggcattgcctgaagt < 1:956122‑M2/111‑83 (MQ=255) tGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTggcatgatggtcaaccgggtggatatccagcatttcctcagcattcgccgctcacccaggtcgctgtggcattgcctgaagt > 2:956122‑M2/1‑29 (MQ=255) cgccgAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGACCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTACTCGACCATTTCCAGCGCCCGGCCGAACTGAGTGGCACCGGGTGCATCCGGGTAATAGTCGGGCGAGAGTGGGCGCa > 2:588211/1‑150 (MQ=255) | TGCGTTGCCGGTGGTAAGCCGGGTGCCGCGTGGGTGCTGCAGGCGGTCGCGCGCGTAACGCGCCATCAACTTCAGGCAATGCCACAGCGACCTGGGTGAGCGGCGAATGCTGAGGAAATGCTGGATATCCACCCGGTTGACCATCATGCCGCCGAACAGCAGCATGCCGGGCGGTGGCATCTGCAGGTCCTTGAAGCGTGTGCCCAGGCGCTTGCCGTCGTACTCGACCATTTCCAGCGCCCGGCCGAACTGAGTGGCACCGGGTGCATCCGGGTAATAGTCGGGCGAGAGTGGGCGCA > NC_002947/2981760‑2982058 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |