| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 3251122 = | 61 (1.410) | 5 (0.120) | 4/246 | NT | 8.4% | coding (464/546 nt) | ureJ | urease accessory protein UreJ |
| ? | NC_002947 | 3251156 = | 50 (1.190) | coding (498/546 nt) | ureJ | urease accessory protein UreJ | |||||
CGCTGCTGGCCATGGCCATGCCTGTGTTCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCGGTGGGTG > NC_002947/3250975‑3251267 | gaccgcccactccaggccttgcgaatcggcaaccccacccaccggccagccggtgccggccaactgcagcaggcgcagcagcgccaggtcgctgttcatcaaccggccagtaccagcgcggcgccggccaacaggccaccgccaaagGcc > 2:123991‑M1/148‑150 (MQ=255)gaccgcccactccaggccttgcgaataggtaaaaccacccaccggcaagccggggctggccaactgcagcaggcgcagcagcgccaggtcgctgttcatcaaccggccagtaccagcgcggcgccggccaacaggccaccgccaaagGcc > 2:124001‑M1/148‑150 (MQ=255) gccatggccatgCCTGTTTTCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGCAGCCCGAACTGGCCGAATCCCGCAATTAAGCGCGGTTTTTGTAATGGTCAGAGGAATTATACTAATGGCTGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTgc‑‑gc < 1:524097/150‑1 (MQ=255) atggccatgCCTGTGTTCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGc‑‑gccgc > 1:454444/1‑150 (MQ=255) ggccatgCCTGTGTTCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCca < 1:9255/150‑1 (MQ=255) gccatgCCTGTGTTCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCcac > 1:157839/1‑150 (MQ=255) ccatgCCTGTGTTCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCcaca < 1:1005562/150‑1 (MQ=255) ccatgCCTGTGTTCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCcaca > 2:487061/1‑150 (MQ=255) atgCCTGTGTTCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGc > 1:930481/1‑150 (MQ=255) cTGTGTTCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGcc > 2:60760/1‑150 (MQ=255) tgtgTTCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCt > 2:489292/1‑150 (MQ=255) ggtaaaaccacccaccggcaagccggggctggccaactgcagcaggcgcagcagcgccaggtcgctgttcatcaaccggccagtaccagcgcggcgccggccaacaggccaccgccaaagGCCTTCTGCAGGCCGCCACAGCGGCCTGCa > 1:1057996‑M1/121‑150 (MQ=255) cGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGaa > 1:550650/1‑150 (MQ=255) cGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGaa < 1:827954/150‑1 (MQ=255) gCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAg < 1:1053727/150‑1 (MQ=255) gCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGACTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAg > 1:727859/1‑150 (MQ=255) cATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGc > 2:428614/1‑150 (MQ=255) cATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGc > 1:479636/1‑150 (MQ=255) gggCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGcc > 1:1103098/1‑150 (MQ=255) acaTGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGtt > 1:969/1‑150 (MQ=255) tGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGc > 1:183621/1‑150 (MQ=255) gCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCg < 1:60760/150‑1 (MQ=255) gTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGTAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGgc < 2:1116493/150‑1 (MQ=255) gTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGgc > 1:625681/1‑150 (MQ=255) tAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGgcg > 1:418230/1‑150 (MQ=255) ccACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCgcgc < 2:863936/150‑1 (MQ=255) ccACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGGCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCgcgc > 2:433013/1‑150 (MQ=255) aCGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTg > 2:306867/1‑150 (MQ=255) cGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTgg < 1:150051/150‑1 (MQ=255) cGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTg > 2:211478/1‑117 (MQ=255) cGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTg < 1:211478/117‑1 (MQ=255) gAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACt > 1:610437/1‑150 (MQ=255) cgcgTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGc > 1:440898/1‑150 (MQ=255) cagcgccaggtcgctgttcatcaaccggccagtaccagcgcggcgccagccaacaggccaccgccaaagCCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAg < 2:573800‑M1/29‑1 (MQ=255) cagcgccaggtcgctgttcatcaaccggccagtaccagcgcggcgccagccaacaggccaccgccaaagCCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAg > 1:573800‑M1/70‑98 (MQ=255) tGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTtga < 1:487061/150‑1 (MQ=255) tGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTtga < 2:183621/150‑1 (MQ=255) ggCGATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTg < 2:616056/67‑1 (MQ=255) ggCGATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTg < 2:616139/67‑1 (MQ=255) ggCGATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTg > 1:616056/1‑67 (MQ=255) ggCGATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTg > 1:616139/1‑67 (MQ=255) aaTTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGaa > 2:187621/1‑150 (MQ=255) aaTTCAGCGCGGGGTTTGACGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGCTTGATGaa > 2:279989/1‑150 (MQ=255) ttCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACa < 1:236926/150‑1 (MQ=255) cgGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGCCCGGCGCCGCGCTGGTACTGTCCGGTTGATGAATAGCGACCt > 2:607996/1‑150 (MQ=255) gTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGgcg > 2:319786/1‑150 (MQ=255) tCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCgctgct > 2:288546/1‑150 (MQ=255) gTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCtgctgc > 2:1023660/1‑150 (MQ=255) gccagtaccagcgcggcgccggccaacaggccaccgccaaagGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTg > 1:494162‑M1/43‑92 (MQ=255) gccagtaccagcgcggcgccggccaacaggccaccgccaaagGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTg < 2:494162‑M1/50‑1 (MQ=255) tCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGc < 1:190310/41‑1 (MQ=255) tCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGc > 2:190310/1‑41 (MQ=255) cAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACTGCGACCTGGCGCTGCTGCGCctg < 2:550650/150‑1 (MQ=255) aGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCctgc > 2:570307/1‑150 (MQ=255) gCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCctgct < 1:123754/150‑1 (MQ=255) ggCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCgg < 1:1045316/56‑1 (MQ=255) ggCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCgg > 2:1045316/1‑56 (MQ=255) gCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCa < 2:930481/150‑1 (MQ=255) cTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAg < 2:355907/150‑1 (MQ=255) ttGCTGCTGGCGGCAGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCGGTTGGCCGGCGCCGGGCTGGTACTGGCCGGTTGATGCACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGt > 2:506934/1‑150 (MQ=255) tgctgGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGc < 1:322768/150‑1 (MQ=255) ctgGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCa < 1:319786/150‑1 (MQ=255) tgGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAg < 2:26945/150‑1 (MQ=255) ggcggGCTATGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGcccc < 2:610437/150‑1 (MQ=255) gcggGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCg < 1:489292/150‑1 (MQ=255) cggGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCgg < 2:454444/150‑1 (MQ=255) cggGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCgg < 2:223345/150‑1 (MQ=255) gggCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCAGCAGCGccag < 2:609509/129‑3 (MQ=255) gggCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCAGCAGCGccag > 1:609509/1‑127 (MQ=255) gCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCtt > 2:840972/1‑150 (MQ=255) tttGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGc > 1:190321/1‑150 (MQ=255) gTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCCGCCTTTCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCggtgg < 1:607996/150‑1 (MQ=255) gTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCggtgg < 1:428614/150‑1 (MQ=255) gTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCggtgg < 2:440898/150‑1 (MQ=255) ggTTGCCTGCTGC‑‑GCCACCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCggtgggtg < 2:955305/150‑1 (MQ=255) | CGCTGCTGGCCATGGCCATGCCTGTGTTCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCGGTGGGTG > NC_002947/3250975‑3251267 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |