New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5385527 = | 43 (0.990) | 5 (0.130) | 4/234 | NT | 11.7% | coding (210/1146 nt) | lldD | L‑lactate dehydrogenase |
? | NC_002947 | 5385567 = | 36 (0.900) | coding (250/1146 nt) | lldD | L‑lactate dehydrogenase |
TGTTCCACTACGCTGACGGCGGCGCCTACGCCGAGCACACCCTGCGCCACAACGTCTCGGACCTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAG > NC_002947/5385379‑5385663 | tGTTCCACTACGCTGACGGCGGCGCCTACGCCGAGCACACCCTGCGCCACAACGTCTCGGACCTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCa > 1:150490/1‑150 (MQ=255) gTTCCACTACGCTGACGGCGGCGCCTACGCCGAGCACACCCTGCGCCACAACGTCTCGGACCTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCAt > 1:147804/1‑150 (MQ=255) cttgagtacatacagctggaaccacatcggccggttgatggcgggtgccacttcttcgatcgggcacaccgacacagtcgacatggtgaacgggatgccatgggccgccgctgcgcgtgcggcctgcacttcgccacggcgggcgtaCAt < 1:497279‑M1/3‑1 (MQ=255) ttgagtacatacagctggaaccacatcggccggttgatggcgggtgccacttcttcgatcgggcacaccgacacagtcgacatggtgaacgggatgccatgggccgccgctgcgcgtgcggcctgcacttcgccacggcgggcgtaCATg < 2:958370‑M1/4‑1 (MQ=255) cACTACGCTGACGGCGGCGCCTACGCCGAGCACACCCTGCGCCACAACGTCTCGGACCTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCg > 2:843663/1‑150 (MQ=255) aCGCTGACGGCGGCGCCTACGCCGAGCACACCCTGCGCCACAACGTCTCGGACCTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTgg < 2:363412/150‑1 (MQ=255) tGACGGCGGCGCCTACGCCGAGCACACCCTGCGCCACAACGTCTCGGACCTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCtt < 2:1065613/150‑1 (MQ=255) aCGGCGGCGCCTACGCCGAGCACACCCTGCGCCACAACGTCTCGGACCTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTgg < 2:1073823/150‑1 (MQ=255) cTACGCCGAGCACACCCTGCGCCACAACGTCTCGGACCTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGCCGAAACCCTGAGCATGGCGGTGGGCAAGGCCCCAGGCgg > 2:869512/1‑150 (MQ=255) cacCCTGCGCCACAACGTCTCGGACCTGGAAGGGATGGCCCTTCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCAt < 2:88854/150‑1 (MQ=255) ccTGCGCCACAACGTCTCGGACCTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTTGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTa > 1:282132/1‑150 (MQ=255) gcgggtgccacttcttcgatcgggcacaccgacacagtcgacatggtgaacgggatgccatgggccgccgctgcgcgtgcggcctgcacttcgccacggcgggcgtaCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTAc > 1:640072‑M1/108‑150 (MQ=255) tGCGCCACAACGTCTCGGACCTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTAcg > 1:546065/1‑150 (MQ=255) tcGGACCTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGaa > 1:28810/1‑150 (MQ=255) tcGGACCTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGaa > 2:299209/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCa < 2:147804/150‑1 (MQ=255) cTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCCGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAg > 2:179677/1‑150 (MQ=255) tGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAgg < 2:48776/150‑1 (MQ=255) gCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACTGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCa < 2:258892/150‑1 (MQ=255) ccTGCGCCAGCGCGTGCTGAAAAACATGTCCCAGCTCATGCTGGACAGCAGGGGGTTCGACGCAACGCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGTCCCGCTCGGCCTCGCCGGCCTGTAAGCCCGCCGGGGCGAAGGGCAGGCCGCCCGCGCAgc > 2:349672/1‑150 (MQ=255) acatggtgaacgggatgccatgggccgccgctgcgcgtgcggcctgcacttcgccacggcgggcgtaCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGc < 1:229307‑M1/37‑1 (MQ=255) acatggggaacgggatgccatgggccgccgctgcgcgtgcggcctgcacttcgccacggcgggcgtaCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGc > 2:229307‑M1/68‑104 (MQ=255) cAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGATGATACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGcc > 2:1122063/1‑150 (MQ=255) cAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGcc > 1:877796/1‑150 (MQ=255) tGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATcc > 1:958370/1‑150 (MQ=255) caacaTGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGtt > 2:112903/1‑150 (MQ=255) aacaTGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCGCGTTc > 1:471563/1‑150 (MQ=255) catgggccgccgctgcgcgtgcggcctgcacttcgccacggcgggcgtgCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGc > 1:888078‑M1/50‑86 (MQ=255) catgggccgccgctgcgcgtgcggcctgcacttcgccacggcgggcgtgCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGc < 2:888078‑M1/37‑1 (MQ=255) caTGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCAACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCAc > 1:261814/1‑150 (MQ=255) aTGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTgg > 1:1129325/1‑101 (MQ=255) aTGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTgg < 2:1129325/101‑1 (MQ=255) ccGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGt > 2:452055/1‑150 (MQ=255) cGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGt < 1:65039/149‑1 (MQ=255) cGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGt > 2:65039/1‑149 (MQ=255) cTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACt < 1:119441/150‑1 (MQ=255) gCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCgg > 1:590157/1‑61 (MQ=255) gCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCgg < 2:590157/61‑1 (MQ=255) gCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTgtgt < 2:28810/150‑1 (MQ=255) gAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGgtg > 2:461512/1‑150 (MQ=255) cAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGc < 1:990937/52‑1 (MQ=255) cAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGc > 2:990937/1‑52 (MQ=255) cAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGccc > 2:100478/1‑150 (MQ=255) aGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGa > 1:104468/1‑150 (MQ=255) ttCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGGTCgtg < 1:869512/150‑3 (MQ=255) gacgaAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTgtgt > 1:29103/1‑130 (MQ=255) gacgaAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTgtgt < 2:29103/130‑1 (MQ=255) acgaAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGaagaag > 2:594798/1‑150 (MQ=255) cccTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAgc > 2:757700/1‑85 (MQ=255) cccTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAgc < 1:757700/85‑1 (MQ=255) ccTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCa > 2:151654/1‑93 (MQ=255) ccTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCa < 1:151654/93‑1 (MQ=255) | TGTTCCACTACGCTGACGGCGGCGCCTACGCCGAGCACACCCTGCGCCACAACGTCTCGGACCTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAG > NC_002947/5385379‑5385663 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |