New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5385527 = | 43 (0.990) | 5 (0.130) | 4/234 | NT | 11.7% | coding (210/1146 nt) | lldD | L‑lactate dehydrogenase |
? | NC_002947 | 5385567 = | 36 (0.900) | coding (250/1146 nt) | lldD | L‑lactate dehydrogenase |
CCTGCGCCACAACGTCTCGGACCTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAGTGGCACCCGCCATCAACCGGCCGATGTGGTTCCAGCTGTATGTACTCAAGGA > NC_002947/5385419‑5385715 | ccTGCGCCACAACGTCTCGGACCTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTTGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTa > 1:282132/1‑150 (MQ=255) gcgggtgccacttcttcgatcgggcacaccgacacagtcgacatggtgaacgggatgccatgggccgccgctgcgcgtgcggcctgcacttcgccacggcgggcgtaCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTAc > 1:640072‑M1/108‑150 (MQ=255) tGCGCCACAACGTCTCGGACCTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTAcg > 1:546065/1‑150 (MQ=255) tcGGACCTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGaa > 1:28810/1‑150 (MQ=255) tcGGACCTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGaa > 2:299209/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCa < 2:147804/150‑1 (MQ=255) cTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCCGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAg > 2:179677/1‑150 (MQ=255) tGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAgg < 2:48776/150‑1 (MQ=255) gCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACTGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCa < 2:258892/150‑1 (MQ=255) ccTGCGCCAGCGCGTGCTGAAAAACATGTCCCAGCTCATGCTGGACAGCAGGGGGTTCGACGCAACGCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGTCCCGCTCGGCCTCGCCGGCCTGTAAGCCCGCCGGGGCGAAGGGCAGGCCGCCCGCGCAgc > 2:349672/1‑150 (MQ=255) cAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGATGATACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGcc > 2:1122063/1‑150 (MQ=255) cAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGcc > 1:877796/1‑150 (MQ=255) tGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATcc > 1:958370/1‑150 (MQ=255) caacaTGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGtt > 2:112903/1‑150 (MQ=255) aacaTGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCGCGTTc > 1:471563/1‑150 (MQ=255) caTGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCAACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCAc > 1:261814/1‑150 (MQ=255) aTGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTgg > 1:1129325/1‑101 (MQ=255) aTGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTgg < 2:1129325/101‑1 (MQ=255) ccGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGt > 2:452055/1‑150 (MQ=255) cGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGt < 1:65039/149‑1 (MQ=255) cGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGt > 2:65039/1‑149 (MQ=255) cTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACt < 1:119441/150‑1 (MQ=255) gCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTgtgt < 2:28810/150‑1 (MQ=255) gAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGgtg > 2:461512/1‑150 (MQ=255) cAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGccc > 2:100478/1‑150 (MQ=255) aGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGa > 1:104468/1‑150 (MQ=255) ttCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGGTCgtg < 1:869512/150‑3 (MQ=255) gacgaAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTgtgt > 1:29103/1‑130 (MQ=255) gacgaAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTgtgt < 2:29103/130‑1 (MQ=255) acgaAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGaagaag > 2:594798/1‑150 (MQ=255) cccTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAgc < 1:757700/85‑1 (MQ=255) cccTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAgc > 2:757700/1‑85 (MQ=255) ccTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCa < 1:151654/93‑1 (MQ=255) ccTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCa > 2:151654/1‑93 (MQ=255) gtacatgccggtgaggccgaccggggccaaggccaccggcatgTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAGTGGCACCCGc > 1:640072‑M2/44‑150 (MQ=255) gccggtgaggccgaccggggccaaggccaccggcatgTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCCCCATGt > 2:229307‑M2/38‑104 (MQ=255) gccggtgaggccgaccggggccaaggccaccggcatgTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGt < 1:229307‑M2/67‑1 (MQ=255) gccggtgaggccgaccggggccaaggccaccggcatgCACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATg < 2:888078‑M2/49‑1 (MQ=255) gccggtgaggccgaccggggccaaggccaccggcatgCACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATg > 1:888078‑M2/38‑86 (MQ=255) CCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAGTGGCACCCGCCATCAAc > 2:1119763‑M1/1‑150 (MQ=255) GGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAGTGGCACCCGCCATCAACCGGcc > 2:150490‑M1/1‑150 (MQ=255) ccTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAGTGGCACCCGCCATCAACCGGCCGa > 2:814321/1‑150 (MQ=255) cccGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAGTGGCACCCGCCATCAACCGGCCGATGTGGtt > 1:474135/1‑150 (MQ=255) ccGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAGTGGCACCCGCCATCAACCGGCCGATGTGGTTc < 1:461512/150‑1 (MQ=255) ggcGGCCTCACCGGCATGTAAGCCGGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGGTCATGGTGTCGCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAGTGGCACCCGCCATCAACCGGCCGATGTGGTTCCAg < 1:299209/148‑1 (MQ=255) cGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAGTGGCACCCGCCATCAACCGGCCGATGTGGTTCCAGCt < 2:154230/150‑1 (MQ=255) gCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAGTGGCACCCGCCATCAACCGGCCGATGTGGTTCCAGCtgt < 2:104468/150‑1 (MQ=255) ccTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCTCCCTGTGGTGGGTGTCCAGAACTGACAGCGGAGAAGGGGCACCCGCCATCAACCGGCCGATGTGGTGCCAGCtgta > 1:976495/1‑150 (MQ=255) ccTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAGTGGCACCCGCCATCAACCGGCCGATGTGGTTCCAGCtgta > 1:1105660/1‑150 (MQ=255) cTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAGTGGCACCCGCCATCAACCGGCCGATGTGGTTCCAGCtgtat < 2:261814/150‑1 (MQ=255) tCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGCAGTGAAAGAGGCCAGCAACCGGCCGATGTGGTTCCAGCtgtatg > 2:932643/1‑150 (MQ=255) tCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAGTGGCACCCGCCATCAACCGGCCGATGTGGTTCCAGCtgtatg > 2:497279/1‑150 (MQ=255) catgTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAGTGGCACCCGCCATCAACCGGCCGATGTGGTTCCAGCTGTATGTACTCaa < 2:958370‑M2/146‑1 (MQ=255) atgTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAGTGGCACCCGCCATCAACCGGCCGATGTGGTTCCAGCTGTATGTACTCAAg < 1:497279‑M2/147‑1 (MQ=255) gTACGCCCCCCGTGGCGCGGGGCGTGCGGTACGCCTAGTCTCGGCTCTTGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAGTGGCACCCGCCATCAACCGGCCGATGTGGTTCCAGCTGTATGTACTCATggt < 1:879550/150‑2 (MQ=255) | CCTGCGCCACAACGTCTCGGACCTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAGTGGCACCCGCCATCAACCGGCCGATGTGGTTCCAGCTGTATGTACTCAAGGA > NC_002947/5385419‑5385715 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |