New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5168706 = | 65 (1.500) | 4 (0.100) | 4/244 | NT | 6.9% | coding (276/1365 nt) | PP_4547 | glutamine synthetase |
? | NC_002947 | 5168744 = | 45 (1.080) | coding (314/1365 nt) | PP_4547 | glutamine synthetase |
CACCATCCTTGGCCTGACCCTCAACGGCGACGACGTGGAAAACTCCGGCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCGGTGATGGCCTGCGAGCTGGAGTTCTACCTGCTCGACCAGCAGC > NC_002947/5168595‑5168887 | cACCATCCTTGGCCTGACCCTCAACGGCGACGACGTGGAAAACTCCGGCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGt < 2:647554/150‑1 (MQ=255) cATCCTTGGCCTGACCCTCAACGGCGACGACGTGGAAAACTCCGGCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAg > 1:657667/1‑150 (MQ=255) cATCCTTGGCCTGACCCTCAACGGCGACGACGTGGAAAACTCCGGCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCAATAGCGGCCGGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAg > 1:619801/1‑150 (MQ=255) tCAACGGCGACGACGTGGAAAACTCCGGCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAgg < 2:484011/150‑1 (MQ=255) gacgacGTGGAAAACTCCGGCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCg > 2:755348/1‑150 (MQ=255) gacgTGGAAAACTCCGGCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGcc > 2:227920/1‑150 (MQ=255) acgTGGAAAACTCCGGCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCa < 2:726180/150‑1 (MQ=255) acgTGGAAAACTCCGGCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCa < 1:929032/150‑1 (MQ=255) aaaCTCCGGCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATcgc < 1:1124096/150‑1 (MQ=255) aaaCTCCGGCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATcgc < 2:442517/150‑1 (MQ=255) aaCTCCGGCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATcgcg > 1:534518/1‑150 (MQ=255) ggCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCa < 1:236649/150‑1 (MQ=255) ggACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGtgct > 1:469578/1‑150 (MQ=255) tCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGtgctgctgc < 2:911399/150‑1 (MQ=255) gCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCa > 1:1064352/1‑150 (MQ=255) aTCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATc > 2:770916/1‑150 (MQ=255) tCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCg > 2:471346/1‑150 (MQ=255) gACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGaa > 1:989418/1‑150 (MQ=255) cTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGc < 1:979645/150‑1 (MQ=255) gCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGt < 1:799736/150‑1 (MQ=255) gCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGt < 1:942861/150‑1 (MQ=255) ccGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCCAAGGAAACACACTCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGtt > 2:641082/1‑150 (MQ=255) ccGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCAGATTCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGGGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGtt > 1:1050925/1‑150 (MQ=255) tGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGaa < 2:1064352/150‑1 (MQ=255) tGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGACCACCGCCCCAGTGACTCCACTCAGGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGaa < 1:860798/150‑1 (MQ=255) tACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGcc > 2:277155/1‑150 (MQ=255) tACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGcc < 2:989418/150‑1 (MQ=255) aCCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCg > 1:880722/1‑150 (MQ=255) cGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATg < 1:970068/150‑1 (MQ=255) gCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATgg < 1:128650/150‑1 (MQ=255) ttGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGtt < 2:260572/150‑1 (MQ=255) ggCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATg > 1:338628/1‑142 (MQ=255) ggCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATg < 2:338628/142‑1 (MQ=255) ggCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGAAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCAc > 2:609374/1‑150 (MQ=255) cAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCAccc < 2:469578/150‑1 (MQ=255) aGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCg < 1:682862/150‑1 (MQ=255) aGCCTGGTGCGCCTGACCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGTATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCg < 2:813987/150‑1 (MQ=255) gCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCAACGTCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCgg < 1:641082/150‑1 (MQ=255) ccTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCGGt < 2:880722/150‑1 (MQ=255) ggTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGAAAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCGGTGAt > 2:1113487/1‑150 (MQ=255) gcCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCGGTGATGGCCt < 1:277155/150‑1 (MQ=255) cctgcactgcggcggtgggcacccggcgccagggcaggTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCGGTGATGGCCTg > 1:1111385‑M2/39‑150 (MQ=255) CTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGtgctg < 2:234274‑M1/96‑1 (MQ=255) CTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGtgctg > 1:234274‑M1/1‑96 (MQ=255) CTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCGGTGATGGCCTGc > 1:471346‑M1/1‑150 (MQ=255) CTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCGGTGATGGCCTGc > 2:660347‑M1/1‑150 (MQ=255) CTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGAAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCGGTGATGGCCTGc > 1:609374‑M1/1‑150 (MQ=255) tgcactgcggcggtgggcacccggcgccagggcaggTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATg < 1:650544‑M2/90‑1 (MQ=255) tgcactgcggcggtgggcacccggcgccagggcaggTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATg > 2:650544‑M2/37‑126 (MQ=255) TGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCGGTGATGGCCTGCg < 1:266375‑M1/150‑1 (MQ=255) CCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCGGTGATGgcctgaaaa > 1:770916‑M1/1‑146 (MQ=255) gcgcCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCGGTGATGGCCTGCGAGCTGGa > 1:500445/1‑150 (MQ=255) gcgcCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCGGTGATGGCCTGCGAGCTGGa < 1:227920/150‑1 (MQ=255) ggcggtgggcacccggcgccagggcaggTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCGGTGATGGCCTGCGAGCTGGAg < 2:1111385‑M2/122‑1 (MQ=255) gcCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCGGTGATGGCCTGCGAGCTGGAGt < 2:619801/150‑1 (MQ=255) cACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCGGTGATGGCCTGCGAGCTGGAGTTCTACCTGCt > 1:600973/1‑150 (MQ=255) aCCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCGGTGATGGCCTGc < 1:253400/129‑1 (MQ=255) aCCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCGGTGATGGCCTGc > 2:253400/1‑129 (MQ=255) aCCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCGGTGATGGCCTGCGAGCTGGAGTTCTACCTGCTc > 2:709661/1‑150 (MQ=255) tGCAGGTGAGCATGCATCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCGGTGATGGCCTGCGAGCTGGAGGTCTACCTGCTCGACCagcagc > 2:463518/1‑150 (MQ=255) | CACCATCCTTGGCCTGACCCTCAACGGCGACGACGTGGAAAACTCCGGCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCGGTGATGGCCTGCGAGCTGGAGTTCTACCTGCTCGACCAGCAGC > NC_002947/5168595‑5168887 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |