| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5506637 | 56 (1.130) | 23 (0.590) | 15/206 | 1.8 | 33.2% | intergenic (+48/‑151) | PP_4839/cycA | iron‑regulated membrane protein/D‑alanine/beta‑alanine/D‑serine/glycine permease |
| ? | NC_002947 | = 5506650 | 49 (1.260) | intergenic (+61/‑138) | PP_4839/cycA | iron‑regulated membrane protein/D‑alanine/beta‑alanine/D‑serine/glycine permease | |||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
GCTGGGGGTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCA > NC_002947/5506490‑5506783 | gctggGGGTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGa < 2:514481/150‑1 (MQ=255)gctggGGGTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGa < 1:1184023/150‑1 (MQ=255)gctggGGGTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGa < 1:1183676/150‑1 (MQ=255) ctggGGGTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaac > 1:305309‑M1/1‑147 (MQ=255) ctggGGGGGATGTTGCCGGTGGTGGGGCTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑g < 1:291653/150‑1 (MQ=255) ggggTGTTGTGCCCGTTGGTGGGGGTGGCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑Ga < 1:252429/150‑1 (MQ=255) ggggTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑g‑g‑g > 2:618713/1‑149 (MQ=255) ggggTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑g‑g‑g < 1:618713/149‑1 (MQ=255) ggTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GAcc > 1:229724/1‑150 (MQ=255) aTGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGt < 1:723830/150‑1 (MQ=255) tGTTCCCGCTTGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGCTGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGtt < 1:222315/150‑1 (MQ=255) tGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaacgcggtccctc < 1:634265‑M1/150‑14 (MQ=255) ttCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGGGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTTAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgt < 2:260486‑M2/150‑3 (MQ=255) cccGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaacgcggtccctcgtag < 1:1112344‑M1/150‑18 (MQ=255) cccGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtag > 1:668658‑M2/1‑146 (MQ=255) cccGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtag > 1:856055‑M2/1‑146 (MQ=255) cGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaacgcggtccctcgtagga < 1:1010369‑M1/150‑20 (MQ=255) gtggtgggGGTGTCAATGGTGTTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaacgcggtccctcgtaggagc < 1:164739‑M1/149‑22 (MQ=255) ctcgtgtgggTGTCGATGGTGGTGATGGGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCCGTACCGGACTCGTCGCGGCTGAACCCGCTCCGACaacgcggtccctcgtaggagc < 1:222008‑M1/147‑22 (MQ=255) ggtggGGGTGTCGGTGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaacgcggtccctcgtaggagcgg < 1:58386‑M1/150‑24 (MQ=255) ggtggGGGTGTCGATTGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGTCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACagcgcggtccctcgtaggagcgg < 1:476985‑M1/150‑24 (MQ=255) ggtggGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgg > 2:733490‑M2/1‑140 (MQ=255) ggtggGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTCGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaacgcggtccctcgtaggagcgg < 1:686483‑M1/150‑24 (MQ=255) gtggGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGTTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGTGGTGTAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaacgcggtccctcgtaggagcggg < 1:83860‑M1/150‑25 (MQ=255) gtggGGGTGTCGATGGTGGGGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaacgcggtccctcgtaggagcggg < 1:1073770‑M1/150‑25 (MQ=255) gtggGGGGGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaacgcggtccctcgtaggagcggg < 2:304196‑M1/150‑25 (MQ=255) tgcgggTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGACAGTTGCGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGt < 1:697273/147‑1 (MQ=255) gggTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGGGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggttta < 1:926160‑M2/150‑16 (MQ=255) gcgttgatggtGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaacgcggtccctcgtaggagcgggtttacc < 1:1135320‑M1/145‑31 (MQ=255) gtCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGATTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccg < 2:906776‑M2/150‑20 (MQ=255) gATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcga < 2:37051‑M2/150‑23 (MQ=255) aTGGGGGTGGTGTGGGCGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaa > 2:1069303‑M2/1‑127 (MQ=255) gtggtgATGTGGGGGGAGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaagag < 2:247559‑M2/150‑27 (MQ=255) ggggTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGc < 1:906776/150‑1 (MQ=255) tGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGaaa < 1:973021/150‑1 (MQ=255) tGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGaaa > 2:1113114/1‑150 (MQ=255) aTAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGCG‑GTCC‑C‑TCgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaa < 1:418056‑M2/150‑46 (MQ=255) gTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGa < 1:868847/150‑1 (MQ=255) gTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGa < 2:1080894/150‑1 (MQ=255) ggtggtGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCg > 1:62418/1‑150 (MQ=255) ggtggtGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAA‑C‑GCGGTCCC‑TCgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctcaa > 2:418056‑M2/1‑98 (MQ=255) gtgAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaaga > 2:541221‑M2/1‑94 (MQ=255) gtgAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaaga < 1:541221‑M2/119‑26 (MQ=255) gtgAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCGTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGaaaa > 2:1220418/1‑150 (MQ=255) aGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGc > 2:458809/1‑150 (MQ=255) gcgcCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaacgcggtccctcgtaggagcgg < 2:467492‑M1/99‑24 (MQ=255) gcgcCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaacgcggtccctcgtaggagcgg > 1:467359‑M1/1‑76 (MQ=255) gcgcCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaacgcggtccctcgtaggagcgg > 1:467492‑M1/1‑76 (MQ=255) gcgcCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCag < 2:229724/150‑1 (MQ=255) gccgccGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCagag > 1:82547/1‑150 (MQ=255) 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tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcggggttacccgcgaagaggccggtacaggcgacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgcctcaccaccaaactatccacaccccacaccaccacc < 1:94330‑M2/150‑113 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaacgcggtccctcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgcctcaccaccaaactatccaccgcccacaccacccccat > 2:1069303‑M1/1‑23 (MQ=255) tCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaacgcggtccctcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgcctcaccaccaaactatccaccccccacatcaccaccatc < 2:37051‑M1/150‑129 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTCCTACaacgcggtccctcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctcaatcgctggccaagacccggcggcgcctcaccaccaaactatccaccccccacatcaccaccatcgac < 2:906776‑M1/150‑132 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGACCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGa > 2:1047265/1‑150 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACaacgcggtccctcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgcctcaccaccaaactatccaccccccacatcaccaccatcgacacc > 2:483309‑M1/1‑16 (MQ=255) tAAACCCGCTCCTACaacgcggtccctcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgcctcaccaccaaactatcccccccccacatcaccaccatcgacaccc < 1:926160‑M1/150‑136 (MQ=255) aaCCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGc < 1:22765/76‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgcctcaccaccaaactatccaccccccacatcaccaccatcgacccccccac < 2:304196‑M2/150‑127 (MQ=255) cccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgcctcaccaccaaactatccaccccccacatccccaccatcgacacccccac < 1:1073770‑M2/150‑127 (MQ=255) cccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctacaccactggccaagacccggcggcgcctcaccaacaaactatccaccccccacatcaccaccatcgacacccccac < 1:83860‑M2/150‑127 (MQ=255) cccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACaagaa < 1:1047265/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACaacgcggtccctcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgcctcaccaccaaactatccactcgccacatcaccaccatcgacacccccacc > 1:877680‑M1/1‑10 (MQ=255) ccGCTCCTACaacgcggtccctcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgcctcaccaccaaactatccaccccccacatcaccaccatcgacacccccacc > 2:733490‑M1/1‑10 (MQ=255) ccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggtacaggcgacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgcctcaccaccaaactatccaccccccacatcaccaccatcgacacccccacc < 1:686483‑M2/150‑128 (MQ=255) ccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggtacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgcctcaccaccaaactatccaccccccacatcaccaccaccgacacccccacc < 1:58386‑M2/150‑128 (MQ=255) ccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgcctcaccaccaaactatccaccccccacatcaccaccatcgacacccccacc < 2:680226‑M2/150‑128 (MQ=255) ccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgc > 1:467359‑M2/1‑23 (MQ=255) ccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgc < 2:467492‑M2/99‑77 (MQ=255) ccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgc < 2:467359‑M2/99‑77 (MQ=255) ccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACaagaag > 1:115850/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACaagaag > 2:764494/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGCTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggacagcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgcctcaccaccaaactatccaccccccacatcaccacaatcgacacccccacc < 1:476985‑M2/150‑128 (MQ=255) gCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgcctcaccaccaaactatccaccccccacatcaacaccattgacacccccaccac < 1:164739‑M2/150‑130 (MQ=255) cTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACt < 2:62418/150‑1 (MQ=255) tCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgcctcaccaccaaactatccaccccccacatcaccaccatcgacacccccaccagcg < 1:1010369‑M2/150‑132 (MQ=255) tCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTg > 1:733786/1‑150 (MQ=255) cTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgcctcaccaccaaactatccaccccccacatcaccaccatcgacacccccaccagcggg < 1:1112344‑M2/150‑134 (MQ=255) | GCTGGGGGTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCA > NC_002947/5506490‑5506783 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |