| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5506637 | 56 (1.130) | 23 (0.590) | 15/206 | 1.8 | 33.2% | intergenic (+48/‑151) | PP_4839/cycA | iron‑regulated membrane protein/D‑alanine/beta‑alanine/D‑serine/glycine permease |
| ? | NC_002947 | = 5506650 | 49 (1.260) | intergenic (+61/‑138) | PP_4839/cycA | iron‑regulated membrane protein/D‑alanine/beta‑alanine/D‑serine/glycine permease | |||||
TGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCAGCCTATGACGCAAA > NC_002947/5506501‑5506797 | tGTTCCCGCTTGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGCTGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGtt < 1:222315/150‑1 (MQ=255) ttCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGGGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTTAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgt < 2:260486‑M2/150‑3 (MQ=255) cccGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtag > 1:856055‑M2/1‑146 (MQ=255) cccGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtag > 1:668658‑M2/1‑146 (MQ=255) ggtggGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgg > 2:733490‑M2/1‑140 (MQ=255) ggtggGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGCGAGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgg > 1:877680‑M2/1‑140 (MQ=255) tgcgggTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGACAGTTGCGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGt < 1:697273/147‑1 (MQ=255) gggTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGGGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggttta < 1:926160‑M2/150‑16 (MQ=255) ggTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttac > 2:483309‑M2/1‑134 (MQ=255) gtCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGATTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccg < 2:906776‑M2/150‑20 (MQ=255) gATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcga < 2:37051‑M2/150‑23 (MQ=255) aTGGGGGTGGTGTGGGCGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaa > 2:1069303‑M2/1‑127 (MQ=255) ggtggtGATGTGGAGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaaga < 2:743358‑M2/150‑26 (MQ=255) gtggtgATGTGGGGGGAGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaagag < 2:247559‑M2/150‑27 (MQ=255) ggtgATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggc < 2:411754‑M2/150‑29 (MQ=255) ggtgATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAA‑C‑G‑CGGTCCCTCgtaggagcgggtttacccgcgaagaggc > 2:305309‑M2/1‑122 (MQ=255) gATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCgg > 1:1080894/1‑150 (MQ=255) ggggTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGc < 1:906776/150‑1 (MQ=255) tGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGaaa < 1:973021/150‑1 (MQ=255) tGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGaaa > 2:1113114/1‑150 (MQ=255) aTAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGCG‑GTCC‑C‑TCgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaa < 1:418056‑M2/150‑46 (MQ=255) gTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGa < 1:868847/150‑1 (MQ=255) gTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGa < 2:1080894/150‑1 (MQ=255) ggtggtGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCg > 1:62418/1‑150 (MQ=255) ggtggtGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAA‑C‑GCGGTCCC‑TCgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctcaa > 2:418056‑M2/1‑98 (MQ=255) gtgAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaaga > 2:541221‑M2/1‑94 (MQ=255) gtgAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaaga < 1:541221‑M2/119‑26 (MQ=255) gtgAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCGTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGaaaa > 2:1220418/1‑150 (MQ=255) aGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGc > 2:458809/1‑150 (MQ=255) gcgcCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCag < 2:229724/150‑1 (MQ=255) gccgccGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCagag > 1:82547/1‑150 (MQ=255) ccgGGTCTTGGTCAGGGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGCCCTCTTCGCGGGAAAACCCGCTCCAACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGa < 1:260486/150‑1 (MQ=38) cgGGTCTTGGCCACCCCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGAt < 1:752612/150‑1 (MQ=255) gTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAAGGCAGAGTCGATCTg > 2:1111503/1‑150 (MQ=255) tCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGt > 2:55005/1‑150 (MQ=255) gCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCgcgc < 1:55005/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCATCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACa > 2:1167420/1‑108 (MQ=255) gCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCATCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACa < 1:1167420/108‑1 (MQ=255) aGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGcccc > 1:1011683/1‑150 (MQ=255) aGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGcccc < 1:411754/150‑1 (MQ=255) 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tgtgCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTtagc < 1:37051/150‑1 (MQ=255) gCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGGGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTtagccta < 2:926160/150‑1 (MQ=255) tGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAGATGCTGAGGCCACAAAGCAGAGGCGATCTGCCGCGCCCCGAGCTGGAACGCGCGTGTtagcctcgc > 2:75479/1‑150 (MQ=37) tGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTc > 2:548515/1‑116 (MQ=255) tGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTc < 1:548515/116‑1 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCg < 2:82547/150‑1 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ggTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGACCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGa > 2:1047265/1‑150 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGAc < 1:247559/150‑1 (MQ=255) aaCCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGc > 2:22765/1‑76 (MQ=255) aaCCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGc < 1:22765/76‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgcctcaccaccaaactatccaccccccacatcaccaccatcgacccccccac < 2:304196‑M2/150‑127 (MQ=255) cccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgcctcaccaccaaactatccaccccccacatccccaccatcgacacccccac < 1:1073770‑M2/150‑127 (MQ=255) 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ccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgc < 2:467492‑M2/99‑77 (MQ=255) ccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgc < 2:467359‑M2/99‑77 (MQ=255) ccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgc > 1:467492‑M2/1‑23 (MQ=255) ccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgc > 1:467359‑M2/1‑23 (MQ=255) ccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACaagaag > 1:1032378/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACaagaag > 1:115850/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACaagaag > 2:764494/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGCTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggacagcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgcctcaccaccaaactatccaccccccacatcaccacaatcgacacccccacc < 1:476985‑M2/150‑128 (MQ=255) gCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtcggagcgggttcagccgcgacgagtccggtacgggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgcctcaccaccaaactatccaccccccccatcaccaccatcgacacccacacgag < 1:222008‑M2/150‑130 (MQ=255) gCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgcctcaccaccaaactatccaccccccacatcaacaccattgacacccccaccac < 1:164739‑M2/150‑130 (MQ=255) cTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACt < 2:62418/150‑1 (MQ=255) tCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgcctcaccaccaaactatccaccccccacatcaccaccatcgacacccccaccagcg < 1:1010369‑M2/150‑132 (MQ=255) tCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTg > 1:733786/1‑150 (MQ=255) cTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgcctcaccaccaaactatccaccccccacatcaccaccatcgacacccccaccagcggg < 1:1112344‑M2/150‑134 (MQ=255) cTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCTATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCa < 1:458809/150‑1 (MQ=255) gA‑G‑G‑GACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgcctcaccaccaaactatccaccccccacatcaccaccatcgacacccccaccagcgggaaca < 1:634265‑M2/150‑138 (MQ=255) a‑G‑G‑GAGCTCGTTGTAGGGGCGGGTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCAGCCTa < 1:75479/150‑1 (MQ=255) a‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCAGCCTa < 1:1111503/150‑1 (MQ=255) a‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCAGCCTa < 2:1032378/150‑1 (MQ=255) g‑g‑gACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctcaagcgctggcaaagaccc < 1:875752‑M2/79‑69 (MQ=255) g‑g‑gACCGCGTTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctcaagcgctggcaaagaccc > 2:875752‑M2/1‑11 (MQ=255) g‑g‑gACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCAGCCTAt < 2:1011683/150‑1 (MQ=255) gTTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagcacaggcaacacaaggctcaagcgctggccaagacccggcggcgcctcaccaccaaactatccaccccccacatcaccaccatcgacacccccaccagcgggaacatcacccccag > 1:305309‑M2/1‑3 (MQ=255) | TGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCAGCCTATGACGCAAA > NC_002947/5506501‑5506797 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |