New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4876390 = | 60 (1.220) | 3 (0.070) | 3/224 | NT | 5.3% | intergenic (+183/+254) | PP_4284/pucM | transporter/5‑hydroxyisourate hydrolase |
? | NC_002947 | 4876494 = | 54 (1.230) | intergenic (+287/+150) | PP_4284/pucM | transporter/5‑hydroxyisourate hydrolase |
ATACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCAC > NC_002947/4876243‑4876539 | gtcgctagaagaatcttcgtaggtcctttggcccgctctcacactggcgggctttttttcgtctgctgttttttgcgttgcctgtgccggcctcttcgcgggtgaacccgctcctacgacgggctgtgtccaactgtccaccccgtgGTa < 1:1188357‑M1/3‑1 (MQ=255) gCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCAACCCGCCGTTCACAGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGc < 2:171788/150‑1 (MQ=255) gaagaatcttcgtaggtcctttggcccgctctcacactggcgggctttttttcgtctgctgttttttgcgttgcctgtgccggcctcttcgcgggtgaacccgctcctacgacgggctgtgtccaactgtccaccccgtgGTAGGAGCgg > 2:958985‑M1/141‑150 (MQ=255) ccGTGGTAGGAGCGGGCTCGCCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCCCCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCgg < 2:197181/150‑1 (MQ=255) ccGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCgg < 2:1244737/150‑1 (MQ=255) ccGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCgg < 2:642002/150‑1 (MQ=255) aagaatcttcgtaggtcctttggcccgctctcacactggcgggctttttttcgtctgctgttttttgcgttgcctgtgccggcctcttcgcgggtgaacccgctcctacgacgggctgtgtccaactgtccaccccgtgGTAGGAGCggg > 2:511605‑M1/140‑150 (MQ=255) aagaatcttcgtaggtcctttggcccgctctcacactgacgtgcgtattttcgtctgctgttttttgcgttgcctgtgccggcctcttcgcgggtgaacccgctcctacgacgggctgtgtccaactgtccaccccgtgGTAGGAGCggg < 2:887586‑M1/11‑1 (MQ=255) tcgtAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTG‑CACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTc < 2:142316/150‑1 (MQ=255) gtAGGAGCGGGTTCACACGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCa < 2:382243/150‑1 (MQ=255) gtcctttggcccgctctcacactggcgggctttttttcgtctgctgttttttgcgttgcctgtgccggcctcttcgcgggtgaacccgctcctacgacgggctgtgtccaactgtccaccccgtgGTAGGAGCggg < 2:521735‑M1/11‑1 (MQ=255) gtcctttggcccgctctcacactggcgggctttttttcgtctgctgttttttgcgttgcctgtgccggcctcttcgcgggtgaacccgctcctacgacgggctgtgtccaactgtccaccccgtgGTAGGAGCggg > 1:521735‑M1/126‑136 (MQ=255) ctccACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCGCCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAaga < 2:176746/147‑1 (MQ=255) tCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAgg < 2:1086015/150‑1 (MQ=255) cACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAggc < 1:812211/150‑1 (MQ=255) aCCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAggcc > 1:734111/1‑150 (MQ=255) cccGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCAATTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAggccg < 1:12421/150‑1 (MQ=255) ccGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACGGACGCCGACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAggccgg > 1:796196/1‑150 (MQ=18) aaGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCCCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGGTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCctgc > 1:673438/1‑150 (MQ=255) aGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCAACGTATTCGCGGGTCAACCCGCTCCTACCGCGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGAGGGTTCACCCGCGGAGAGGCCGGCCctgct > 2:890129/1‑150 (MQ=17) tgGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTAcc > 2:696008/1‑150 (MQ=255) cAATCCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAggccggcc > 2:1070667/1‑127 (MQ=255) cAATCCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAggccggcc < 1:1070667/127‑1 (MQ=255) cAATCCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACccgac > 1:599102/1‑148 (MQ=255) ccgccgTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACCGCCCGCCGTACGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGtt < 1:890129/150‑1 (MQ=255) ccgccgTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGtt > 1:1126101/1‑150 (MQ=255) cgccgTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTgg < 2:919479/123‑1 (MQ=255) cgccgTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTgg > 1:919479/1‑123 (MQ=255) gccgTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTgc < 2:1126101/150‑1 (MQ=255) cgTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGCCAGTTGGATACCGCCCGCCGTAGGGGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTgccg > 1:270300/1‑150 (MQ=255) cgTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTgccg > 1:421500/1‑150 (MQ=255) gTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCACCACACGTGTGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTgccgc > 1:863097/1‑150 (MQ=25) ccGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGccacca > 1:579037/1‑150 (MQ=255) ccGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTCAGGCCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGccacca > 1:391273/1‑150 (MQ=255) gTTCCTGCCCCCATCGTATTCTCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCaccacc < 2:673438/150‑1 (MQ=255) ccgccACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATGCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTcc > 1:1173651/1‑149 (MQ=255) gccTCCGTATCCGAGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCAGTAGGAGCGGCTTCACCCGCGAATAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTcgcg < 2:270300/150‑1 (MQ=18) ccACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCgg > 1:702900/1‑150 (MQ=255) ccACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGACGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCgg < 2:599102/150‑1 (MQ=255) ccACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGAGGACAGTTGGATACAGCACGCCGTAGGAGCGGGATCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTTGCCAATCTCAACGCGACGTATACAGTTGCCGTCACGACCGCagtggctg > 2:1195829/1‑143 (MQ=18) cttcgcgggtgaacccgctcctacgacgggctgtgtccaactgtccaccccgtgGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAAccc > 2:287808‑M1/55‑150 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCt > 2:751612/1‑150 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTcc > 1:556921/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACg > 2:437245/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCAcc > 1:604011/1‑104 (MQ=255) ccGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCAcc < 2:604011/104‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACgg < 1:468417/150‑1 (MQ=255) ccgctcctacgacgggctgtgtccaactgtccaccccgtgGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAAc < 2:687403‑M1/94‑1 (MQ=255) ccgctcctacgacgggctgtgtccaactgtccaccccgtgGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAAc > 1:687403‑M1/41‑134 (MQ=255) cGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAggccg > 1:366277/1‑70 (MQ=255) cGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAggccg < 2:366277/70‑1 (MQ=255) cGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACggg < 2:702900/150‑1 (MQ=255) cGCCCCTACGCCGGTGGTGGGCAGTTGGCTTCAGCCCGTGGTAGGACCGGGGTCACTCCCGAAGAGGCGGGCCCTGCTGGCCAATCGCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCTCCGCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACggg < 2:522140/150‑1 (MQ=14) tCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTg < 1:1100370/150‑1 (MQ=255) cGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTg < 1:751612/150‑1 (MQ=255) cGGTGGTGGACAGGTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTg < 2:734111/150‑1 (MQ=255) aGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTCGGACACAGCCcg > 1:410944/1‑150 (MQ=255) aGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGATCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCcg > 1:1062744/1‑150 (MQ=255) ttGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGc > 1:885905/1‑57 (MQ=255) ttGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGc < 2:885905/57‑1 (MQ=255) ttGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCcgtc > 2:530045/1‑150 (MQ=255) ggATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGtttcca > 2:1025961/1‑80 (MQ=255) ggATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTtcca < 1:1025961/84‑2 (MQ=255) gATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTGCACTGTTGCCGCCACCACCGCATTAGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCCGCGTa > 2:403748/1‑150 (MQ=17) aGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTgccgcc < 1:835863/80‑1 (MQ=255) aGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTgccgcc > 2:835863/1‑80 (MQ=255) aGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGc > 1:901477/1‑150 (MQ=255) cccGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGTCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACCGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCgg < 1:425885/150‑1 (MQ=255) cccGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCgg < 1:206080/150‑1 (MQ=255) ccgccgTAGGTGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCggg < 1:820621/150‑1 (MQ=255) ccgccgTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTCGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCggg < 2:410944/150‑1 (MQ=255) cgccgTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGt < 1:262067/150‑1 (MQ=255) GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCAc < 1:920103‑M1/150‑1 (MQ=255) | ATACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCAC > NC_002947/4876243‑4876539 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |