New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5874604 = | 71 (1.450) | 6 (0.130) | 6/228 | NT | 8.1% | intergenic (‑40/+108) | PP_5148/ilvA‑II | membrane protein/threonine deaminase |
? | NC_002947 | 5874686 = | 71 (1.590) | intergenic (‑122/+26) | PP_5148/ilvA‑II | membrane protein/threonine deaminase |
TCGCCCTGACGGCGAGCGCGCCAGGTCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTC > NC_002947/5874455‑5874750 | tCGCCCTGACGGCGAGCGCGCCAGGTCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGcttct > 1:1026989/1‑150 (MQ=255) tCGCCCTGACGGCGAGCGCGCCAGGTCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGcttct > 1:960001/1‑150 (MQ=255) gtggtggcggggctgcaggtgccggaggacgaacgtcacctggtgccggcagcgctggccaagatcggttacccatactgggacgagaccgaaaacccggcctacaaactgttcctgggctgagcggctaagctagggctgatggccctt < 2:433768‑M1/1‑1 (MQ=255) gccaggACGGCGAGCGCGCGAGGTCAGGATCTCCAGGCCCAGGCCGCCCAGACACAGCCGCGCGGGGGCCATGATGTGCAGGGTCTGGAGCGTGGTCAGGTGTTCAATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCttcttc < 2:14426/145‑1 (MQ=255) cccTGACGGCGAGCGCGCCAGGTCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTcg > 1:1141378/1‑150 (MQ=255) cccTGACGGCGAGCGCGCCAGGTCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTACTTAAACTGGCATTTTGAG‑GTAGCTTCTTcg > 2:713007/1‑150 (MQ=255) tGACGGCGAGCGCGCCAGGTCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCgg < 2:960001/150‑1 (MQ=255) tGACGGCGAGCGCGCCAGGTCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCgg < 1:424772/150‑1 (MQ=255) ggggctgcaggtgccggaggacgaacgtcacctggtgccggcagcgctggccaagatcggttacccgtactgggacgagaccgaaaacccggcctacaaactgttcctgggctgagcggctaagctagggctgatggccctTTCGCGGGc > 2:149429‑M1/142‑150 (MQ=255) gAGCGCGCCAGGTCCAGATCGCTAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTAcc < 2:498949/150‑1 (MQ=255) aGCGCGCCAGGTCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTAccc < 2:339387/150‑1 (MQ=255) aGCGCGCCAGGTCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTAccc < 2:773720/150‑1 (MQ=255) tCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTTCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCaa > 1:590975/1‑150 (MQ=255) tCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCaa < 1:433742/150‑1 (MQ=255) aGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGt < 2:1026989/150‑1 (MQ=255) aGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATAATATACAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCATTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGt > 1:554018/1‑150 (MQ=255) aTCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATGTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTAt > 2:926939/1‑150 (MQ=255) gCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGcc < 2:767074/150‑1 (MQ=255) gCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGcc > 2:115578/1‑150 (MQ=255) gggCGCCCAGAAACAGCATCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAg < 1:514172/150‑1 (MQ=255) gggCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAg < 2:554018/150‑1 (MQ=255) ccAGAAACAGCAGCTCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTgc > 2:956267/1‑150 (MQ=255) ccAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTGTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTCAAGGCCTga < 1:820398/150‑2 (MQ=255) ccAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTgc > 2:935208/1‑150 (MQ=255) ccAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCAGCTCCTGCCaa < 2:300348/126‑1 (MQ=255) ccAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCAGCTCCTGCCaa > 1:300348/1‑126 (MQ=255) gccaagatcggttacccgtactgggacgagaccgaaaacccggcctacaaactgttcctgggctgagcggctaagctagggctgatggccctTTCGCGGGCtt > 2:264005‑M1/93‑103 (MQ=255) gccaagatcggttacccgtactgggacgagaccgaaaacccggcctacaaactgttcctgggctgagcggctaagctagggctgatggccctTTCGCGGGCtt < 1:264005‑M1/11‑1 (MQ=255) gcagcGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCt > 1:693714/1‑150 (MQ=255) ccaagatcggttacccgtactgggacgagaccgaaaacccggcctacaaactgttcctgggctgagcggctaagctagggctgatggccctTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCt < 2:895825‑M1/59‑1 (MQ=255) agcGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCtgt < 1:115578/150‑1 (MQ=255) ggcgGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTgg < 2:230274/149‑1 (MQ=255) atcggttacccgtactgggacgagaccgaaaacccggcctacaaactgttcctgggctgagcggctaagctagggctgatggccctTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTggg < 1:850180‑M1/64‑1 (MQ=255) tGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCg > 1:361739/1‑150 (MQ=255) tGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCg > 1:870575/1‑150 (MQ=255) ggCGATGATGTGCCGGGCTTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTAGTCCATACGTGTGC‑TCTTCCGATTAGGTTCTTCGCGCGTTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCgg < 1:1254525/150‑1 (MQ=255) ccgtactgggacgagaccgaaaacccggcctacaaactgttcctgggctgagcggctaagctagggctgatggccctTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCaa > 1:895825‑M1/78‑150 (MQ=255) gatgTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGc < 2:510092/150‑1 (MQ=255) gatgTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGc > 1:463352/1‑150 (MQ=255) cgtactgggacgagaccgaaaacccggcctacaaactgttcctgggctgagcggctaagctagggctgatggccctTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAg > 2:850180‑M1/77‑150 (MQ=255) atgTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTAGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCANGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGcc < 1:926939/150‑1 (MQ=255) gggTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTTCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGaaa < 2:590975/150‑1 (MQ=255) gggTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGaaa < 2:870575/150‑1 (MQ=255) ggTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGa > 2:51234/1‑109 (MQ=255) ggTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGa < 1:51234/109‑1 (MQ=255) 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aGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGc > 1:126398/1‑150 (MQ=255) ttCCATCTCGCCGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGc < 1:903713/150‑1 (MQ=255) tCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCcgc > 1:308201/1‑123 (MQ=255) tCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCcgc < 2:308201/123‑1 (MQ=255) ccATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCg > 2:296936/1‑150 (MQ=255) actgttcctgggctgagcggctaagctagggctgatggccctTTCGCggg > 2:1193313‑M1/43‑50 (MQ=255) actgttcctgggctgagcggctaagctagggctgatggccctTTCGCggg < 1:1193313‑M1/8‑1 (MQ=255) aTCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGtg > 1:1225625/1‑96 (MQ=255) aTCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCggg < 1:895568/111‑1 (MQ=255) aTCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCggg > 2:895568/1‑111 (MQ=255) aTCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGcc > 2:863394/1‑149 (MQ=255) aTCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTGTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTa < 2:1225625/97‑1 (MQ=255) tctcGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGACCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAg > 1:7353/1‑150 (MQ=255) tctcGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCATCTTCGCGGGATTACCGGCTCCAGCCAGGGTAGGTGAGTCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAg > 2:1110772/1‑150 (MQ=38) ggTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCa > 1:576450/1‑150 (MQ=255) ggTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCa < 1:956267/150‑1 (MQ=255) gtcgtcCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGctcagctcag < 1:351599/150‑1 (MQ=255) gtcgtcCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGctcagctcag > 2:351599/1‑150 (MQ=255) 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ttAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGt > 1:851590/1‑150 (MQ=255) aaCTTGCATTTTCCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTCCCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTg < 2:851590/150‑1 (MQ=255) aCTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGt < 2:693714/150‑1 (MQ=255) taagctagggctgatggccctTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCggg < 1:486817‑M1/70‑1 (MQ=255) taagctagggctgatggccctTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCggg > 2:486817‑M1/22‑91 (MQ=255) tGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAg > 1:1079359/1‑150 (MQ=255) gCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGc > 2:58982/1‑150 (MQ=255) ttttGCG‑GTAGCTTCTTCGTGGGCTGACCTGCGCCGTATGATGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGAGCTAATATTTGT‑GGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCNCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCgg < 1:863394/150‑1 (MQ=255) ttttGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCgg < 2:126398/150‑1 (MQ=255) gTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGTAGCgg < 2:879920/77‑1 (MQ=255) gTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGTAGCgg > 1:879920/1‑77 (MQ=255) gTAGCTTCTTCCCGGGCTTTCCCGTTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCg < 1:602466/150‑1 (MQ=255) tAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCAt > 2:884110/1‑97 (MQ=255) tAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCAt < 1:884110/97‑1 (MQ=255) tAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCgg < 2:1028236/150‑1 (MQ=255) ttcttcGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGtctc > 1:1049217/1‑150 (MQ=255) | TCGCCCTGACGGCGAGCGCGCCAGGTCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCG‑GTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCTGCCAAGGTATCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGC‑AGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTC > NC_002947/5874455‑5874750 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |