New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 461367 | 45 (0.920) | 3 (0.070) | 3/234 | NT | 6.4% | coding (1101/2301 nt) | pqqF | coenzyme PQQ synthesis protein F |
? | NC_002947 | = 461389 | 46 (1.000) | coding (1079/2301 nt) | pqqF | coenzyme PQQ synthesis protein F |
TTCAGCGCTGCCGGCAGCGGTTGCGCCTTGGCATGGGGCAGGTCAGCCTTCAGCAATGGGTCGACTGGCAGCAGCTGCCAATCGCCATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCTGTGCTGCAGTAAGCCGAATTGATGGTTCAACTGTTCGCGGTCGGCCTGACGGATGAACCTGAACCAACCTTGCAGCAGG > NC_002947/461242‑461538 | ttCAGCGCTGCCGGCAGCGGTTGCGCCTTGGCATGGGGCAGGTCAGCCTTCAGCAATGGGTCGACTGGCAGCAGCTGCCAATCGCCATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAgc < 1:756869‑M2/150‑3 (MQ=255) gcgcTGCCGGCAGCGGTTGCGCCTTGGCATGGGGCAGGTCAGCCTTTAGACATGCGTTTACTGGCAGCAGCTGCCAATCGCCATGGTCGGCACCTCGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAgcttgg > 2:304422‑M2/1‑144 (MQ=255) gcgcTGCCGGCAGCGGTTGCGCCTTGGCATGGGGCAGGTCAGCCTTCAGCAATGGGTCGACTGGCAGCAGCTGCCAATCGCCATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAgcttgg > 2:160264‑M2/1‑144 (MQ=255) gcgcTGCCGGCAGCGGTTGCGCCTTGGCATGGGGCAGGTCAGCCTTCAGCAATGGGTAGCCTCAGAACAGCTTGCAATCGCCATGGTCGGCACATAGCAGGCTTTAAAGAAGCCTTCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTgg < 1:1254308/150‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGCAGCGGTTGCGCCTTGGCATGGGGCAGGTCAGCCTTCAGCAATGGGTCGACTGGCAGCAGCTGCCAATCGCCATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAgcttggc > 2:625868‑M2/1‑143 (MQ=255) ccGGCAGCGGTTGCGCCTTGGCATGGGGCAGGTCAGCCTTCAGCAATGGGTCGACTGGCAGCAGCTGCCAATCGCCATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACg < 1:1011710/150‑1 (MQ=255) gCAGCGGTTGCGCCTTGGCATGGGGCAGGTCAGCCTTCAGCAATGGGTCGACTGGCAGCAGCTGCCAATCGCCATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCt > 2:790228/1‑150 (MQ=255) gcgcCTTGGCATGGGGCAGGTCAGCCTTCAGCAATGGGTCGACTGGCAGCAGCTGCCAATCGCCATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGc < 1:140497/150‑1 (MQ=255) cgcCTTGGCATGGGGCAGGTCAGCCTTCAGCAATGGGTCGACTGGCAGCAGCTGCCAATCGCCATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCt < 1:803702/150‑1 (MQ=255) ccTTGGCATGGGGCAGGTCAGCCTTCAGCAATGGGTCGACTGGCAGCAGCTGCCAATCGCCATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCt > 2:342526/1‑138 (MQ=255) ccTTGGCATGGGGCAGGTCAGCCTTCAGCAATGGGTCGACTGGCAGCAGCTGCCAATCGCCATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCt < 1:342526/138‑1 (MQ=255) tGGGGCAGGTCAGCCTTCAGCAATGGGTCGACTGGCAGCAGCTGCCAATCGCCATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCcggcgg < 1:853763/150‑1 (MQ=255) tGGGGCAGGTCAGCCTTCAGCAATGGGTCGACTGGCAGCAGCTGCCAATCGCCATGGTCGACAGGTCCGAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCcggcgg < 1:1253678/150‑1 (MQ=255) cAGCCTTCAGCAAGGGGTCGACTGGCAGCAGCTGCCAATCGCCATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGa < 2:415602/150‑1 (MQ=255) ttCAGCAATGGGTCGACTGGCAGCAGCTGCCAATCGCCATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGATTGGCGAACGACTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAgcgcg > 1:376746/1‑150 (MQ=255) cAGCAATGGGTCGACTGGCAGCAGCTGCCAATCGCCATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCt > 1:30123/1‑150 (MQ=255) tggcGATTGGCAGCTGCTGCCAGTCGACATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACtgt > 2:63573/4‑150 (MQ=255) cTGGCAGCAGCTGCCAATCGCCATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTc > 1:982413/1‑150 (MQ=255) cTGGCAGCAGCTGCCAATCGCCATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTc < 1:9726/150‑1 (MQ=255) tGGCAGCAGCTGCCAATCGCCATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCg < 1:43729/150‑1 (MQ=255) cagcagCTGCCAATCGCCATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGATTGGCGAACGACTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCt < 2:376746/150‑1 (MQ=255) cagcTGCCAATCGCCATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCtgtg < 2:30123/150‑1 (MQ=255) ccAATCGCCATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCTGTGCTGCAg < 2:1139678/150‑1 (MQ=255) cAATCGCCATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCTGTGCTGCAGt > 2:1078408/1‑150 (MQ=255) aaTCGCCATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCTGTGCTGCAGt < 2:700481/149‑1 (MQ=255) aaTCGCCATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCTGTGCTGCAGt > 1:700481/1‑149 (MQ=255) gCCATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCTGTGCTGCAGTAAGcc > 2:204660/1‑150 (MQ=255) cATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGACGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCcggcgg > 1:523730/1‑98 (MQ=255) cATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGACGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCcggcgg < 2:523730/98‑1 (MQ=255) tCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAgcgc < 1:133505/107‑1 (MQ=255) tCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAgcgc > 2:133505/1‑107 (MQ=255) tCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCAAAGCGCCTGCAACCCTTGGTTATCCAGGTGGGCGAACGGCTGGCCAGGGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGACCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCTGTGCTGCAGTAACCCGAATTGa < 2:280119/150‑1 (MQ=255) gCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCTGTGCTGCAGTAAGCCGAATTGATgg > 1:343342/1‑150 (MQ=255) cTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCTGTGCTGCAGTAAGCCGAATTGATGGTTCa > 2:1225813/1‑150 (MQ=255) ccAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCTGTGCTGCAGTAAGCCGAATTGATGGTTCAACt < 2:477416/149‑1 (MQ=255) aGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCTGTGCTGCAGTAAGCCGAATTGATGGTTCAACTGt > 1:876589/1‑150 (MQ=255) cagcagGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCTGTGCTGCAGTAAGCCGAATTGATGGTTCAACTGTTCGCGGTc < 1:204660/150‑1 (MQ=255) agcagGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAgcttggcgccctgctggaaagcctgccaggtgccgaccatggcgattggcagctgctgccagtcgacccattgctgaaggctgacctgccccatgccaaggcgcaaccgctgc < 2:61112‑M2/150‑114 (MQ=255) gcagGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCTGTGCTGCAGTAAGCCGAATTGATGGTTCAACTGTTCGCGGTCgg > 2:587760/1‑150 (MQ=255) ggCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCTGTGCTGCAGTAAGCCGAATTGATGGTTCAACTGTTCGCGGTCGGCCTg > 1:1235973/1‑150 (MQ=255) gcCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAgcttggcgccctgctggaaagcctgccaggtgccgaccatggcgattggcagctgctgccagtcgacccattgctgaaggctgacctgccccatgccaagg < 1:557317‑M2/130‑102 (MQ=255) gcCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAgcttggcgccctgctggaaagcctgccaggtgccgaccatggcgattggcagctgctgccagtcgacccattgctgaaggctgacctgccccatgccaagg > 2:557317‑M2/1‑29 (MQ=255) cAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCTGTGCTGCAGTAAGCCGAATTGATGGTTTCACTGTTCGCGGTCGGCCTGACGGa > 1:539434/1‑150 (MQ=255) cAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCTGTGCTGCAGTAAGCCGAATTGATGGTTCAACTGTTCGCGGTCGGCCTGACGGa < 2:1235973/150‑1 (MQ=255) cAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCTGTGCTGCAGTAAGCCGAATTGATGGTTCAACTGTTCGCGGTCGGCCTGACGGa > 2:558652/1‑150 (MQ=255) aaGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCTGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCTGTGCTGCAGTAAGCCGAATTGATGGTTCAACTGTTCGCGGTCGGCCTGACGGAt > 2:700341/1‑150 (MQ=255) aaGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCTGTGCTGCAGTAAGCCGAATTGATGGTTCAACTGTTCGCGGTCGGCCTGCCGGAt < 2:343342/150‑1 (MQ=255) tGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCTGTGCTGCAGTAAGCCGAATTGATGGTTCAACTGTTCGCGGTCGGCCTGACGGAtgaacctg > 2:975702/1‑150 (MQ=255) tGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCTGTGCTGCAGTAAGCCGAATTGATGGTTCAACTGTTCGCGGTCGGCCTGACGGAtgaacctg > 2:892856/1‑150 (MQ=255) aaCCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCTGTGCTGCAGTAAGCCGAATTGATGGTTCAACTGTTCGCGGTCGGCCTGACGGAtgaacctgaac < 1:790228/150‑1 (MQ=255) gggTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTg < 2:356644/62‑1 (MQ=255) gggTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTg > 1:356644/1‑62 (MQ=255) gggTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCtgtg < 2:142969/82‑1 (MQ=255) gggTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCtgtg > 1:142969/1‑82 (MQ=255) gTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCTGTGCTGCAGTAAGCCGAATTGATGGTTCAACTGTTCGCGGTCGGCCTGACGGATGAACCTGAACCAACCTTgc > 1:1229432/1‑150 (MQ=255) cAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCTGTGCTGCAGTAAGCCGAATTGATGGTTCAACTGTTCGCGGTCGGCCTGACGGATGAACCTGAACCAACCTTGcagcag > 1:91950/1‑150 (MQ=255) aGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCTGTGCTGCAGTAAGCCGAATTGATGGTTCAACTGTTCGCGGTCGGCCTGACGGATGAACCTGAACCAACCTTGCAGCAgg < 1:1078408/150‑1 (MQ=255) | TTCAGCGCTGCCGGCAGCGGTTGCGCCTTGGCATGGGGCAGGTCAGCCTTCAGCAATGGGTCGACTGGCAGCAGCTGCCAATCGCCATGGTCGGCACCTGGCAGGCTTTCCAGCAGGGCGCCAAGCGCCTGCAACCCTTGGGTATCCAGCTTGGCGAACGGCTGGCCAGTGCTGTCCCGGCGGGCCAACTCGAGCGCGCTGGCACTGTGCGCTCGGCTGTGCTGCAGTAAGCCGAATTGATGGTTCAACTGTTCGCGGTCGGCCTGACGGATGAACCTGAACCAACCTTGCAGCAGG > NC_002947/461242‑461538 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |