New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4625972 = | NA (NA) | 2 (0.060) +CGACCGCTGTACTCCACCAACCCCATTGCATTTGCCGC |
4/174 | NT | 4.8% | intergenic (+4519/+45) | PP_5654/PP_4091 | phosphotriesterase/transposase |
? | NC_002947 | 5401729 = | 57 (1.160) | intergenic (+1057/+111) | PP_4743/PP_4745 | hypothetical protein/transposase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
AACGCCAGCAACGTCCCATGCAATGCCTCTCGCGCGCTGCGCGTTTCATTCCCTTGTGCATCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGTGGAAGCCAAAGTTACCGTGGCATCTCTGGCGAACAGTTCCATGGCAGC > NC_002947/5401580‑5401876 | aaCGCCAGCAACGTCCCATGCAATGCCTCTCGCGCGCTGCGCGTTTCATTCCCTTGTGCATCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATc < 2:194504/150‑1 (MQ=255) cGCCAGCAACGTCCCATGCAATGCCTCTCGCGCGCTGCGCGTTTCATTCCCTTGTGCATCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGc < 1:1105754/150‑1 (MQ=255) ccAGCAACGTCCCATGCAATGCCTCTCGCGCGCTGCGCGTTTCATTCCCTTGTGCATCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCa < 2:1258379/150‑1 (MQ=255) cAGCAACGTCCCATGCAATGCCTCTCGCGCGCTGCGCGTTTCATTCCCTTGTGCATCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAg > 2:1010663/1‑150 (MQ=255) gTCCCATGCAATGCCTCTCGCGCGCTGCGCGTTTCATTCCCTTGTGCATCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCATTCGCCAGTAAC‑CGc < 2:791687/150‑1 (MQ=255) tGCCTCTCGCGCGCTGCGCGTTTCATTCCCTTGTGCATCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACt > 2:548483/1‑150 (MQ=255) tGCCGCTCGCGCGCTGCGCGTTTCATTCCCTTGTGCATCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAGC‑CGCCCCGTGTCACt < 1:44034/150‑1 (MQ=255) tctcGCGCGCTGCGCGTTTCATTCCCTTGTGCATCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTggcg > 2:63494/1‑150 (MQ=255) tcGCGCGCTGCGCGTTTCATTCCCTTGTGCATCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTgcccgc > 2:1126933/1‑145 (MQ=255) gcgcgcTGCGCGTTTCATTCCCTTGTGCATCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGccc < 1:375964/133‑1 (MQ=255) gcgcgcTGCGCGTTTCATTCCCTTGTGCATCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGccc > 2:375964/1‑133 (MQ=255) tGCGCGTTTCATTCCCTTGTGCATCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAc > 2:581077/1‑122 (MQ=255) tGCGCGTTTCATTCCCTTGTGCATCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAc < 1:581077/122‑1 (MQ=255) tGCGCGTTTCATTCCCTTGTGCATCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATg < 2:900382/150‑1 (MQ=255) gcgcGTTTCATTCCCTTGTGCATCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGc < 1:548483/150‑1 (MQ=255) cgTTTCATTCCCTTGTGCATCAACCGGCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAAt > 2:249674/1‑150 (MQ=255) gTTTCATTCCCTTGTGCATCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATg > 1:763846/1‑150 (MQ=255) aTTCCCTTGTGCATCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGtt > 1:836077/1‑150 (MQ=255) ttCCCTTGTGCATCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCgtg > 2:940736/1‑120 (MQ=255) ttCCCTTGTGCATCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCgtg < 1:940736/120‑1 (MQ=255) cccTTGTGCATCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTtggt < 2:19185/150‑1 (MQ=255) ccTTGTGCATCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTtggtg > 1:370183/1‑150 (MQ=255) ccTTGTGCATCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTtggtg < 1:63494/150‑1 (MQ=255) ttGTGCATCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGa < 2:763846/150‑1 (MQ=255) tgCATCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTa > 1:184613/1‑150 (MQ=255) gCATCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCCTGGTCAATCGCGAGTAAC‑TGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTAc < 2:422322/150‑1 (MQ=255) tCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGc < 2:983727/150‑1 (MQ=255) aaCCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTggcggcggc < 1:404863/120‑1 (MQ=255) aaCCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTggcggcggc > 2:404863/1‑120 (MQ=255) aCCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGcggt > 1:1089294/1‑150 (MQ=255) cccAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGcggtcggt > 2:364539/1‑150 (MQ=255) tCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCg > 1:22147/1‑140 (MQ=255) tCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCg < 2:22147/140‑1 (MQ=255) gtaggtggggttcatggatcggttaccgaccgctgtactccaccaaccccattgcatttgccgcCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTgg < 2:27630‑M2/26‑1 (MQ=255) gtaggtggggttcatggatcggttaccgaccgctgtactccaccaaccccattgcatttgccgcCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTgg > 1:27630‑M2/65‑90 (MQ=255) ccTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGcg < 1:1233779/126‑1 (MQ=255) ccTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGcg > 2:1233779/1‑126 (MQ=255) tctcCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCAc > 1:840275/1‑150 (MQ=255) cTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACa > 1:1251801/1‑114 (MQ=255) cTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACa < 2:1251801/114‑1 (MQ=255) gCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAAcccc > 2:25103/1‑136 (MQ=255) gCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAAcccc < 1:25103/136‑1 (MQ=255) gCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGt < 2:836077/150‑1 (MQ=255) ggCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGTgg > 1:401206/1‑150 (MQ=255) cccGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGTGGaa < 2:184613/150‑1 (MQ=255) cccGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGTGGaa < 1:197692/150‑1 (MQ=255) cccGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGTGGaa < 2:401206/150‑1 (MQ=255) cGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGTGGAAGc > 2:982467/1‑150 (MQ=255) agcagGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGTGGAAGCCaa > 1:80880/1‑150 (MQ=255) gTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGTTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGTGGAAGCCAAAGTTa > 1:128591/1‑150 (MQ=255) gTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGTGGAAGCCAAAGTTa > 2:936601/1‑150 (MQ=255) aGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGTGGAAGCCAAAGTTACCGTGGCAt > 1:134947/1‑150 (MQ=255) ccaaccccattgcatttgccgcCGCCAGTGACACGGGGCG‑GTTACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGTGGAAg < 2:184965‑M2/105‑1 (MQ=255) ccaaccccattgcatttgccgcCGCCAGTGACACGGGGCG‑GTTACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGTGGAAg > 1:184965‑M2/23‑127 (MQ=255) ggCGCTGTTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGTGGAAGCCAAAGTTACCGTGGCATCTCTgg < 2:128591/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGTGGAAGCCAAAGTTACCGTGGCATCTCTGGc < 1:982467/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGTGGAAGCCAAAGTTACCGTGGCATCTCTGGc > 2:779389/1‑150 (MQ=255) tgctAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGTGGAAGCCAAAGTTACCGTGGCATCTCTGGCGAAc > 2:1225112/1‑150 (MQ=255) gctAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGTGGAAGCCAAAGTTACCGTGGCATCTCTGGCGAACa < 1:958317/150‑1 (MQ=255) gctAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGTGGAAGCCAAAGTTACCGTGGCATCTCTGGCGAACa < 1:364539/150‑1 (MQ=255) aGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGTGGAAGCCAAAGTTACCGTGGCATCTCTGGCGAACAGtt < 1:249674/150‑1 (MQ=255) ttGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAAcc > 2:164852/1‑81 (MQ=255) ttGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAAcc < 1:164852/81‑1 (MQ=255) ttGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGTGGAAGCCAAAGTTACCGTGGCATCTCTGGCGAACAGTTCCa > 1:102938/1‑150 (MQ=255) tCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGTGGaa < 2:682511/109‑1 (MQ=255) tCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGTGGaa > 1:682511/1‑109 (MQ=255) tCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGTGGAAGCCAAAGTTACCGTGGCATCTCTGGCGAACAGTTCCATGgc > 1:987697/1‑150 (MQ=255) aaTCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGTGGAAGCCAAAGTTACCGTGGCATCTCTGGCGAACAGTTCCATGgcag < 1:593740/150‑1 (MQ=255) aaTCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGAAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGTGGAAGCCAAAGTTACCGTGGCATCTCTGGCGAACAGTTCCATGgcag > 1:413225/1‑150 (MQ=255) aTCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGTGGAAGCCAAAGTTACCGTGGCATCTCTGGCGAACAGTTCCATGgcagc > 1:591368/1‑150 (MQ=255) | AACGCCAGCAACGTCCCATGCAATGCCTCTCGCGCGCTGCGCGTTTCATTCCCTTGTGCATCAACCGCCCAGCCTGCCGGTATCGCCTCTCCCGCTTCAGCGGCCCGCAGCAGGTTCACGTAAGCCGTGGCGCTGCTAGCTTGGTCAATCGCCAGTAAC‑CGCCCCGTGTCACTGGCGGCGGCAAATGCAATGGGGTTGGTGGAGTACAGCGGTCGGTAACCGATCCATGAACCCCACCTACCACAAGGTGGAAGCCAAAGTTACCGTGGCATCTCTGGCGAACAGTTCCATGGCAGC > NC_002947/5401580‑5401876 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |