New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 594786 = | 122 (1.070) | 8 (0.080) | 6/214 | NT | 7.3% | intergenic (‑22/+105) | PP_0505/PP_0506 | hypothetical protein/ABC transporter permease |
? | NC_002947 | 594847 = | 95 (0.950) | intergenic (‑83/+44) | PP_0505/PP_0506 | hypothetical protein/ABC transporter permease |
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
GCGGCGCCAGTTGTGGCGGGATGACCGGGGCACCTTCAGGGATCAGTGCGGGCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCG > NC_002947/594638‑594929 | ccttgctggctatcatcctgggggccgcgttgctgatgggcagcgtgccggcgtggcgggcttaccggcaatcgctggctgacggcctgtccatacacctctgagtgcgcgtaatgatcaaacacctcaccgcctgcttcgcgggcacGc > 1:1216686‑M1/149‑150 (MQ=255) ggcgCCAGTTGTGGCGGGATGACCGGGGCACCTTCAGGGATCAGTGCGGGCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGccc < 1:448922/150‑1 (MQ=255) cgcCAGTTGTGGCGGGATGACCGGGGCACCTTCAGGGATCAGTGCGGGCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGc < 1:1903486/150‑1 (MQ=255) tggctatcatcctgggggccgcgttgctgatgggcagcgtgccggcgtggcgggcttaccggcaatcgctggctgacggcctgtccatacacctctgagtgcgcgtaatgatcaaacacctcaccgcctgcttcgcgggcacGCCCGCTc < 1:2402719‑M1/8‑1 (MQ=255) tggctatcatcctgggggccgcgttgctgatgggcagcgtgccggcgtggcgggcttaccggcaatcgctggctgacggcctgtccatacacctctgagtgcgcgtaatgatcaaacacctcaccgcctgcttcgcgggcacGCCCGCTc < 2:2233851‑M1/8‑1 (MQ=255) ccAGTTGTGGCGGGATGACCGGGGCACCTTCAGGGATCAGTGCGGGCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTc > 1:1110856/1‑150 (MQ=255) ccAGTTGTGGCGGGATGACCGGGGCACCTTCAGGGATCAGTGCGGGCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTc > 1:94599/1‑150 (MQ=255) ggctatcatcctgggggccgcgttgctgatgggcagcgtgccggcgtggcgggcttaccggcaatcgctggctgacggcctgtccatacacctctgagtgcgcgtaatgatcaaacacctcaccgcctgcttcgcgggcacGCCCGCTcc > 1:1309006‑M1/142‑150 (MQ=255) cAGTTGTGGCGGGATGACCGGGGCACCTTCAGGGATCAGTGCGGGCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGcgaa < 1:2171119/150‑4 (MQ=255) aGTTGTGGCGGGATGACCGGGGCACCTTCAGGGATCAGTGCGGGCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTccc > 2:1863876/1‑150 (MQ=255) tcatcctgggggccgcgttgctgatgggcagcgtgccggcgtggcgggcttaccggcaatcgctggctgacggcctgtccatacacctctgagtgcgcgtaatgatcaaacacctcaccgcctgcttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAg > 2:1734905‑M1/137‑150 (MQ=255) catcctgggggccgcgttgctgatgggcagcgtgccggcgtggcgggcttaccggcaatcgctggctgacggcctgtccatacacctctgagtgcgcgtaatgatcaaacacctcaccgcctgcttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAgg > 2:332494‑M1/136‑150 (MQ=255) gCGGGATGACCGGGGCACCTTCAGGGATCAGTGCGGGCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTa < 1:1885401/150‑1 (MQ=255) gggATGACCGGGGCACCTTCAGGGATCAGTGCGGGCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACt < 2:499925/150‑1 (MQ=255) gggATGACCGGGGCACCTTCAGGGATCAGTGCGGGCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACt < 2:1458904/150‑1 (MQ=255) ctgggggccgcgttgctgatgggcagcgtgccggcgtggcgggcttaccggcaatcgctggctgacggcctgtccatacacctctgagtgcgcgtaatgatcaaacacctcaccgcctgcttcgcgggcacGCCCGCTCCca > 2:2705072‑M1/132‑142 (MQ=255) ctgggggccgcgttgctgatgggcagcgtgccggcgtggcgggcttaccggcaatcgctggctgacggcctgtccatacacctctgagtgcgcgtaatgatcaaacacctcaccgcctgcttcgcgggcacGCCCGCTCCca < 1:2705072‑M1/11‑1 (MQ=255) ccGGGGCACCTTCAGGGATCAGTGCGGGCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAg < 2:2442374/150‑1 (MQ=255) ccGGGGCACCTTCAGGGATCAGTGCGGGCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAg < 1:1716568/150‑1 (MQ=255) ccGGGGCACCTTCAGGGATCAGTGCGGGCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAg > 1:2330349/1‑150 (MQ=255) ggggCACCTTCAGGGATCAGTGCGGGCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCt > 2:721800/1‑150 (MQ=255) gggCACCTTCAGGGATCAGTGCGGGCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTc > 1:2233851/1‑150 (MQ=255) aCCTTCAGGGATCAGTGCGGGCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCaaa < 1:721800/150‑1 (MQ=255) ttCAGGGATCAGTGCGGGCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGcc > 2:2370388/1‑150 (MQ=255) gggATCAGTGCGGGCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGc > 2:1754755/1‑145 (MQ=255) gggATCAGTGCGGGCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGACGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGc < 1:1754755/145‑1 (MQ=255) ggATCAGTGCGGGCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCgg > 1:54113/1‑150 (MQ=255) gATCAGTGCGGGCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCggg > 2:1960810/1‑150 (MQ=255) aTCAGTGCGGGCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCACAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCgggc < 2:2105442/150‑2 (MQ=255) tGCGGGCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTTCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCcccc > 1:2806116/1‑150 (MQ=255) ccggcgtggcgggcttaccggcaatcgctggctgacggcctgtccatacacctctgagtgcgcgtaatgatcaaacacctcaccgcctgcttcgcgggcacGc > 1:2107980‑M1/102‑103 (MQ=255) cccggCCAGTCCAGCTCCTTGGATTCGGCAGCACATAGTGGATTCGTTTGTTGCAACAGCTAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCt < 2:2806116/147‑1 (MQ=37) ggCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCtgtg < 2:1269002/150‑1 (MQ=255) gcgtggcgggcttaccggcaatcgctggctgacggcctgtccatacacctctgagtgcgcgtaatgatcaaacacctcaccgcctgcttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCtgtg > 2:50310‑M1/99‑150 (MQ=255) gCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTgg > 2:247962/1‑150 (MQ=255) gCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTgg < 1:271378/150‑1 (MQ=255) gCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTgg < 2:1607549/150‑1 (MQ=255) gCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTgg > 2:1119272/1‑150 (MQ=255) gCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTgg < 2:169692/150‑1 (MQ=255) cAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAg > 2:127691/1‑104 (MQ=255) aGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGc < 1:910163/150‑1 (MQ=255) cTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGcc > 1:724141/1‑150 (MQ=255) tGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCcg < 2:2177853/150‑1 (MQ=255) gggTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCcgc > 1:123925/1‑150 (MQ=255) gTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTcc > 1:1008587/1‑126 (MQ=255) gTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTcc < 2:1008587/126‑1 (MQ=255) cggcggCCCATAGAGGCATCGCTACCACCAACAGCAAGGCCAGCCGCCTGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGTGCATGCCCTCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGc < 1:989832/150‑1 (MQ=38) ccATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGt < 1:366203/150‑1 (MQ=255) cATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCCCCGCCGGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTg < 1:2091359/150‑1 (MQ=255) aTAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGc > 2:781872/1‑88 (MQ=255) aTAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGa < 2:1581599/150‑1 (MQ=255) tAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAg < 2:2606907/150‑1 (MQ=255) tAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAg < 1:1248587/150‑1 (MQ=255) tAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAg < 1:1191603/150‑1 (MQ=255) tAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAg > 1:1171234/1‑150 (MQ=255) agGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGca < 2:2710941/85‑1 (MQ=255) gCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGtt < 1:1155336/150‑1 (MQ=255) gCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGtt > 2:1655929/1‑150 (MQ=255) gCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGtt > 1:238414/1‑150 (MQ=255) gCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGtt > 1:230463/1‑150 (MQ=255) tCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGa < 1:1655929/150‑1 (MQ=255) tCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGa > 2:705961/1‑150 (MQ=255) 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> 2:1223685/1‑149 (MQ=255) cagcagCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCgg < 1:2780852/95‑1 (MQ=255) cagcaTGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCa > 1:1730288/1‑141 (MQ=255) agcaTGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATg < 2:724141/150‑1 (MQ=255) tcaaacacctcaccgcctgcttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTgg < 1:1945628‑M1/53‑1 (MQ=255) tcaaacacctcaccgcctgcttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTgg > 2:1945628‑M1/32‑84 (MQ=255) caTGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGa > 2:542119/1‑150 (MQ=255) caTGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGa > 2:3010488/1‑150 (MQ=255) gtgCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTTCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAg < 1:1299859/150‑1 (MQ=255) gtgCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGTTGTATGGACAg > 2:2027376/1‑150 (MQ=255) gCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGc < 2:2330349/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTg < 2:1874987/57‑1 (MQ=255) cGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCTTcagc < 1:1655467/150‑1 (MQ=255) ctcttcgcgggcacGACCGCTCCCACAGCTACTGCACATCGGTTATGGCGTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTcagccagc > 2:1110856‑M1/15‑150 (MQ=255) ctctTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTcagccagc < 1:1960810/150‑1 (MQ=255) ctctTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTcagccagc > 2:322092/1‑150 (MQ=255) tctTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCg > 1:784279/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGAt > 2:3057614/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGCCACGCCCGCTCCCAAAGCTCATACACCACCTCCGCAGCCGTCGGGGCCCCCTCTGGGAGCGGTCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGAt > 2:2339013/1‑150 (MQ=255) agcgGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTg > 2:3060040/2‑150 (MQ=255) gcgGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGc < 1:3057614/150‑1 (MQ=255) gggCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCCACCGGTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCg < 1:28350/150‑1 (MQ=255) gggCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGTGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCg < 1:1119272/150‑1 (MQ=255) gggCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTAcgc > 2:2644512/1‑107 (MQ=255) gggCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTAcgc < 1:2644512/107‑1 (MQ=255) gggCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCg < 1:3060040/150‑1 (MQ=255) | GCGGCGCCAGTTGTGGCGGGATGACCGGGGCACCTTCAGGGATCAGTGCGGGCCAGTCCAGCTCCTTGGGTTCGGCGGCCCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCG > NC_002947/594638‑594929 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |