New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | 958422 = | 83 (0.810) | intergenic (+66/‑127) | ykgJ/PP_0820 | ferredoxin/acetyltransferase |
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
GGGAGGGTGGGGTGCATAACCCGAGCTGTGATGATGCGCGGGCGGCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTCCCCAGC > NC_002947/958235‑958529 | gggAGGGTGGGGTGCATAACCCGAGCTGTGATGATGCGCGGGCGGCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAAtg < 2:2390502/150‑1 (MQ=255) gaaactgcggggtggggtcacgccggatctcctgtccattgctggggagatgacagtttaacgtcaagtgcagggttcaggcatctcgggcagctttgcagcccgtcgccggcaggttcaccacaggccaggagccttgcacgctacctg < 2:492936‑M1/2‑1 (MQ=255) gAGGGTGGGGTGCATAACCCGAGCTGTGATGATGCGCGGGCGGCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAAtgtg > 2:341284/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) ccGAGCTGTGATGATGCGCGGGCGGCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAAt < 1:1129105/129‑1 (MQ=255) ccGAGCTGTGATGATGCGCGGGCGGCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAAt > 2:1129105/1‑129 (MQ=255) ccGAGCTGTGATGATGCGCGGGCGGCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGAc > 2:2450229/1‑150 (MQ=255) gAGCTGTGATGATGCGCGGGCGGCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCgg > 1:354756/1‑137 (MQ=255) gCTGTGATGATGCGCGGGCGGCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCgg < 2:841779/150‑1 (MQ=255) gCTGTGATGATGCGCGGGCGGCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCACCTGGTCGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAATTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCgg < 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cTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCAc > 1:2789521/1‑150 (MQ=255) gATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTg < 2:2600330/79‑1 (MQ=255) aTCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTaaa < 1:2536975/150‑1 (MQ=255) cAGTCTGACGTGGTCAATGTTGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACATGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACt < 2:489691/150‑1 (MQ=255) tCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCAc < 1:558944/134‑1 (MQ=255) tCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCAc > 2:558944/1‑134 (MQ=255) tCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTc > 1:492936/1‑150 (MQ=255) tCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTc < 1:5486/150‑1 (MQ=255) cTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCa < 2:1228877/150‑1 (MQ=255) aCGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTgtggt < 1:1470162/78‑1 (MQ=255) aCGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTgtggt > 2:1470162/1‑78 (MQ=255) gTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCt > 2:44352/1‑114 (MQ=255) gTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCt < 1:403317/121‑1 (MQ=255) gTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCt > 2:403317/1‑121 (MQ=255) gTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTCCCCa < 1:1756038/150‑1 (MQ=255) cAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTCCCCAGc > 1:1349872/1‑150 (MQ=255) | GGGAGGGTGGGGTGCATAACCCGAGCTGTGATGATGCGCGGGCGGCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTCCCCAGC > NC_002947/958235‑958529 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |