New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | 958422 = | 83 (0.810) | intergenic (+66/‑127) | ykgJ/PP_0820 | ferredoxin/acetyltransferase |
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
GGCGGCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTCCCCAGCAATGGACAGGAGATCCGGCGTGACCCCACCCCGCAGTTTCCC > NC_002947/958275‑958571 | ggcggcGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGACGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGt < 1:1780529/150‑1 (MQ=255) tATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGGGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATCGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGc > 1:848897/1‑150 (MQ=255) tATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGc > 2:2536975/1‑150 (MQ=255) 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gTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAgg > 1:1720613/1‑150 (MQ=255) gccgccGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTcc < 1:1818792/150‑1 (MQ=255) gccgcTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGc < 2:638134/144‑1 (MQ=255) gccgcTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTgg < 2:2579106/150‑1 (MQ=255) gACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGAAGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCtgtg < 2:13291/150‑1 (MQ=255) cccGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTgtggtg > 2:2869618/1‑150 (MQ=255) ccGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGa > 1:2848295/1‑150 (MQ=255) cGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGaa < 1:616980/150‑1 (MQ=255) cGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGaa < 2:2682834/150‑1 (MQ=255) cGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTACGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGaa < 2:1684354/150‑1 (MQ=255) 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aaCGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGa > 1:2117038/1‑150 (MQ=255) aaCGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGa > 1:1683142/1‑150 (MQ=255) aaCGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGa > 1:2737309/1‑150 (MQ=255) tcgggcagctttgcagcccgtcgccggcaggttcaccacaggccaggagccttgcacgctaccTGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTa < 1:2552200‑M1/43‑1 (MQ=255) tcgggcagctttgcagcccgtcgccggcaggttcaccacaggccaggagccttgcacgctaccTGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTa > 2:2552200‑M1/64‑106 (MQ=255) cGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTg > 1:1962184/1‑150 (MQ=255) gCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACTCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGc > 1:678386/1‑147 (MQ=255) gCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGc < 2:678386/147‑1 (MQ=255) aTTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCaa > 1:1228877/1‑150 (MQ=255) ttGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCaaa < 2:1810214/150‑1 (MQ=255) gCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTgtggtg > 2:1277399/1‑123 (MQ=255) gCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTgtggtg < 1:1277399/123‑1 (MQ=255) cGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCaa > 2:1662500/1‑103 (MQ=255) cGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCaa < 1:1662500/103‑1 (MQ=255) cGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGaa > 1:620145/1‑123 (MQ=255) cGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGc > 2:5486/1‑150 (MQ=255) cGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGc > 1:1847118/1‑150 (MQ=255) atgatgGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCg < 1:2450229/150‑1 (MQ=255) 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1:576926‑M1/1‑135 (MQ=255) GCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTCCCCa < 2:576926‑M1/135‑1 (MQ=255) CTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGcc < 2:1954359‑M1/87‑1 (MQ=255) CTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGcc > 1:1954359‑M1/1‑87 (MQ=255) tttGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTccc > 2:1338565/1‑129 (MQ=255) tttGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTccc < 1:1338565/129‑1 (MQ=255) tGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTCCCCAGCAATGGACAGGAGATCCGGc < 2:2737309/150‑1 (MQ=255) gtggACGCGGCGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTCCCCAGCAATGGACAGGAGATCCGGc < 2:848897/147‑1 (MQ=255) cgGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGCACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTCCCCAGCAATGGACAGGAGATCCGGCGTGaccc < 2:1720613/150‑1 (MQ=255) gggCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTCCCCAGCAATGGACAGGAGATCCGGc < 1:756956/141‑1 (MQ=255) gggCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTCCCCAGCAATGGACAGGAGATCCGGc > 2:756956/1‑141 (MQ=255) gggCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTCCCCAGCAATGGACAGGAGATCCGGCGTGacccca > 1:2459892/1‑150 (MQ=255) ttccacaGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTCCCCAGCAATGGACAGGAGATCCGGCGTGACCCCACCCCGCa < 1:97188‑M2/143‑1 (MQ=255) ccacaGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTCCCCAGCAATGGa > 2:196592‑M2/6‑119 (MQ=255) ccacaGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTCCCCAGCAATGGa < 1:196592‑M2/114‑1 (MQ=255) caGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTCCCCAGCAATGGACAGGAGATCCGGCGTGACCCCACCCCGCAGTTTc < 2:492936‑M2/148‑1 (MQ=255) cggTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTccc < 2:2038477/104‑1 (MQ=255) aGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTccc > 1:2038477‑M2/2‑105 (MQ=255) aGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTCCCCAGCAATGGACAGGAGATCCGGCGTGACCCCACCCCGCAGTTTcc > 2:1257894‑M2/2‑150 (MQ=255) ggTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTCCCCAGCAATGGACAGGAGATCCGGCGTGACCCCACCCCGCAGTTTccc < 1:2764000/150‑1 (MQ=255) | GGCGGCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTCCCCAGCAATGGACAGGAGATCCGGCGTGACCCCACCCCGCAGTTTCCC > NC_002947/958275‑958571 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |