| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
CAACTTCGTCGCCCCGGCTTTCGTACTCAGCAACCTGGCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCCTGCCCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAGCTGTATACCGAGCACCCGGCCGGCGCCTATCACTACAGCAAGGGCATCAACCTGCG > NC_002947/4901622‑4901915 | cAACTTCGTCGCCACGGCTTTCGTACTCAGCAACCTGGCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCCTGCCCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTc > 2:1521059/1‑150 (MQ=255) gtgcggccggcacgaaggcggccacggcgcgcaggttgatgcccttgctgtagtgataggcgccggccgggtgctcggtatacagctccggcacgttgatgcagcctttgcgcagcaaccagtagtcggacatgatcacgccgtacagCg < 2:2707861‑M1/2‑1 (MQ=255) tgcggccggcacgaaggcggccacggcgcgcaggttgatgcccttgctgtagtgataggcgccggccgggtgctcggtatacagctccggcacgttgatgcagcctttgcgcagcaaccagtagtcggacatgatcacgccgtacagCgg > 2:104102‑M1/148‑150 (MQ=255) gcggccggcacgaaggcggtcacggcgcgcaggttgatgcccttgctgtagtgataggcgccggccgggtgctcggtatacagctccggcacgttgatgcagcctttgcgcagcaaccagtagtcggacatgatcacgccgtacagCggg > 1:567773‑M1/147‑150 (MQ=255) ttCGTCGCCCCGGCTTTCGTACTCAGCAACCTGGCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCCTGCCCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGc > 2:679739/1‑150 (MQ=255) ttCGTCGCCCCGGCTTTCGTACTCAGCAACCTGGCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCCTGCCCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGc > 1:1122395/1‑150 (MQ=255) tcgCCCCGGCTTTCGTACTCAGCAACCTGGCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCCTGCCCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGCCTgg > 1:1540081/1‑150 (MQ=255) tcgCCCCGGCTTTCGTACTCAGCAACCTGGCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCCTGCCCTGGAACCTGTACAACAGCCAGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGCCTgg > 2:388519/1‑150 (MQ=255) acgaaggcggccacggcgcgcaggttgatgcccttgctgtagtgataggcgccggccgggtgctcggtatacagctccggcacgttgatgcagcctttgcgcagcaaccagtagtcggacatgatcacgccgtacagCggg < 2:2818885‑M1/4‑1 (MQ=255) ccGGCTTTCGTACTCAGCAACCTGGCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCCTGCCCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGCCTGGGCGc‑‑c > 1:1599764/1‑150 (MQ=255) ccGGCTTTCGTACTCAGCAACCTGGCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCACGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCCTGCCCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGCCTGGGCGc‑‑c > 1:1148361/1‑150 (MQ=255) ggCTTTCGTACTCAGCAACCTGGCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCCTGCCCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGCCTGGGCGC‑‑CCt < 1:2251915/150‑1 (MQ=255) cTTTCGTACTCAGCAACCTGGCGCCGCGCCACCTGAGTTCCGGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCCTGCCCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGc < 1:2462405/150‑1 (MQ=255) aGCAACCTGGCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCCTGCCCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGCCTggg < 2:1639943/131‑1 (MQ=255) aGCAACCTGGCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCCTGCCCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGCCTGGGCGc‑‑cc > 2:627502/1‑136 (MQ=255) aGCAACCTGGCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCCTGCCCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGCCTGGGCGc‑‑cc < 1:627502/136‑1 (MQ=255) aGCAACCTGGCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCCTGCCCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTg > 1:627202/1‑150 (MQ=255) aGCAACCTGGCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCCTGCCCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTg > 1:563092/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCTCACTCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGc 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gtACTTCCTGTCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAGCTGTATACCGAGCACCCGGCCGGCGCCTATCACTACAGCAAGGGCATCaa > 1:2702600/1‑150 (MQ=255) tACTTCCTGTCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAACGGCTGCATCAACGTGCCGGAGCTGTATACCGAGCACCCGGCCGGCGCCTATCACTACAGCAAGGGCATCAAc > 1:1136816/1‑150 (MQ=255) ttCCTGTCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGcc > 2:462522/1‑92 (MQ=255) ttCCTGTCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGcc < 1:462522/92‑1 (MQ=255) ttCCTGTCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAGCTGTATACCGAGCACCCGGCCGGCGCCTATCACTACAGCAAGGGCATCAACCTg > 2:1986090/1‑150 (MQ=255) tCCTGTCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAGCTGTATACCGAGCACCCGGCCGGCGCCTATCACTACAGCAAGGGCATCAACCTgc < 1:1547390/150‑1 (MQ=255) tGTCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAg > 2:2394934/1‑92 (MQ=255) tGTCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAg < 1:2394934/92‑1 (MQ=255) | CAACTTCGTCGCCCCGGCTTTCGTACTCAGCAACCTGGCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCCTGCCCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAGCTGTATACCGAGCACCCGGCCGGCGCCTATCACTACAGCAAGGGCATCAACCTGCG > NC_002947/4901622‑4901915 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |