New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 5480705 = | 121 (1.060) | 6 (0.050) | 6/236 | NT | 5.0% | coding (146/1356 nt) | PP_4819 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 5480748 = | 110 (0.990) | coding (189/1356 nt) | PP_4819 | hypothetical protein |
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
CCGCATGACCGACAGTTTCGTCACCCAGTGCCCGCATTGCCAGACCAGCTTTCGCGTCACCCACCACCAGTTGGGCGTGGCCCGTGGCGTGGTGCGCTGCGGTCACTGCCTGCAGGTATTCAATGCCGCCAAGCAGCTGCTGGAGCAAAACCGCGCCGCCACCACCAGCGCCCCCGTGGTGCCGGCACCGGTACCTGCAGTGCCTGCCGAGCCGCTGGCCGAGCCGGCGCAAGAGCCTGCCACCAGCGTACGCGGCACCCCACCTGACCAGGACTGGGCGCTGACTGCCCAGGCGCTGG > NC_002947/5480556‑5480854 | ccgcATGACCGACAGTTTCGTCACCCAGTGCCCGCATTGCCAGACCAGCTTTCGCGTCACCCACCACCAGTTGGGCGTGGCCCGTGGCGTGGTGCGCTGCGGTCACTGCCTGCAGGTATTCAATGCCGCCAAGCAGCTGCTGGAGCaaaa < 1:1000125/150‑1 (MQ=255) acgctccaggcgctccagttccttgtcgaggtcgagctcgtccagcgcctgggcagtcagcgcccagtcctggtcaggtggggtgccgcgtacgctggtggcaggctcttgcgccggctcggccagcggctcggcaggcactgcaggtAc < 1:783822‑M1/2‑1 (MQ=255) gACCGACAGTTTCGTCACCCAGTGCCCGCATTGCCAGACCAGCTTTCGCGTCACCCACCACCAGTTGGGCGTGGCCCGTGGCGTGGTGCGCTGCGGTCACTGCCTGCAGGTATTCAATGCCGCCAAGCAGCTGCTGGAGCAAAACCgcgc < 2:1789547/150‑1 (MQ=255) 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cAAGCAGCTGCTGGAGCAAAACCGCGCCGCCACCACCAGCGCCCCCGTGGTGCCGGCACCGGTACCTGCAGTGCCTGCCGAGCCGCTGGCCGAGCCGGCGCAAGAGCCTGCCACCAGCGTACGCGGCACCCCACCTGACCAGGACTGGgc > 1:1887383/1‑150 (MQ=255) gcagcTGCTGGAGCAAAACCGCGCCGCCACCACCAGCGCCCCCGTGGTGCCGGCACCGGTACCTGCAGTGCCTGCCGAGCCGCTGGCCGAGCCGgc < 1:2116916/96‑1 (MQ=255) agcTGCTGGGGCAAAACCGCGCCGCCACCACCAGCGCCCCCGTGGTGCCGCCACCGGTACCTGCAGTTCCTGCCGAGCCGCTGGCCGAGCCGGCGCAAGAGGCTGCCACCAGCGTACGCGGCACCCCACCTGACCAGGACTGGGCGCTGa > 2:2051772/1‑150 (MQ=255) agcTGCTGGAGCAAAACCGCGCCGCCACCACCAGCGCCCCCGTGGTGCCGGCACCGGTACCTGCAGTGCCTGCCGAGCCGCTGGCCGAGCCGGCGCAAGAGCCTGCCACCAGCGTACGCGGCACCCCACCTGACCAGGACTGGGCGCTGa < 1:814151/150‑1 (MQ=255) cgAGCAAAACCGCGCCGCCACCACCAGCGCCACCGTGGTGCCGGCACCGGTACCTGCAGTGCCTGCCGAGCCGCTGGCCGAGCCGGCGCAAGAGCCTGCCACCAGCGTACGCGGCACCCCACCTGACCAGGACTGGGCGCTGACTGCCCa > 2:1895366/2‑150 (MQ=255) gAGCAAAACCGCGCCGCCACCACCAGCGCCCCCGTGGTGCCGGCACCGGTACCTGCAGTGCCTGCCGAGCCGCTGGCCGAGCCGGCGCAAGAGCCTGCCACCAGCGTACGCGGCACCCCACCTGACCAGGACTGGGCGCTGACTGCCCAg > 1:2072731/1‑150 (MQ=255) gAGCAAAACCGCGCCGCCACCACCAGCGCCCCCGTGGTGCCGGCACCGGTACCTGCAGTGCCTGCCGAGCCGCTGGCCGAGCCGGCGCAAGAGCCTGCCACCAGCGTACGCGGCACCCCACCTGACCAGGACTGGGCGCTGACTGCCCAg > 1:2276184/1‑150 (MQ=255) gAGCAAAACCGCGCCGCCACCACCAGCGCCCCCGTGGTGCCGGCACCGGTACCTGCAGTGCCTGCCGAGCCGCTGGCCGAGCAGGCGTAAGAGCCTTCCGCGTGCGTACGCGGCTGGCGACCGTACCAGTACTGGGCGCTGACTGCCCAg < 2:2652430/150‑1 (MQ=255) gCAAAACCGCGCCGCCACCACCAGCGCCCCCGTGGTGCCGGCACCGGTACCTGCAGTGCCTGCCGAGCCGCTGGCCGAGCCGGCGCAAGAGCCTGCCACCAGCGTACGCGGCACCCCACCTGACCAGGACTGGGCGCTGACTGCCCAGgc > 1:1113380/1‑150 (MQ=255) cAAAACCGCGCCGCCACCACCAGCGCCCCCGTGGTGCCGGCACCGGTACCTGCAGTGCCTGCCGAGCCGCTGGCCGAGCCGGCGCAAGAGCCTGCCACCAGCGTACGCGGCACCCCAc > 2:426248/1‑118 (MQ=255) cAAAACCGCGCCGCCACCACCAGCGCCCCCGTGGTGCCGGCACCGGTACCTGCAGTGCCTGCCGAGCCGCTGGCCGAGCCGGCGCAAGAGCCTGCCACCAGCGTACGCGGCACCCCAc < 1:426248/118‑1 (MQ=255) cAAAACCGCGCCGCCACCACCAGCGCCCCCGTGGTGCCGGCACCGGTACCTGCAGTGCCTGCCGAGCCGCTGGCCGAGCCGGCGCAAGAGCCTGCCACCAGCGTACGCGGCACCCCACCTGACCAGGACTGGGCGCTGACTGCCCAGgcg > 1:482815/1‑150 (MQ=255) aaaCCGCGCCGCCACCACCAGCGCCCCCGTGGTGCCGGCACCGGTACCTGCAGTGCCTGCCGAGCCGCTGGCCGAGCCGGCGCAAGAGCCTGCCACCAGCGTACGCGGCACCCCACCTGACCAGGACTGGgcgc > 2:1447330/1‑134 (MQ=255) aaaCCGCGCCGCCACCACCAGCGCCCCCGTGGTGCCGGCACCGGTACCTGCAGTGCCTGCCGAGCCGCTGGCCGAGCCGGCGCAAGAGCCTGCCACCAGCGTACGCGGCACCCCACCTGACCAGGACTGGgcgc < 1:1447330/134‑1 (MQ=255) ACCGCGCCGCCACCACCAGCGCCCCCGTGGTGCCGGCACCGGTACCTGGAGTGCCTGGCGAGCCGCTGGCCGAGCCGGCGCAAGAGCCTGCCACCAGCGTACGCGGCACCCCACCTGACCATGACTGGGCGCTGACTGCCCAGGCGCTgg > 1:1272444‑M1/1‑150 (MQ=255) ACCGCGCCGCCACCACCAGCGCCCCCGTGGTGCCGGCACCGGTACCTGCAGTGCCTGCCGAGCCGCTGGCCGAGCCGGCGCAAGAGCCTGCCACCAGCGTACGCGGCACCCCACCTGACCAGGACTGGGCGCTGACTGCCCAGGCGCTgg > 2:2515409‑M1/1‑150 (MQ=255) | CCGCATGACCGACAGTTTCGTCACCCAGTGCCCGCATTGCCAGACCAGCTTTCGCGTCACCCACCACCAGTTGGGCGTGGCCCGTGGCGTGGTGCGCTGCGGTCACTGCCTGCAGGTATTCAATGCCGCCAAGCAGCTGCTGGAGCAAAACCGCGCCGCCACCACCAGCGCCCCCGTGGTGCCGGCACCGGTACCTGCAGTGCCTGCCGAGCCGCTGGCCGAGCCGGCGCAAGAGCCTGCCACCAGCGTACGCGGCACCCCACCTGACCAGGACTGGGCGCTGACTGCCCAGGCGCTGG > NC_002947/5480556‑5480854 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |