New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 5695264 = | 107 (0.930) | 12 (0.110) | 12/230 | NT | 11.3% | coding (933/1005 nt) | pyrB | aspartate carbamoyltransferase |
? | NC_002947 | 5695289 = | 87 (0.810) | coding (958/1005 nt) | pyrB | aspartate carbamoyltransferase |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
TGACGACCGCCCGCCTGGCCGGGGCCAAGCCTGACGCCATCGTCATGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCAGAACGCGCAACGTCAATTGGACCAGGAGAATGCCCAGTGACCATCAGTATTCTTGGCGCCCGGGTGATCGACCCCAACAGTGGCCTGGACCAGGTCACCGACCTGCACCTGGACGG > NC_002947/5695116‑5695412 | tGACGACCGCCCGCCTGGCCGGGGCCAAGCCTGACGCCATCGTCATGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCa > 2:695880/1‑150 (MQ=255) tGACGACCGCCCGCCTGGCCGGGGCCAAGCCTGACGCCATCGTCATGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCa > 1:2831901/1‑150 (MQ=255) gacgacCGCCCGCCTGGCCGGGGCCAAGCCTGACGCCATCGTCATGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCAt > 1:2187990/1‑150 (MQ=255) gacgacCGCCCGCCTGGCCGGGGCCAAGCCTGACGCCATCGTCATGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCAt < 2:1828066/150‑1 (MQ=255) cgacCGCCCGCCTGGCCGGGGCCAAGCCTGACGCCATCGTCATGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATgg < 1:2993046/150‑1 (MQ=255) gacCGCCCGCCTGGCCGGGGCCAAGCCTGACGCCATCGTCATGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGc > 1:1699529/1‑150 (MQ=255) gacCGCCCGCCTGGCCGGGGCCAAGCCTGACGCCATCGTCATGCACCCGGGACCGATCGACCGTGGCGTGGCACTCGAATTGGCGGCTGCCGATGGCAGGCACTCGGAGAGCCACAACACGGTCACCTACGGTAGCGCCGTCCGCATgac > 1:1173263/1‑148 (MQ=255) gacCGCCCGCCTGGCCGGGGCCAAGCCTGACGCCATCGTCATGCACACGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGc > 1:560556/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCGGGGCCAAGCCTGACGCCATCGTCATGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTc > 1:2160140/1‑150 (MQ=255) cTGGCCGGGGCCAAGCCTGACGCCATCGTCATGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATg < 1:1754657/138‑1 (MQ=255) cTGGCCGGGGCCAAGCCTGACGCCATCGTCATGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATg > 2:1754657/1‑138 (MQ=255) tGGCCGGGGCCAAGCCTGACGCCATCGTCATGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCa > 1:2727516/1‑150 (MQ=255) tGGCCGGGGCCAAGCCTGACGCCATCGTCATGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCa < 2:2831901/150‑1 (MQ=255) ccGGGGCCAAGCCTGACGCCATCGTCATGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATgg > 2:2824892/1‑150 (MQ=255) ccAAGCCTGACGCCATCGTCATGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGa < 2:779075/150‑1 (MQ=255) ccAAGCCTGACGCCATCGTCATGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGa < 1:1548014/150‑1 (MQ=255) cAAGCCTGACGCCATCGTCATGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAg > 1:307145/1‑150 (MQ=255) gCCTGACGCCATCGTCATGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGc < 1:2023683/148‑1 (MQ=255) gCCTGACGCCATCGTCATGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCgg < 1:998839/150‑1 (MQ=255) gCCTGACGCCATCGTCATGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCgg < 2:1844848/150‑1 (MQ=255) cTGACGCCATCGTCATGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGc > 2:2434964/1‑150 (MQ=255) cGCCATCGTCATGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCAGaa < 1:884032/150‑1 (MQ=255) gCCATCGTCATGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCAt < 1:2851942/131‑1 (MQ=255) gCCATCGTCATGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCAt > 2:2851942/1‑131 (MQ=255) gCCATCGTCATGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCAGAAc > 1:2881376/1‑150 (MQ=255) aggtcggtgacctggtccaggccactgttggggtcgatcacccgggcgccaagaatactgatggtcactgggcattctcctggtccaattgacgttgcgcgttctgcccgctCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCa < 1:1278190‑M1/23‑1 (MQ=255) tCGTCATGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCAGAACgcgc > 1:695809/1‑150 (MQ=255) gTCATGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCAGAACGCGCaa < 2:467734/150‑1 (MQ=255) aTGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAAAAATCGGTGAGAATCAAGCTGAATACGCGGTTTTGCGGGGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCAGAACGCGCAACGt > 1:1464814/1‑150 (MQ=255) 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caggccactgttggggtcgatcacccgggcgccaagaatactgatggtcactgggcattctcctggtccaattgacgttgcgcgttctgcccgcgCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCa > 1:2999557‑M1/96‑128 (MQ=255) caggccactgttggggtcgatcacccgggcgccaagaatactgatggtcactgggcattctcctggtccaattgacgttgcgcgttctgcccgcgCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCa < 2:2999557‑M1/33‑1 (MQ=255) gCCCGATCAACCGTGCCGTCGGTAGCGATTCGGCGGTGGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCAGAACGCGCAACGTCAATTGGAcc > 2:1050480/1‑150 (MQ=255) ccGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCAGAACGCGCAACGTCAATTGGACCAg > 1:1020382/1‑150 (MQ=255) cGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCgg > 2:1280404/1‑121 (MQ=255) cGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCgg < 1:1280404/121‑1 (MQ=255) 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aTCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCAGAACGCGCAACGTCAATTGGACCAGGAGAATGCCCAGTGACCATCAGTATTCTTGGCGCCCGGGTGATCGACCCCAACAGTg < 1:1050480/150‑1 (MQ=255) ccTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCAGAACGCGCAACGTCAATTGGACCAGGAGAATGCCCAGTGACCATCAGTATTCTTGGCGCCCGGGTGATCGACCCCAACAGTGGc > 2:1981533/1‑150 (MQ=255) ccTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCAGAACGCGCAACGTCAATTGGACCAGGAGAATGCCCAGTGACCATCAGTATTCTTGGCGCCCGGGTGATCGACCCCAACAGTGGc > 1:1056267/1‑150 (MQ=255) cTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCAGAACGCGCAACGTCAATTGGACCAGGAGAATGCCCAGTGACCATCAGTATTCTTGGCGCCCGGGTGATCGACCCCAACAGTGGcc > 1:1703565/1‑150 (MQ=255) tCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCAGAACGCGCAACGTCAATTGGACCAg < 1:336803/89‑1 (MQ=255) tCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCAGAACGCGCAACGTCAATTGGACCAg > 2:336803/1‑89 (MQ=255) 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2:620623/1‑149 (MQ=255) ccAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCAGAACGCGCAACGTCAATTg < 2:2242859/79‑1 (MQ=255) aGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCAGAACGCGCAACGTCAATTGGACCAGGAGAATGCCCAGTGACCATCAGTATTCTTGGCGCCCGGGTGATCGACCCCAACAGTGACCTGGTCCa > 1:623790/1‑150 (MQ=255) aGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCAGAACGCGCAACGTCAATTGGACCAGGAGAATGCCCAGTGACCATCAGTAATCTTGTCGCCCGGGTGATCGACCCCAACAGTGGCCTGGACCa > 1:2334220/1‑150 (MQ=255) aCCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCAGAACGCGCAACGTCAATTGGACCAGGAGAATGCCCAGTGACCATCAGTATTCTTGGCGCCCGGGTGATCGACCCCCACAGTGGCCTGGACCAGGTCa > 1:2140226/1‑150 (MQ=255) tACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCAGAACGCGCAACGTCAATTGGACCAGGAGAATGCCCAGTGACCATCAGTATTCTTGGCGCCCGGGTGATCGACCCCAACAGTGGCCTGGACCAGGTCACCg > 2:422310/1‑150 (MQ=255) cGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCAGAACGCGCAACGTCAATTGGACCAGGAGAATGCCCAGTGACCATCAGTATTCTTGGCGCCCGGGTGATCGACCCCAACAGTGGCCTGGACCAGGTCACCGAc < 2:373719/150‑1 (MQ=255) cGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCAGAACGCGCAACGTCAATTGGACCAGGAGAATGCCCAGTGACCATCAGTATTCTTGGCGCCCGGGTGATCGACCCCAACAGTGGCCTGGACCAGGTCACCGAc < 1:2162206/150‑1 (MQ=255) tATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCAGAACGCGCAACGTCAATTGGACCAGGAGAATGCCCAGTGACCATCAGTATTCTTGGCGCCCGGGTGATCGACCCCAACAGTGACCTGGTCCAGGCCActgttggg < 2:623790/150‑8 (MQ=255) aTCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCAGAACGCGCAACGTCAATTGGACCAGGAGAATGCCCAGTGACCATCAGTATTCTTGGCGCCCGGGTGATCGACCCCAACAGTGGCCTGGACCAGGTCACCGACCTGc < 2:1703565/150‑1 (MQ=255) gTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCAGAACGCGCAACGTCAATTGGACCAGGAGAATGCCCAGTGACCATCAGTATTCTTGGCGCCCGGGTGATCGACCCCAACAGTGGCCTGGACCAGGTCACCGACCTGCACCTgg > 2:1609269/1‑150 (MQ=255) gcATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCAGAACGCGCAACGTCAATTGGACCAGGAGAATGCCCAGTGACCATCAGTATTCTTGGCGCCCGGGTGATCGACCCCAACAGTGGCCTGGACCAAGTCACCGACCTGCACCTGGAcgg > 1:1554436/1‑150 (MQ=255) | TGACGACCGCCCGCCTGGCCGGGGCCAAGCCTGACGCCATCGTCATGCACCCGGGCCCGATCAACCGTGGCGTGGAAATCGAATCGGCGGTTGCCGATGGCAAGCACTCGGTGATCCTCAACCAGGTCACCTACGGTATCGCCGTGCGCATGGCCGTGCTGTCCATGGCCATGAGCGGGCAGAACGCGCAACGTCAATTGGACCAGGAGAATGCCCAGTGACCATCAGTATTCTTGGCGCCCGGGTGATCGACCCCAACAGTGGCCTGGACCAGGTCACCGACCTGCACCTGGACGG > NC_002947/5695116‑5695412 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |