| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | 1850937 = | 84 (0.790) | intergenic (+77/‑20) | rlmD/relA | 23S rRNA (uracil(1939)‑C(5))‑methyltransferase RlmD/ATP:GTP 3'‑pyrophosphotransferase | |||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
AGGGCCGGGATTCTCGACATGTTTCCTCAGACGGCGCATGTCGAGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGATGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGTTTG > NC_002947/1850789‑1851086 | aGGGCCGGGATTCTCGACATGTTTCCTCAGACGGCGCATGTCGAGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCa < 2:2949283/150‑1 (MQ=255) gggCCGGGATTCTCGACATGTTTCCTCAGACGGCGCATGTCGAGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCAt < 2:1521841/150‑1 (MQ=255) gggCCGGGATTCTCGACATGTTTCCTCAGACGGCGCATGTCGAGGCCATAAGGGTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCAt > 1:1615380/1‑150 (MQ=255) ggCCGGGATTCTCGACATGTTTCCTCAGACGGCGCATGTCGAGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATg < 2:513892/150‑1 (MQ=255) ggATTCTGGACATGTTTCCTCAGACGGCGCATGTCGAGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAg < 2:848914/150‑1 (MQ=255) tccagtgccgaatcgacgcttaccacatggtccaaccatgcttcgagattgatactgccgtcagtgttgaccggctggtgcactctcacctgtaccttctttgttttacctttccatgcagcacactcgtatggtgtgctgCATGGAAAg < 1:739125‑M2/9‑1 (MQ=255) agtctcGACATCTTTCATAAGCCGGCGCATGTCGCGTTCATGTCGTGATGCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGt < 2:28090/148‑1 (MQ=255) aTTCTGCACATGTTTCCTCCGACGCCGCATGTCGAGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCCAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGt < 2:660818/150‑1 (MQ=255) ttCTCGACATGTTTCCTCAGACGGCGCATGTCGAGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTa > 2:2746768/1‑150 (MQ=255) ttCTCGACATGTTTCCTCAGACGGCGCATGTCGAGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCCAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTa > 1:660818/1‑150 (MQ=255) ctcGACATGTTTCCTCAGACGGCGCATGTCGAGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTaaa < 2:1138589/150‑1 (MQ=255) tcGACATGTTTCCTCAGACGGCGCATGTCGAGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGTCCGCACGGGGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTTTGCTGCATGGAAAGGTaaaa < 2:438526/150‑1 (MQ=255) tcGACATGTTTCCTCAGACGGCGCATGTCGAGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTaaaa > 2:796423/1‑150 (MQ=255) 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tCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAaag > 2:2303924/1‑150 (MQ=255) gTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAaagaa < 1:2919562/150‑1 (MQ=255) aTG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGc > 2:2548501/1‑150 (MQ=255) aTG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGc < 2:2342330/150‑1 (MQ=255) aTG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGc < 2:744672/150‑1 (MQ=255) tG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGtt < 2:2793474/95‑1 (MQ=255) g‑gTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCt > 1:1045067/1‑150 (MQ=255) gtgtgctgCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCa < 2:292642‑M2/113‑1 (MQ=255) gtgtgctgCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACAAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCa > 1:292642‑M2/9‑121 (MQ=255) tgtgctgCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGc > 2:1323063‑M2/8‑150 (MQ=255) tgtgctgCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGc > 1:2439944‑M2/8‑150 (MQ=255) ctgCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGt > 1:2276340‑M2/4‑150 (MQ=255) cATGGAAAGGTAAAACAAAGATGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGTTTg > 2:1889374/1‑150 (MQ=255) cATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGAACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGTTTg < 1:2498630/150‑1 (MQ=255) | AGGGCCGGGATTCTCGACATGTTTCCTCAGACGGCGCATGTCGAGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGATGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGTTTG > NC_002947/1850789‑1851086 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |