New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3775020 = | 144 (1.260) | 7 (0.060) | 5/230 | NT | 5.1% | intergenic (‑4/+47) | PP_3335/PP_3336 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3775055 = | 126 (1.170) | intergenic (‑39/+12) | PP_3335/PP_3336 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
GGGAAACGGCAACAGGAAGTCGCCAGTGCGCGACGGGCGAACGGAGGGCTCCAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACGGCCAGCAGTGCCGGGGCGAATGCACCAGAACAGCGGGTTGCTGGTCGACAGGCAGCACAGGCAGGGCAAAGGCGGCCAGAATCAAAGAGGCAGGCA > NC_002947/3774906‑3775203 | gggAAACGGCAACAGGAAGTCCCCAGTGCGCTACGGGCGACCGGAGGGCTACAGCAACGCTCAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGAGCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTgg < 1:473944/150‑1 (MQ=255) catgtgctgcctttctaccatcaacccgctgttctggtgcattcgccccggcactgctggccgtcgatcaacccccgtgcctccccgaaagtgatcgcctgacctgcaaggaccCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTgg > 2:2951778‑M1/115‑150 (MQ=255) tgtgctgcctgtcgaccagcaacccgctgttctggtgcattcgccccggcactgctggccgtcgatcaacccccgtgcctccccgaaagtgatcgcctgacctgcaaggaccCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGt > 1:405804‑M1/113‑150 (MQ=255) aaaCGGCAACAGGAAGTCGCCAGTGCGCGACGGGCGAACGGAGGGCTCCAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTc < 1:775042/150‑1 (MQ=255) aaCGGCAACAGGAAGTCGCCAGTGCGCGACGGGCGAACGGAGGGCTCCAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTcc < 1:327672/150‑1 (MQ=255) aaCGGCAACAGGAAGTCGCCAGTGCGCGACGGGCGAACGGAGGGCTCCAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTcc < 1:1376328/150‑1 (MQ=255) cGGCAACAGGAAGTCGCCAGTGCGCGACGGGCGAACGGAGGGCTCCAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCtt < 2:932304/150‑1 (MQ=255) gCAACAGGAAGTCGCCAGTGCGCGACGGGCGCACTGAGGTCTCCAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGc < 2:244002/150‑1 (MQ=255) gCAACAGGAAGTCGCCAGTGCGCGACGGGCGAACGGAGGGCTCCAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGc < 2:288547/150‑1 (MQ=255) gCAACAGGAAGTCGCCAGTGCGCGACGGGCGAACGGAGGGCTCCAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGc > 2:1143113/1‑150 (MQ=255) gCAACAGGAAGTCGCCAGTGCGCGACGGACGAACGGAGGGCTCCAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGc > 1:848145/1‑150 (MQ=255) cAACAGGAAGTCGCCAGTGCGCGACGGGCGAACGGAGGGCGCCAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCa < 1:1567650/150‑1 (MQ=255) cAGGAAGTCGCCAGTGCGCGACGGGCGCCCTGAGGGCTCCAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGt > 1:1619700/1‑150 (MQ=255) cAGGAAGTCGCCAGTGCGCGACGGGCGAACGTAGGGCTCCAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCGCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGt > 2:2409883/1‑150 (MQ=255) ggAAGTCGCCAGTGCGCGACGGGCGAACGGAGGGCTCCAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCa < 2:1658959/150‑1 (MQ=255) gAAGTCGCCAGTGCGCGACGGGCGAACGGAGGGCTCCAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAg > 2:362065/1‑150 (MQ=255) gAAGTCGCCAGTGCGCGACGGGCGAACGGAGGGCTCCAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAg < 2:1070252/150‑1 (MQ=255) gAAGTCGCCAGTGCGCGACGGGCGAACGGAGGGCTCCAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAg > 2:2775642/1‑150 (MQ=255) aaGTCGCCAGTGCGCGACGGGCGAACGGAGGGCTCCAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAg‑g < 2:2607037/150‑1 (MQ=255) gCCAGTGCGCGACGGGCGAACGGAGGGCTCCAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGATCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAAGCCAACGCCACGCTTTTAGCTGGTGCGACCTGGTTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATc > 2:1271101/1‑150 (MQ=255) ccAGTGCGCGACGGGCGAACGGAGGGCTCCAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCa > 1:897058/1‑150 (MQ=255) cAGTGCGCGACGGGCGAACGGAGGGCTCCAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCAc > 1:1936426/1‑150 (MQ=255) cgcgACGGGCGAACGTAGGGCTCCAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCg < 1:2409883/150‑1 (MQ=255) gcgACGGGCGAACGGAGGGCTCCAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCTTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCgg < 2:1619700/150‑1 (MQ=255) aCGGGCGAACGGAGGGCTCCAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGa < 1:2775642/150‑1 (MQ=255) gggCGAACGGAGGGCTCCAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAgg < 2:2119142/150‑1 (MQ=255) ggCGAACGGAGGGCTCCAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGc > 1:1377556/1‑150 (MQ=255) gCGAACGGAGGGCTCCAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCa > 2:1854241/1‑150 (MQ=255) 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cAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGAc > 1:631431/1‑150 (MQ=255) aGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACg < 1:1285936/150‑1 (MQ=255) gCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGa < 1:940019/111‑1 (MQ=255) tGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCgg < 2:2870524/119‑1 (MQ=255) gAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTgg > 2:2805678/1‑89 (MQ=255) gAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACGGCCAGCAGt > 2:230594/1‑150 (MQ=255) 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> 1:1157853/1‑150 (MQ=255) gaCATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACGGCCAGCAGTGCCGGGGCGAATGCACCa < 1:1854241/150‑1 (MQ=255) aTCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACGGCCAGCAGTGCCGGGGCGAATGCACCAGaa > 1:541835/1‑150 (MQ=255) tCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACGGCCAGCAGTGCCGGGGCGAATGCACCAGAAc > 2:358939/1‑150 (MQ=255) tCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACGGCCAGCAGTGCCGGGGCGAATGCACCAGAAc > 1:1163356/1‑150 (MQ=255) tgtgCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGa > 1:1688877/1‑83 (MQ=255) 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ccaggccgcacccgctaaaagcggggcgtcggcctgGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACGGCCAGCAGTGCCGGGGCGAATGCACCAGAACAGCGGGtt < 2:2935947‑M2/92‑1 (MQ=255) ccaggccgcacccgctaaaagcggggcgtcggcctgGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACGGCCAGCAGTGCCGGGGCGAATGCACCAGAACAGCGGGtt > 1:2935947‑M2/37‑128 (MQ=255) GGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACGGCCAGCAGTGCCGGGGCGAATGCACCAGAACAGCGGGTTGCTGGTCGACAGGCAGCAcaggcag > 1:2111677‑M1/1‑150 (MQ=255) aggccgcacccgctaaaagcggggcggcctgGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACGGCCAGCAGTGCCGGGGCGAATGCACCAGAACAGCGGGTTGCTGGTCGACAGGCAGCACAGGCAggg > 2:22468‑M2/32‑150 (MQ=255) CCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACGGCcag > 1:2721324‑M1/1‑89 (MQ=255) CCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACGGCcag < 2:2721324‑M1/89‑1 (MQ=255) cGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACGGCCAGCAGTGCCGGGGCGAATGCACCAGAACAGCGGGTTGCTGGTCGACAGGCAGCACAGGCAGGGCaaa < 2:1991014/150‑1 (MQ=255) gCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACGGCCAGCAGTGCCGGGGCGAATGCACCAGAACAGCg > 1:2044494/1‑114 (MQ=255) ccGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACGGCCAGCAGTGCCGGGGCGAATGCACCAGAACAGCg > 2:1573388/1‑111 (MQ=255) ccGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACGGCCAGCAGTGCCGGGGCGAATGCACCAGAACAGCg < 1:2795098/111‑1 (MQ=255) ccGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACGGCCAGCAGTGCCGGGGCGAATGCACCAGAACAGCGGGTTGCTGGTCGACAGGCAGCACAGGCAGGGCAAAggcg < 1:358939/150‑1 (MQ=255) cGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACGGCCAGCAGTGCCGGGGCGaa < 1:1044486/95‑1 (MQ=255) ttAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACGGCCAGCAGTGCCGGGGCGAATGCACCAGAACAGCGGGTTGCTGGTCGACAGGCAGCACAGGCAGGGCAAAGGCGGCCAGa > 1:2552878/1‑150 (MQ=255) ggggCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACGGCCAGCAGTGCCGGGGCGAATGCACCAGAACAGCGGGTTGCTGGTCGACAGGCAGCACAGGCAGGGCAAAGGCGGCCAGAATCaaa < 1:22468/147‑1 (MQ=255) ggTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTAGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACGGCCAGCAGTGCCGGGGCGAATGCACCAGAACAGCGGGTTGCTGGTCGACAGGCAGCACAGGCAGGGCAAAGGCGGCCAGAATCaaa > 2:1776688/1‑150 (MQ=255) gTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACGGCCAGCAGTGCCGGGGCGAATGCACCAGAACAGCGGGTTGCTGGTCGACAGGCAGCAcaggcagg < 1:1692786/128‑1 (MQ=255) gTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACGGCCAGCAGTGCCGGGGCGAATGCACCAGAACAGCGGGTTGCTGGTCGACAGGCAGCAcaggcagg > 2:1692786/1‑128 (MQ=255) gTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACGGCCAGCAGTGCCGGGGCGAATGCACCAGAACAGCGGGTTGCTGGTCGACAGGCAGCACAGGCAGGGCAAAGGCGGCCAGAATCAAag > 1:674443/1‑150 (MQ=255) tGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACGGCCAGCAGTGCCGGGGCGAATGCACCAGAACAGCGGGTTGCTGGTCGACAGGCAGCACAGGCAGGGCAAAGGCGGCCAGAATCAAaga < 2:1801437/150‑1 (MQ=255) cctgGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGa < 2:1977390‑M2/33‑1 (MQ=255) gGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACGGACAGCAGTGCCGGGGCGAATGCACCAGAACAGCGGGTTGCTGGTCGACAGGCAGCACAGGCAGGGCAAAGGCGGCCAGAATCAAAGAggcaggca > 2:1048221‑M2/2‑150 (MQ=255) | GGGAAACGGCAACAGGAAGTCGCCAGTGCGCGACGGGCGAACGGAGGGCTCCAGCAACGCTGAAGCGTTCAGGGTACGAGACATCGTGTGCTCCGGGGTACGGCTAGCCATCGGCAGGCCGACGCCCCGCTTTTAGCGGGTGCGGCCTGGGTCCTTGCAGGTCAG‑GCGATCACTTTCGGGGAGGCACGGGGGTTGATCGACGGCCAGCAGTGCCGGGGCGAATGCACCAGAACAGCGGGTTGCTGGTCGACAGGCAGCACAGGCAGGGCAAAGGCGGCCAGAATCAAAGAGGCAGGCA > NC_002947/3774906‑3775203 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |