New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 2926918 = | 79 (1.320) | 6 (0.110) | 5/226 | NT | 7.3% | coding (142/2472 nt) | PP_2565 | UvrD/REP family helicase |
? | NC_002947 | 2926957 = | 79 (1.400) | coding (181/2472 nt) | PP_2565 | UvrD/REP family helicase |
ACCGTGGCCCACGAGCAACCCTTGGCCCCCGCCGACCTTACCCCTCCTGCCCAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGATGACAAC > NC_002947/2926774‑2927067 | ggccgtcaacggcaggcgccagtcgtcgaacaagttgtcatcctggcctggcacagcggcgctgtcggggcgcgtatcgcggatcaccagcacctggcgccccgcttcaaagccctccacccgaccacgctcgaacccttcacgCACGcc < 1:1503527‑M1/6‑1 (MQ=255) gTGGCCCACGAGCAACCCTTGGCCCCCGCCGACCTTACCCCTCCTGCCCAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCcac‑‑‑‑‑a < 2:1062919/150‑1 (MQ=255) ccACGAGCAACCCTTGGCCCCCGCCGACCTTACCCCTCCTGCCCAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCa > 1:951807/1‑150 (MQ=255) ccACGAGCAACCCTTGGCCCCCGCCGACCTTACCCCTCCTGCCCAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCa > 2:1121965/1‑150 (MQ=255) cACGAGCAACCCTTGGCCCCCGCCGACCTTACCCCTCCTGCCCAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAg < 1:1419608/150‑1 (MQ=255) aCGAGCAACCCTTGGCCCCCGCCGACCTTACCCCTCCTGCCCAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGc < 1:770857/146‑1 (MQ=255) aCGAGCAACCCTTGGCCCCCGCCGACCTTACCCCTCCTGCCCAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGc > 2:770857/1‑146 (MQ=255) gAGCAACCCTTGGCCCCCGCCGACCTTACCCCTCCTGCCCAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAgcgc > 1:142840/1‑150 (MQ=255) aCCCTTGGCCCCCGCCGACCTTACCCCTCCTGCCCAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTgg > 1:246777/1‑150 (MQ=255) ccTTGGCCCCCGCCGACCTTACCCCTCCTGCCCAGTTGCACTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCAGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGcc > 1:669339/1‑150 (MQ=255) gaacaagttgtcatcctggcctggcacagcggcgctgtcggggcgcgtatcgcggatcaccagcacctggcgccccgcttcaaagccctccacccgaccacgctcgaacccttcacgCACGCCACGCCACAGGCCAGCGCACTGGCCATg > 2:426733‑M1/118‑150 (MQ=255) cccGCCGACCTTACCCCTCCTGCCCAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGAt > 2:251380/1‑150 (MQ=255) ccgccgACCTTACCCCTCCTGCCCAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATg > 2:1400046/1‑150 (MQ=255) ccgccgACCTTACCCCTCCTGCCCAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATg < 2:601127/150‑1 (MQ=255) cgccgACCTTACCCCTCCTGCCCAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATgg > 1:1326547/1‑150 (MQ=255) caagttgtcatcctggcctggcacagcggcgctgtcggggcgcgtatcgcggatcaccagcacctggcgccccgcttcaaagccctccacccgaccacgctcgaacccttcacgCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGgc > 1:939844‑M1/115‑150 (MQ=255) aCCTTACCCCTCCTGCCCAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGgcgtgc < 2:1071909/150‑1 (MQ=255) cTTACCCCTCCTGCCCAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGgcgtgcgt > 1:312525/1‑150 (MQ=255) 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ccAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAg > 1:1042379/1‑150 (MQ=255) aGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATc < 2:312783/128‑1 (MQ=255) aGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATc > 1:312783/1‑128 (MQ=255) aCCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGcgccg > 1:1042795/1‑150 (MQ=255) cgACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCtgt < 2:175229/150‑1 (MQ=255) cgACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCtgt < 2:312525/150‑1 (MQ=255) cgACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCtgt < 1:1545629/150‑1 (MQ=255) aCTCATGGTTCCTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTgc < 2:1534/150‑1 (MQ=255) cATGGTTCCTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTgccag < 1:538150/150‑1 (MQ=255) aTGGTTCCTCGGCCATGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGCTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCCGGTGATCCGCGCTACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTgccagg > 2:137006/1‑150 (MQ=255) aTGGTTCCTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGAt > 2:1431789/1‑114 (MQ=255) aTGGTTCCTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGAt < 1:1431789/114‑1 (MQ=255) ccTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCTCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGa < 2:1042379/150‑1 (MQ=255) ccTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCtgt > 1:147715/1‑138 (MQ=255) ccTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCtgt < 2:147715/138‑1 (MQ=255) cTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGAAATAC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGAt < 1:1365428/150‑1 (MQ=255) tCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCGAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCGCGACCGCGCCCCTGTGCCAGGCCAGGGTg > 2:671519/1‑150 (MQ=255) tCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAg < 2:102348/95‑1 (MQ=255) tCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAg > 1:102348/1‑95 (MQ=255) tCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGATg > 1:1063429/1‑150 (MQ=255) tCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGATg > 1:720729/1‑150 (MQ=255) gccacgccac‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGATGACa > 2:1086692/1‑150 (MQ=255) ccacgccac‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGATGACaa > 1:1479083/1‑150 (MQ=255) CACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGATGACAAc > 1:1086692‑M1/1‑150 (MQ=255) | ACCGTGGCCCACGAGCAACCCTTGGCCCCCGCCGACCTTACCCCTCCTGCCCAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCAC‑‑‑‑‑AGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGATGACAAC > NC_002947/2926774‑2927067 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |