New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_002947 | 2926918 = | 79 (1.320) | 6 (0.110) | 5/226 | NT | 7.3% | coding (142/2472 nt) | PP_2565 | UvrD/REP family helicase |
? | NC_002947 | 2926957 = | 79 (1.400) | coding (181/2472 nt) | PP_2565 | UvrD/REP family helicase |
ACCTTACCCCTCCTGCCCAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCACAGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGATGACAACTTGTTCGACGACTGGCGCCTGCCGTTGACGGCC > NC_002947/2926808‑2927100 | aCCTTACCCCTCCTGCCCAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCACAGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGgcgtgc < 2:1071909/150‑1 (MQ=255) cTTACCCCTCCTGCCCAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCACAGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGgcgtgcgt > 1:182356/1‑150 (MQ=255) cTTACCCCTCCTGCCCAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCACAGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGgcgtgcgt > 1:231740/1‑150 (MQ=255) cTTACCCCTCCTGCCCAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCACAGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGgcgtgcgt > 1:312525/1‑150 (MQ=255) cTTACCCCTCCCGCCCAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCACAGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGgcgtgcgt < 1:251380/150‑1 (MQ=255) tcctggcctggcacagcggcgctgtcggggcgcgtatcgcggatcaccagcacctggcgccccgcttcaaagccctccacccgaccacgctcgaacccttcacgCACGCCACAGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAg > 2:305947‑M1/105‑150 (MQ=255) tcctggcctggcacagcggcgctgtcggggcgcgtatcgcggatcaccagcacctggcgccccgcttcaaagccctccacccgaccacgctcgaacccttcacgCACGCCACAGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAg > 2:305685‑M1/105‑150 (MQ=255) cccTCCTGCCCAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCACAGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAgg < 2:773708/150‑1 (MQ=255) ctcctGCCCAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCGGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCACAGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGt > 2:841568/1‑150 (MQ=255) tGCCCAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCACAGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGa < 2:951807/150‑1 (MQ=255) cccAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCATCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCACAGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGc < 2:50245/150‑1 (MQ=255) cAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCACAGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGt < 1:1121965/150‑1 (MQ=255) ttGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCACAGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGt > 2:1008675/1‑150 (MQ=255) 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gccacgccacAGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGATGACa > 2:1086692/1‑150 (MQ=255) ccacgccacAGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGATGACaa > 1:1479083/1‑150 (MQ=255) CACGCCACAGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGATGACAAc > 1:1086692‑M1/1‑150 (MQ=255) acgccatcggcatggccagtgcgctggcctgtggcgtgCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑Gcccc > 1:1361915‑M2/39‑116 (MQ=255) acgccatcggcatggccagtgcgctggcctgtggcgtgCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑Gcccc < 2:1361915‑M2/78‑1 (MQ=255) gccatcggcatggccagtgcgctggcctgtggcgtgCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGATGACAACTTg > 1:939844‑M2/37‑150 (MQ=255) CCACAGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGATGACAACTTGt > 1:1633749‑M1/1‑150 (MQ=255) CACAGGCCAGCGCACTGGCCACGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGAGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGATGACAACTTGtt < 2:1503527‑M1/150‑1 (MQ=255) catggccagtgcgctggcctgtggcgtggcgtgCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGATGACAACTTGTTc > 2:426733‑M2/34‑150 (MQ=255) ACAGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGATGACAACTTGTTc > 1:357075‑M1/1‑150 (MQ=255) aGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGATGACAACTTGTTcga < 1:1294406/150‑1 (MQ=255) ggCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGATGACAACTTGTTcgac < 1:671519/150‑1 (MQ=255) ccAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTgg < 1:948868/86‑1 (MQ=255) ccAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTgg > 2:948868/1‑86 (MQ=255) cAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGATGACAACTTGTTCgacgac > 1:1505754/1‑150 (MQ=255) tGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGGTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCtgt < 1:1331506/111‑1 (MQ=255) tGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACgg‑gc > 1:561745/1‑94 (MQ=255) tGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACgc‑gc < 2:561745/94‑1 (MQ=255) tGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCtgt > 2:1331506/1‑111 (MQ=255) ccATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCTGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGATGACAACTTGTTCGACGACTGGCGCCTGcc < 2:1063429/150‑1 (MQ=255) cATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGATGCCAACTAGACGTACGACTGGCGCCTGCCg > 1:498460/1‑150 (MQ=255) cATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGATGACAACTTGTTCGACGACTGGCGCCTGCCg > 1:498572/1‑150 (MQ=255) tGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTGGAAGGGGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGATGACAACTTGTTCGACGACTGGCGCCTGCCGtt > 1:862709/1‑150 (MQ=255) cGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCggg > 1:1468206/1‑35 (MQ=255) cGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCggg < 2:1468206/35‑1 (MQ=255) gATGGCGTGCGTGCAGGGTGCGGGCTGGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGATGACAACTTGTTCGACGACTGGCGCCTGCCGTTGACg < 2:379054/150‑1 (MQ=255) ggcgtgCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGATGACAACTTGTTCGACGACTGGCGCCTGCCGTTGACGGcc < 1:1503527‑M2/144‑1 (MQ=255) | ACCTTACCCCTCCTGCCCAGTTGCCCTGGTTTCGCCGCCTGGCCGCCCGCCTGCTGGGGCGTGGCCTGACCCGCCTGCAAGCCCAGCACCGCGACTCATGGTTCCTCGGCCACGCCACAGGCCAGCGCACTGGCCATGCCGATGGCGTGCGTGAAGGGTTCGAGCGTGGTCGGGTGGAGGGCTTTGAAGCGGGGCGCCAGGTGCTGGTGATCCGCGATACGC‑GCCCCGACAGCGCCGCTGTGCCAGGCCAGGATGACAACTTGTTCGACGACTGGCGCCTGCCGTTGACGGCC > NC_002947/2926808‑2927100 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |