New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3431097 | 60 (1.000) | 4 (0.070) | 4/230 | NT | 6.5% | coding (106/348 nt) | PP_3046 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 3431135 | 58 (1.010) | coding (144/348 nt) | PP_3046 | hypothetical protein |
GTCGGCAGGCCACACAATTCCGTCCCGGCCAAGGAGCCTGAACATGAGCAAAACCTATGTAGAGCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATCCTGTTTGCTTCTGTCGCGTCCTCAGATGTGTTGCGCCGTGGGCGTGCTGTC > NC_002947/3430949‑3431246 | gTCGGCAGGCCACACAATTCCGTCCCGGCCAAGGAGCCTGAACATGAGCAAAACCTATGTAGAGCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCt < 2:559593/150‑1 (MQ=255) tCGGCAGGCCACACAATTCCGTCCCGGCCAAGGAGCCTGAACATGAGCAAAACCTATGTAGAGCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCtg > 1:71914/1‑150 (MQ=255) aGGCCACACAATTCCGTCCCGGCCAAGGAGCCTGAACATGAGCAAAACCTATGTAGAGCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGc > 1:1558192/1‑150 (MQ=255) gCCACACAATTCCGTCCCGGCCAAGGAGCCTGAACATGAGCAAAACCTATGTAGAGCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTg < 2:174137/150‑1 (MQ=255) ccACACAATTCCGTCCCGGCCAAGGAGCCTGAACATGAGCAAAACCTATGTAGAGCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCgctggcagtc > 1:1226298‑M1/1‑140 (MQ=255) cacacaATTCCGTCCCGGCCAAGGAGCCTGAACATGAGCAAAACCTATGTAGAGCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGt > 2:701102/1‑150 (MQ=255) acaATTCCGTCCCGGCCAAGGAGCCTGAACATGAGCAAAACCTATGTAGAGCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAg < 2:828941/150‑1 (MQ=255) aaTTCCGTCCCGGCCAAGGAGCCTGAACATGAGCAAAACCTATGTAGAGCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCATGt < 2:71914/150‑1 (MQ=255) aTTCCGTCCCGGCCAAGGAGCCTGAACATGAGCAAAACCTATGTAGAGCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTc < 2:1299297/145‑1 (MQ=255) aTTCCGTCCCGGCCAAGGAGCCTGAACATGAGCAAAACCTATGTAGAGCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTc > 1:1299297/1‑145 (MQ=255) ccGTCCCGGCCAAGGAGCCTGAACATGAGCAAAACCTATGTAGAGCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTc < 2:560577/150‑1 (MQ=255) cGTCCCGGCCAAGGAGCCTGAACATGAGCAAAACCTATGTAGAGCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCg < 1:701102/150‑1 (MQ=255) ccGGCCAAGGAGCCTGAACATGAGCAAAACCTATGTAGAGCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCa > 2:1027556/1‑150 (MQ=255) cGGCCAAGGAGCCTGAACATGAGCAAAACCTATGTAGAGCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGCGGCATG‑GAGGTGTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGACCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAg > 1:1103949/1‑150 (MQ=255) aaGGAGCCTGAACATGAGCAAAACCTATGTAGAGCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCtggt < 2:1072244/123‑1 (MQ=255) aaGGAGCCTGAACATGAGCAAAACCTATGTAGAGCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCtggt > 1:1072244/1‑123 (MQ=255) tGAACATGAGCAAAACCTATGTAGAGCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCNGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATTCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTAACTGCCGGCg < 1:1096627‑M2/150‑2 (MQ=255) gAACATGAGCAAAACCTATGTAGAGCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCgg > 1:1232656‑M2/1‑148 (MQ=255) aaCCTATGTAGAGCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCgctggcagtcagctgaccgagcacctgaccagccaccagggcgtcgcctggg < 2:1226298‑M1/150‑53 (MQ=255) aaCCTATGTAGAGCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCgggc < 1:937559‑M2/140‑5 (MQ=255) aaCCTATGTAGAGCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCgggc > 2:937559‑M2/1‑136 (MQ=255) cTATGTAGAGCCGGTCCATGTCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCAcccc < 2:314498/147‑1 (MQ=255) cTATGTAGAGCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCAcccc > 1:314498/1‑147 (MQ=255) cTATGTAGAGCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTa > 2:877205/1‑150 (MQ=255) gTAGAGCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGc > 1:822779/1‑150 (MQ=255) gagCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCt < 2:1558192/150‑1 (MQ=255) gagCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCt > 1:898761/1‑150 (MQ=255) cATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCa > 2:782145/1‑104 (MQ=255) cATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCa < 1:782145/104‑1 (MQ=255) tGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGt < 1:376436/93‑1 (MQ=255) tGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGt > 2:376436/1‑93 (MQ=255) gCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGAc < 2:1580648/150‑1 (MQ=255) gTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCa > 2:809987/1‑150 (MQ=255) ctgTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGTTCAGATGCTCGGTCACCTCACTGCCAGCGGGCAGTTTAGCCCATACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCCGCGAAACGGcc > 1:14670/1‑150 (MQ=255) tgTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGc > 2:475575/1‑148 (MQ=255) tgTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGc < 1:475575/148‑1 (MQ=255) ccGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGt < 2:1103949/150‑1 (MQ=255) aGGC‑GCAGGCGAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCAt < 1:463501/150‑1 (MQ=255) ggC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATc < 1:1043724/150‑1 (MQ=255) ggC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATc < 1:534816/150‑1 (MQ=255) ggCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATCCTGttt > 1:952690/1‑150 (MQ=255) gCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATCCTGTTTg > 1:1316565/1‑150 (MQ=255) gCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATCCTGTTTg > 1:1441193/1‑150 (MQ=255) aaGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCTCCAGGCGATGCCCgctggcagtcagctgaccgagcacctgaccagccaccagggcatcgcctggggc > 2:1438559‑M1/1‑43 (MQ=255) aaGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCgctggcagtcagctgaccgagcacctgaccagccaccagggcatcgcctggggc < 1:1438559‑M1/97‑55 (MQ=255) aGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATCCTGTTTGCtt < 1:809987/150‑1 (MQ=255) aTCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACCGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAAAGGCCAAGTGCATCCTGTTTGCTTCt < 1:623808/150‑1 (MQ=255) cccGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATCCTGTTTGCTTCTGTcg > 2:647761/1‑150 (MQ=255) ccGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAg > 2:1305372/1‑49 (MQ=255) ccGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAg < 1:1305372/49‑1 (MQ=255) ccGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCAt < 2:866688/132‑1 (MQ=255) ccGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCAt > 1:866688/1‑132 (MQ=255) ccGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATCCTGTTTGCTTCTGTcgc > 1:1034323/1‑150 (MQ=255) ccGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATCCTGTTTGCTTCTGTcgc > 2:918930/1‑150 (MQ=255) ccGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATCCTGTTTGCTTCTGTcgc < 2:952690/150‑1 (MQ=255) ccGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATCCTGTTTGCTTCTGTcgc > 1:1317334/1‑150 (MQ=255) ccGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATCCTGTTTGCTTCTGTcgc > 1:771582/1‑150 (MQ=255) gcgAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGcc > 1:1390242/1‑93 (MQ=255) gcgAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGcc < 2:1390242/93‑1 (MQ=255) gAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATCCTGTTTGCTTCTGTCGCGTcc < 2:1316565/150‑1 (MQ=255) aTCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATCCTGTTTGCTTCTGTCGCGTCCTCAGAt > 2:97441/1‑150 (MQ=255) gAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATCCTGtt < 2:1433064/125‑1 (MQ=255) gAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATCCTGtt > 1:1433064/1‑125 (MQ=255) cTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCCGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATCCTGTTTGCTTCTGTCGCGTCCTCAGATGTGTTg < 2:793354/150‑1 (MQ=255) tGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATCCTGTTTGCTTCTGTCGCGTCCTCAGATGTGTTgc < 2:1034323/150‑1 (MQ=255) gCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCgggcatcgcctggggccagttcgatcacttcgcgggagatctt < 1:1438559‑M2/97‑44 (MQ=255) gCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCgggcatcgcctggagccagttcgatcacttcgcgggagatctt > 2:1438559‑M2/1‑54 (MQ=255) acggaGGGGATGCCCTGGTGCCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGGAGTTCACGCCAGACAGCGCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGCAACGGCCAAGTGCATCCTGTTTGCTTATGTCGCGTCCTCAGATGTGTTgcgac > 2:474676/5‑148 (MQ=255) cccAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATCCTGttt > 1:208928/1‑118 (MQ=255) cccAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATCCTGttt < 2:208928/118‑1 (MQ=255) cccAGGCGACGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCgggcatcgcctggggccagttcgatcacttcgcgggagatcttgcctgcgccttcggacagcaggaattcaccggcatggaccggctctacataggtt < 2:1226298‑M2/150‑99 (MQ=255) ccAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATCCTGTTTGCTTCTGTCGCGTCCTCAGATGTGTTGCGCCGt < 1:433038/150‑1 (MQ=255) cAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATCCTGTTTGCTTCTGTCGCGTCCTCAGATGTGTTGCGCCGTg < 1:1027556/150‑1 (MQ=255) gCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATCCTGTTTGCTTCTGTCGCGTCCTCAGATGTGTTGCGCCGTGGGc < 2:905170/150‑1 (MQ=255) gATGCCCGGGGGGATGGTAAGGTGCTCGGCCACCGGACTGCTAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATCCTGTTTGCTTCTGTCGCGTCCTCAGATGTGTTGCGCCGTGGGCGt < 2:14670/150‑1 (MQ=255) gCCCgctggcagtcagctgaccgagcacctgaccagccaccagggcatcgcctggggccagttcgatcacttcgcgggagatcttgcctgcgccttcggacagcaggaattcaccggcatggaccggctctacataggtt < 1:937559‑M1/140‑137 (MQ=255) gCCCgctggcagtcagctgaccgagcacctgaccagccaccagggcatcgcctggggccagttcgatcacttcgcgggagatcttgcctgcgccttcggacagcaggaattcaccggcatggaccggctctacataggtt > 2:937559‑M1/1‑4 (MQ=255) gCCCTGGTGGCTGGACAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATCCTGTTTGCTTCTGTCGCGTCCTCAGATGTGTTGCGCCGTGGGCGTGCt > 2:515622/1‑150 (MQ=255) ccgctggcagtcagctgaccgagcacctgaccagccaccagggcatcgcctggggccagttcgatcacttcgcgggagatcttgcctgcgccttcggacagcaggaattcaccggcatggaccggctctacataggttttgctcatgttc > 1:1232656‑M1/1‑2 (MQ=255) ccTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATCCTGTTTGCTTCTGTCGCGTCCTCAGATGTGTTg > 1:266412/1‑133 (MQ=255) ccTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATCCTGTTTGCTTCTGTCGCGTCCTCAGATGTGTTg < 2:266412/133‑1 (MQ=255) cgccggcagttagctgaccgagcacctgaccagccaccagggaatcgcctggggccagttcgatcacttcgcgggagatcttgcctgcgccttcggacagcnggaattcaccggcatggaccggctctacataggttttgctcatgttca < 1:1096627‑M1/150‑150 (MQ=255) | GTCGGCAGGCCACACAATTCCGTCCCGGCCAAGGAGCCTGAACATGAGCAAAACCTATGTAGAGCCGGTCCATGCCGGTGAATTCCTGCTGTCCGAAGGC‑GCAGGCAAGATCTCCCGCGAAGTGATCGAACTGGCCCCAGGCGATGCCCTGGTGGCTGGTCAGGTGCTCGGTCAGCTGACTGCCAGCGGGCAGTTCACCCCGTACAGCCCTGAAGCCGAGGACGGCAGCGAAACGGCCAAGTGCATCCTGTTTGCTTCTGTCGCGTCCTCAGATGTGTTGCGCCGTGGGCGTGCTGTC > NC_002947/3430949‑3431246 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |