| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4049502 = | 77 (1.290) | 4 (0.070) | 4/232 | NT | 5.3% | coding (2009/2418 nt) | quiA | quinate dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | 4049531 = | 69 (1.190) | coding (2038/2418 nt) | quiA | quinate dehydrogenase | |||||
CAACGACATGCGTCTGGGCCTGTGGATCCAGATGATCCCGTCGCAGAACAAAGGTGGCGCGGCTTCCGGTGGCGAAGCACTGAACACTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCC‑GGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCATCGACATGAAGACCCGCCAGGTGGCCTGGCAGGTGCCGGTAGGCACCGTTGAAGACACCGGCCCGCTCGGCATCCGCATGCACCTGCCGATCAAGA > NC_002947/4049353‑4049648 | gacagggtgccgccaacggttggcaggccgatcttgatcggcaggtgcatgcggatgccgagcgggccggtgtcttcaacggtgcctaccggcacctgccaggccacctggcgggtcttcatgtcgatggcggtcagggtgccaaacggc > 1:575244‑M1/150‑150 (MQ=255) acagggtgccgccaagggttggcaggccgatcttgatcggcaggtgcatgcggatgccgagcgggccggtgtcttcaacggtgcctaccggcacctgccaggccacctggcgggtcttcatgtcgatggcggtcagggtgccaaacggcg > 2:1086502‑M1/149‑150 (MQ=255) aaCGACATGCGTCTGGGCCTGTGGATCCAGATGATCCCGTCGCAGAACAAAGGTGGCGCGGCTTCCGGTGGCGAAGCACTGAACACTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTgtcg > 1:432504/1‑150 (MQ=255) gtgccgccaagggttggcaggccgatcttgatcggcaggtgcatgcggatgccgagcgggccggtgtcttcaacggtgcctaccggcacctgccaggccacctggcgggtcttcatgtcgatggcggtcagggtgccaaacggcg > 2:311023‑M1/144‑145 (MQ=255) gtgccgccaagggttggcaggccgatcttgatcggcaggtgcatgcggatgccgagcgggccggtgtcttcaacggtgcctaccggcacctgccaggccacctggcgggtcttcatgtcgatggcggtcagggtgccaaacggcg < 1:311023‑M1/2‑1 (MQ=255) aTGCGTCTGGGCCTGTGGATCCAGATGATCCCGTCGCAGAACAAAGGTGGCGCGGCTTCCGGTGGCGAAGCACTGAACACTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGcc < 1:631815/150‑1 (MQ=255) tGCGTCTGGGCCTGTGGATCCAGATGATCCCGTCGCAGAACAAAGGTGGCGCGGCTTCCGGTGGCGAAGCACTGAACACTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCC‑g > 1:1134392/1‑150 (MQ=255) cgccaagggttggcaggccgatcttgatcggcaggtgcatgcggatgccgagcgggccggtgtcttcaacggtgcctaccggcacctgccaggccacctggcgggtcttcatgtcgatggcggtcagggtgccaaacggcg > 2:1200725‑M1/140‑141 (MQ=255) cgccaagggttggcaggccgatcttgatcggcaggtgcatgcggatgccgagcgggccggtgtcttcaacggtgcctaccggcacctgccaggccacctggcgggtcttcatgtcgatggcggtcagggtgccaaacggcg < 1:1200725‑M1/2‑1 (MQ=255) tCTGGGCCTGTGGATCCAGATGATCCCGTCGCAGAACAAAGGTGGCGCGGCTTCCGGTGGCGAAGCACTGAACACTGGCATGGGCGCGGTACCGCGCGGCCGCGCCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCC‑GGCAt > 2:862525/1‑150 (MQ=255) gCCTGTGGATCCAGATGATCCCGTCGCAGAACAAAGGTGGCGCGGCTTCCGGTGGCGAAGCACTGAACACTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCC‑GGCATTCCAt > 2:1628164/1‑150 (MQ=255) gCCTGTGGATCCAGATGATCCCGTCGCAGAACAAAGGTGGCGCGGCTTCCGGTGGCGAAGCACTGAACACTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCC‑GGCATTCCAt < 2:60184/150‑1 (MQ=255) cTGTGGATCCAGATGATCCCGTCGCAGAACAAAGGTGGCGCGGCTTCCGGTGGCGAAGCACTGAACACTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCC‑GGCATTCCATGc > 1:570958/1‑150 (MQ=255) 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> 2:789977/1‑126 (MQ=255) cGGTGGCGAAGCACTGAACACTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCC‑GGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCt < 1:789977/126‑1 (MQ=255) tGGCGAAGCACTGAACACTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCC‑GGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCATCGACATGAAGACCCGCCa < 2:914598/150‑1 (MQ=255) gAAGCACTGAACACTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCC‑GGCAAACCCTGCCGGGCCCGGACGTTTGTAACCTGGACCGCCACCGGCAGGGAGACCGCCCAAGTg > 2:15938/1‑150 (MQ=255) aaGCACTGAACACTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCC‑GGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCa > 1:181976/1‑114 (MQ=255) aaGCACTGAACACTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCC‑GGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCa < 2:181976/114‑1 (MQ=255) gCACTGAACACTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCC‑GGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCATCGACATGAAGACCCGCCAGGTGGcc > 1:333374/1‑150 (MQ=255) 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cccGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCC‑GGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCATCGACATGAAGACCCGCCAGGTGGCCTGGCAGGTGCCGGTAGGCACCGTTGAAGACACCGGCCCGCt > 1:1253218/1‑150 (MQ=255) cGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCC‑GGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCATCGACATGAAGACCCGCCAGGTGGCCTGGCAGGTGCCGGTAGGCACCGTTGAAGACACCGGCCCGCTCg > 1:896043/1‑150 (MQ=255) ccGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCC‑GGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCATCGACATGAAGACCCGCCAGGTGGCCTGGCAGGTGCCGGTAGGCACCGTTGAAGACACCGGCCCGCTCGGCATcc < 1:1523718/150‑1 (MQ=255) tGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCC‑GGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCATCGACATGAAGACCCGCCAGGTGGCCTGGCAGGTGACACTGGGCACCGTTGAAGACACCGGCCCGCTCGGCATCCGCa > 1:429751/1‑150 (MQ=255) tGAACAAGAACCGCTCCCTGTCGGTCGCC‑GGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCATCGACATGAAGACCCGCCAGGTGGCCTGGCAGGTGCCGGTAGGCACCGTTGAAGACACCGGCCCGCTCGGCATCCGCa < 1:1065958/150‑1 (MQ=255) aCAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCC‑GGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCATCGACATGAAGACCCGCCAGGTGGCCTGGCAGGTGCCGGTAGGCACCGTTGAAGACACCGGc > 2:637014/1‑131 (MQ=255) aCAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCC‑GGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCATCGACATGAAGACCCGCCAGGTGGCCTGGCAGGTGCCGGTAGGCACCGTTGAAGACACCGGc < 1:637014/131‑1 (MQ=255) aaGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCC‑GGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCATCGACATGAAGACCCGCCAGGTGGCCTGGCAg < 2:743051/99‑1 (MQ=255) aaGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCC‑GGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCATCGACATGAAGACCCGCCAGGTGGCCTGGCAg > 1:743051/1‑99 (MQ=255) aaGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCC‑GGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCATCGACATGAAGACCCGCCAGGTGGCCTGGCAGGTGCCGGTAGGCACCGTTGAAGACACCGGCCCGCTCGGCATCCGCATGCAc > 2:1304273/1‑150 (MQ=255) ccGCTTCCTGTCGGTCGCC‑GGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCATCGACATGAAGACCCGCCAGGTGGCCTGGCAGGTGCCGGTAGGCACCGTTGAAGACACCGGCCCCCTCGGCATCCGCATGCACCTGcc > 2:170983/1‑150 (MQ=255) cTTCCTGTCGGTCGCC‑GGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCATCGACATGAAGACCCGCCAGGTGGCCTGGCAGGTGCCGGTAGGCACCGTTGAAGACACCGGCCCGCTCGGCATCCGCATGCACCTGCCGAt > 2:163041/1‑150 (MQ=255) cTTCCTGTCGGTCGCC‑GGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCGGACCGCCATCGACATGAAGACCCGCCAGGTGGCCTGGCAGGTGCCGGTAGGCACCGTTGAAGACACCGGCCCGCTCGGCATCCGCATGCACCTGCCGAt < 1:277153/150‑1 (MQ=255) ttCCTGTCGGTCGCC‑GGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCATCGACATGAAGACCCGCCAGGTGGCCTGGCAGGTGCCGGTAGGCACCGTTGAAGACACCGGCCCGCTCGGCATCCGCATGCACCTGCCGATc < 2:1253218/150‑1 (MQ=255) ccTGTCGGTCGCC‑GGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCATCGACATGAAGACCCGCCAGGTGGCCTGGCAGGTGCCGGTAGGCACCGTTGAAGACACCGGCCCGCTCGGCATCCGCATGCACCTGCCGATCaa < 2:1134392/150‑1 (MQ=255) cTGTCGGTCGCC‑GGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCATCGACATGAAGACCCGCCAGGTGGCCTGGCAGGTGCCGGTAGGCACCGTTGAAGACACCGGCCCGCTCGGCATCCGCATGCACCTGCCGATCAAg < 1:1628164/150‑1 (MQ=255) tGTCGGTCGCC‑GGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCATCGACATGAAGACCCGCCAGGTGGCCTGGCAGGTGCCGGTAGGCACCGTTGAAGACACCGGCCCGCTCGGCATCCGCATGCACCTGCCGATCAAGa > 2:891251/1‑150 (MQ=255) | CAACGACATGCGTCTGGGCCTGTGGATCCAGATGATCCCGTCGCAGAACAAAGGTGGCGCGGCTTCCGGTGGCGAAGCACTGAACACTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCC‑GGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCATCGACATGAAGACCCGCCAGGTGGCCTGGCAGGTGCCGGTAGGCACCGTTGAAGACACCGGCCCGCTCGGCATCCGCATGCACCTGCCGATCAAGA > NC_002947/4049353‑4049648 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |