New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 4049502 = | 77 (1.290) | 4 (0.070) | 4/232 | NT | 5.3% | coding (2009/2418 nt) | quiA | quinate dehydrogenase |
? | NC_002947 | 4049531 = | 69 (1.190) | coding (2038/2418 nt) | quiA | quinate dehydrogenase |
AGATGATCCCGTCGCAGAACAAAGGTGGCGCGGCTTCCGGTGGCGAAGCACTGAACACTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCCGGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCATCGACATGAAGACCCGCCAGGTGGCCTGGCAGGTGCCGGTAGGCACCGTTGAAGACACCGGCCCGCTCGGCATCCGCATGCACCTGCCGATCAAGATCGGCCTGCCAACCCTTGGCGGCACCCTGTC > NC_002947/4049382‑4049679 | aGATGATCCCGTCGCAGAACAAAGGTGGCGCGGCTTCCGGTGGCGAAGCACTGAACACTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCCGGCATTCCATGCCAGGCAccgc > 2:847392/1‑150 (MQ=255) tCCCGTCGCAGAACAAAGGTGGCGCGGCTTCCGGTGGCGAAGCACTGAACACTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCCGGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTg < 2:432504/150‑1 (MQ=255) gatcggcaggtgcatgcggatgccgagcgggccggtgtcttcaacggtgcctaccggcacctgccaggccacctggcgggtcttcatgtcgatggcggtcagggtgccaaacggCGGTCGCCGGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTg > 1:141464‑M1/115‑150 (MQ=255) cGTCGCAGAACAAAGGTGGCGCGGCTTCCGGTGGCGAAGCACTGAACACTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCCGGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCa < 2:1627382/150‑1 (MQ=255) gTCGCAGAACAAAGGTGGCGCGGCTTCCGGTGGCGAAGCACTGAACACTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCCGGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCAc > 1:93429/1‑150 (MQ=255) tCGCAGAACAAAGGTGGCGCGGCTTCCGGTGGCGAAGCACTGAACACTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCCGGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCAcc < 2:884931/150‑1 (MQ=255) tCGCAGAACAAAGGTGGCGCGGCTTCCGGTGGCGAAGCACTGAACACTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCCGGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCAcc < 2:884397/150‑1 (MQ=255) aGAACAAAGGTGGCGCGGCTTCCGGTGGCGAAGCACTGAACACTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCCGGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGa > 1:1473936/1‑150 (MQ=255) atgcggatgccgagcgggccggtgtcttcaacggtgcctaccggcacctgccaggccacctggcgggtcttcatgtcgatggcggtcagggtgccaaacggCGGTCGCCGGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGttt > 1:1547472‑M1/102‑136 (MQ=255) atgcggatgccgagcgggccggtgtcttcaacggtgcctaccggcacctgccaggccacctggcgggtcttcatgtcgatggcggtcagggtgccaaacggCGGTCGCCGGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGttt < 2:1547472‑M1/35‑1 (MQ=255) aaaGGTGGCGCGGCTTCCGGTGGCGAAGCACTGAACACTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCCGGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGcc > 2:1523718/1‑150 (MQ=255) aaGGTGGCGCGGCTTCCGGTGGCGAAGCACTGAACACTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCCGGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCa < 2:1473936/150‑1 (MQ=255) cgcgGCTTCCGGTGGCGAAGCACTGAACACTGGCATGGGCGTGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCCGGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCATCGACAt < 1:252525/150‑1 (MQ=255) cGGTGGCGAAGCACTGAACACTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCCGGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCt < 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acTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCCGGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCATCGACATGAAGACCCGCCAGGTGGCCTGGCAGGTg < 1:542759/150‑1 (MQ=255) acTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCCGGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCATCGACATGAAGACCCGCCAGGTGGCCTGGCAGGTg > 1:585291/1‑150 (MQ=255) cTGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCCGGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCATCGACATGAAGACCCGCCAGGTGGCCTGGCAGGTGc < 2:585291/150‑1 (MQ=255) tGGCATGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCCGGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCATCGACATGAAGACCCGCCAGGTGGCCTGGCAGGTGcc > 2:1219382/1‑150 (MQ=255) tGGGCGCGGTACCGCTCAAGGGCACCCCGTATGCCGTGAACAAGAACCGCTTCCTGTCGGTCGCCGGCATTCCATGCCAGGCACCGCCGTTTGGCACCCTGACCGCCATCGACATGAAGACCCGCCAGGTGGCCTGGCAGGTGCCGGTAg < 2:570958/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
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