New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4257932 = | 62 (1.040) | 4 (0.070) | 4/236 | NT | 6.3% | coding (450/645 nt) | PP_3731 | TetR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 4257962 = | 59 (1.000) | coding (420/645 nt) | PP_3731 | TetR family transcriptional regulator |
ACCCAGGCCTCGCAGATGATCACGCCCTGCTCGGGGGTGAAGGTGCCGGGGTTCAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATCGCGTCGGCGGTCTTCACCGCCCCCCAGAAAGCCAGCCAGGCATCGAGCAATTGCGGGTCGAGCAGCTCGGCG > NC_002947/4257792‑4258079 | aCCCAGGCCTCGCAGATGATCACGCCCTGCTCGGGGGTGAAGGTGCCGGGGTTCAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCCAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGc < 2:918787/150‑1 (MQ=255) ccAGGCCTCGCAGATGATCACGCCCTGCTCGGGGGTGAAGGTGCCGGGGTTCAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑Ct > 1:14893/1‑150 (MQ=255) aGGCCTCGCAGATGATCACGCCCTGCTCGGGGGTGAAGGTGCCGGGGTTCAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTgg > 1:872586/1‑150 (MQ=255) ggCCTCGCAGATGATCACGCCCTGCTCGGGGGTGAAGGTGCCGGGGTTCAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGc < 2:886123/150‑1 (MQ=255) cTCGCAGATGATCACGCCCTGCTCGGGGGTGAAGGTGCCGGGGTTCAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAg < 1:859669/150‑1 (MQ=255) cAGATGATCACGCCCTGCTCGGGGGTGAAGGTGCCGGGGTTCAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGc > 2:927978/1‑150 (MQ=255) atgatCACGCCCTGCTCGGGGGTGAAGGTGCCGGGGTTCAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTgg > 2:1200654/1‑150 (MQ=255) atCACGCCCTGCTCGGGGGTGAAGGTGCCGGGGTTCAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCa < 2:313952/150‑1 (MQ=255) tCACGCCCTGCTCGGGGGTGAAGGTGCCGGGGTTCAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCaa < 2:1375912/150‑1 (MQ=255) gCCCTGCTCGGGGGTGAAGGTGCCGGGGTTCAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCCGGCTGATTGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGGCCTGCCAGCCCTCCTCCGCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTc > 1:521815/1‑150 (MQ=255) cTGCTCGGGGGTGAAGGTGCCGGGGTTCAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGt > 1:269667/1‑149 (MQ=255) cTGCTCGGGGGTGAAGGTGCCGGGGTTCAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGt < 2:269667/149‑1 (MQ=255) tGCGCGGGGGTGAAGGTGCGGGGGTTCGGGCCCGATGCCAGCCACAGGCCAGCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTg < 2:14893/150‑1 (MQ=255) cTCGGGGGTGAAGGTGCCGGGGTTCAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCg < 1:1087932/150‑1 (MQ=255) tCGGGGGTGAAGGTGCCGGGGTTCAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCgg < 2:849476/150‑1 (MQ=255) tCGGGGGTGAAGGTGCCGGGGTTCAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCgg > 1:214310/1‑150 (MQ=255) ggggTGAAGGTGCCGGGGTTCAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTAc < 2:872586/150‑1 (MQ=255) gTGAAGGTGCCGGGGATCAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGGTGCGGTACTCg > 1:433463/1‑150 (MQ=255) aaGGTGCCGGGGTTCAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCg < 2:1391824/150‑1 (MQ=255) aGGTGCCGGGGTTCAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGcc < 1:1622514/148‑1 (MQ=255) aGGTGCCGGGGTTCAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGcc > 2:1622514/1‑148 (MQ=255) gCCGGGGTGCAGGCCCGACTCCAGCCAGAGGCCATCAAGCAAGGCGCGCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑ATGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGa < 2:214310/150‑1 (MQ=255) ccGGGGTTCAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCgg < 2:1383506/100‑1 (MQ=255) ccGGGGTTCAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCgg > 1:1383506/1‑100 (MQ=255) cGGGGTTCAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGc > 1:37299/1‑109 (MQ=255) cGGGGTTCAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGc < 2:37299/109‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTc > 1:946756/1‑150 (MQ=255) cAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGACCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTg > 1:274955/1‑150 (MQ=255) gCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGATTGGTCGTGCAc > 1:1154130/1‑150 (MQ=255) gACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTgg < 1:1595436/150‑1 (MQ=255) gACGCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCATCTgg < 1:898929/150‑1 (MQ=255) tCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTg > 1:187517/1‑150 (MQ=255) aGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATc < 2:1049873/150‑1 (MQ=255) ccACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATcgc > 2:802408/1‑150 (MQ=255) cacaGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATcgcg > 1:397761/1‑150 (MQ=255) acaGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGc > 2:1094382/1‑85 (MQ=255) acaGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGc < 1:1094382/85‑1 (MQ=255) aGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCTCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATCGCGTcg > 1:1607353/1‑150 (MQ=255) gCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATCGCGTcggc > 1:916910/1‑150 (MQ=255) aagcaagGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATCGCGTCGGCGGTCtt > 2:1295849/1‑150 (MQ=255) gcaagGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATCGCGTCGGCGGTCTTCa > 2:1399926/1‑150 (MQ=255) aagGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTgg < 2:6238/114‑1 (MQ=255) aagGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTgg > 1:6238/1‑114 (MQ=255) gcgcTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATCGCGTCGGCGGTCTTCACCGcc > 1:1414246/1‑150 (MQ=255) aGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATCGCGTCGGCGGTCTTc < 2:907010/138‑1 (MQ=255) aGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATCGCGTCGGCGGTCTTc > 1:907010/1‑138 (MQ=255) cTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATCGCGTCGGCGGTCTTCACCGCCCCCCAGaaa < 1:1614233/150‑1 (MQ=255) aTGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATCGCGTCGGCGGTCTTCACCGCCCCCCAGAAagcc > 2:1161150/1‑150 (MQ=255) tGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATCGCGTCGGCGGTCTTCACCGCCCCCCAGAAagcca < 1:802408/150‑1 (MQ=255) tGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATCGCCTCGGAGGTCTTCACCGCCCCCCGGAAggcct < 2:767307/150‑2 (MQ=255) gccAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATCGCGTCGGCGGTCTTCACCGCCCCCCAGAAAGccagccag < 2:274955/150‑1 (MQ=255) gcacgaccactcctacggcgagtaccgcaacgaaCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCaa > 2:1083813‑M1/35‑63 (MQ=255) gcacgaccactcctacggcgagtaccgcaacgaaCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCaa < 1:1083813‑M1/29‑1 (MQ=255) ggTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGc > 2:1346176/1‑78 (MQ=255) ggTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGc < 1:1346176/78‑1 (MQ=255) gTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATCGCGTCGGCGGTCTTCACCGCCCCCCAGAAAGCCAGCCAGGCATc < 2:916910/150‑1 (MQ=255) tCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATCGCGTCGGCGGTCTTCACCGCCCCCCAGAAAGCCAGCCAGGCATCg > 2:499365/1‑150 (MQ=255) gCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATCGCGTCGGCGGTCTTCACCGCCCCCCAGAAAGCCAGCCAGGCATCGAGc > 2:1356874/1‑150 (MQ=255) gCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATCGCGTCGGCGGTATTCACCGCCCCCCGGAAAGCCAGCCAGGCATCGAGc > 2:1249647/1‑150 (MQ=255) aTCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATCGCGTCGGCGGTCTTCACCGCCCCCCAGAAAGCCAGCCAGGCATCGAGCaa > 2:312564/1‑150 (MQ=255) tacggcgagtaccgcaacgaaCTTGGCCAGCTACTGGCCAG‑‑GCTGGCCGAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATCGCGTCGGCGGTCTTCACCGCCCCCCAGAAagccagcc < 2:1500505‑M1/113‑1 (MQ=255) tacggcgagtaccgcaacgaaCTTGGCCAGCTACTGGCCAG‑‑GCTGGCCGAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATCGCGTCGGCGGTCTTCACCGCCCCCCAGAAagccagcc > 1:1500505‑M1/22‑134 (MQ=255) aGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATCGCGTCGGCGGTCTTCACCGCCCCCCAGAAAGCCAGCCAGGCATCGAGCAATTGCg < 1:1295849/150‑1 (MQ=255) gCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCGAATTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATCGCGTCGGCGGTCTTCACCGCCCCCCAGAAAGCCAGCCAGGCATCGAGCAATTGCgg < 1:927978/150‑1 (MQ=255) gCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATCGCGTCGGCGGTCTTCACCGCCCCCCAGAAAGCCAGCCAGGCATCGAGCAATTGCGGGTCGa < 1:1356874/150‑1 (MQ=255) gCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGtt > 2:172153/1‑81 (MQ=255) gCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGtt < 1:172153/81‑1 (MQ=255) cccTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATCGCGTCGGCGGTCTTCACCGCCCCCCAGAAAGCCAGCCAGGCATCGAGCAATTGCGGGTCGagcagc < 1:499365/150‑1 (MQ=255) tcctcctcGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATCGCGTCGGCGGTCTTCACCGCCCCCCAGAAAGCCAGCCAGGCATCGAGCAATTGCGGGTCGAGCAGCTCg < 1:1399926/150‑1 (MQ=255) ctcctcGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGtt < 1:1272622/75‑1 (MQ=255) ctcctcGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGtt > 2:1272622/1‑75 (MQ=255) tcctcGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGGGGTCGTGCACCTGGTTGATCGCGTCGGCGGTCTTCACCGCCCCCCAGAAAGCCAGCCAGGCATCGCCCAATTCCGTGTCGAGCAACCCGgcg > 2:942453/1‑150 (MQ=255) | ACCCAGGCCTCGCAGATGATCACGCCCTGCTCGGGGGTGAAGGTGCCGGGGTTCAGGCCCGACTCCAGCCACAGGCCATCAAGCAAGGCGCTCAGGCTGATGGCCGCCAGGTCGGCATCGAAGCCCTGCCAGCCCTCCTCCTCGGCCAGC‑‑CTGGCCAGTAGCTGGCCAAGTTCGTTGCGGTACTCGCCGTAGGAGTGGTCGTGCACCTGGTTGATCGCGTCGGCGGTCTTCACCGCCCCCCAGAAAGCCAGCCAGGCATCGAGCAATTGCGGGTCGAGCAGCTCGGCG > NC_002947/4257792‑4258079 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |