New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5739225 = | 53 (0.890) | 4 (0.070) | 4/234 | NT | 7.4% | coding (99/1365 nt) | hutF | formiminoglutamate deiminase |
? | NC_002947 | 5739261 = | 49 (0.840) | coding (135/1365 nt) | hutF | formiminoglutamate deiminase |
AACAGGATTCCACCGATGTCAGCCTACTTCGCCGAACGCGCCCTGCTACCTACGGGTTGGGCCAGCCATGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCTGGCGGAAGTCGCCGGCAACCCCAACGACAGTTTCTGGACCTGGCGAGACCTGATGTACCGCCTGGTCGGGCAGA > NC_002947/5739112‑5739400 | aaCAGGATTCCACCGATGTCAGCCTACTTCGCCGAACGCGCCCTGCTACCTACGGGTTGGGCCAGCCATGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTggcc < 1:607898/150‑1 (MQ=255) gATTCCACCGATGTCAGCCTACTTCGCCGAACGCGCCCTGCTACCTACGGGTTGGGCCAGCCATGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGccc > 2:1237144/1‑150 (MQ=255) aCCGATGTCAGCCTACTTCGCCGAACGCGCCCTGCTACCTACGGGTTGGGCCAGCCATGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCgctgct > 1:690120/1‑150 (MQ=255) ccGATGTCAGCCTACTTCGCCGAACGCGCCCTGCTACCTACGGGTTGGGCCAGCCATGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGctgctg > 1:1306443/1‑150 (MQ=255) tgtcgttggggttgccggcgacttccgccaggcctgccatggcgcgctggaaggcatgcgagtgcaggttgggcatgccgggcagcagcgggccgGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTggcc > 2:143996‑M1/96‑132 (MQ=255) tgtcgttggggttgccggcgacttccgccaggcctgccatggcgcgctggaaggcatgcgagtgcaggttgggcatgccgggcagcagcgggccgGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTggcc < 1:143996‑M1/37‑1 (MQ=255) ccTACTTCGCCGAACGCGCCCTGCTACCTACGGGTTGGGCCAGCCATGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGc < 2:1436523/150‑1 (MQ=255) cTACTTCGCCGAACGCGCCCTGCTACCTACGGGTTGGGCCAGCCATGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGcc < 1:685978/150‑1 (MQ=255) ttCGCCGAACGCGCCCTGCTACCTACGGGTTGGGCCAGCCATGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAAc > 2:1628602/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGAACGCGCCCTGCTACCTACGGGTTGGGCCAGCCATGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGAATGCCCAAc > 2:1132259/1‑150 (MQ=255) gAACGCGCCCTGCTACCTACGGGTTGGGCCAGCCATGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCAc > 2:847238/1‑150 (MQ=255) gAACGCGCCCTGCTACCTACGGGTTGGGCCAGCCATGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCAc < 1:573260/150‑1 (MQ=255) cccTGCTACCTACGGGTTGGGCCAGCCATGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTCGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCGGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATg < 1:622278/150‑1 (MQ=255) ccTGCTACCTACGGGTTGGGCCAGCCATGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGc < 1:1237144/150‑1 (MQ=255) acctacGGGTTGGGCCAGCCATGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCa < 1:638214/150‑1 (MQ=255) acctacGGGTTGGGCCAGCCATGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCa < 2:310631/150‑1 (MQ=255) cttacGGGTTGGGCCAGCCATGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAg > 2:408607/3‑150 (MQ=255) ctacGGGTTGGGCCAGCCATGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAgc > 1:1129220/1‑150 (MQ=255) tacGGGTTGGGCCAGCCATGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCgc > 2:1207800/1‑107 (MQ=255) tacGGGTTGGGCCAGCCATGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCgc < 1:1207800/107‑1 (MQ=255) gTTGGGCCAGCCATGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCa > 2:729949/1‑150 (MQ=255) ttGGGCCAGCCATGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCAt < 2:1306443/150‑1 (MQ=255) ggCCAGCCATGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCCTGGc > 2:328790/1‑150 (MQ=255) gccagccaTGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCa < 1:408607/150‑1 (MQ=255) ccagccaTGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAg < 2:1129220/150‑1 (MQ=255) cagccaTGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAgg < 1:1628602/150‑1 (MQ=255) ccaTGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCCCGCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCt > 1:1320015/1‑150 (MQ=255) aTGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCTgg < 1:1324816/150‑1 (MQ=255) gCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGcc > 2:1156341/1‑121 (MQ=255) gCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGcc < 1:1156341/121‑1 (MQ=255) cGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCTGGCGGaa < 2:690120/150‑1 (MQ=255) cGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCTGGCGGaa < 1:1065889/150‑1 (MQ=255) aTCGAGGTCGCAAGCGATGGCCGTGTGGCCAGAATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCCCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCTGGCGGAAGTc < 2:54864/150‑1 (MQ=255) cGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTTGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCTGGCGGAAGTCGCCGGCAACCCCaa < 1:757047/150‑1 (MQ=255) cGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCCGGCCTGGCGGAAGTCGCCGGCAACCCCAACGACAGt > 1:9001/1‑150 (MQ=255) gtgtGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCTGGCGGAAGTCGCCGGCAACCCCAACGACAGtt > 1:1126927/1‑150 (MQ=255) tgGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCTGGCGGAAGTCGCCGGCAACCCCAACGACAGTTTCt < 2:1126927/150‑1 (MQ=255) cAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGTCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCa > 2:1253763/1‑78 (MQ=255) cAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGTCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCa < 1:1253763/78‑1 (MQ=255) aGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCTGGCGGAAGTCGCCGGCAACCCCAACGACAGTTTCTGGAcc < 1:729949/150‑1 (MQ=255) aTCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCTGGCGGAAACCGCCGGCAACCCCAACGACAGTTTCTGGACCTgg > 2:744708/1‑150 (MQ=255) tCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCTGGCGGAAGTCGCCGGCAACCCCAACGACAGTTTCTGGACCTGGc > 1:594043/1‑150 (MQ=255) gAGCCTGGCGCTTCGCCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCTGACGGAAGTCGCCGGCAACCCCAACGACAGTTTCTGGACCTGGCga > 2:1185934/1‑150 (MQ=255) ggccaggcgctcggcgtcttcggccgaagcgccaggcCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCTGGCGGAAGTCGCCGGCAACCCCAACGACa > 2:143996‑M2/38‑132 (MQ=255) ggccaggcgctcggcgtcttcggccgaagcgccaggcCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCTGGCGGAAGTCGCCGGCAACCCCAACGACa < 1:143996‑M2/95‑1 (MQ=255) ccaggcgctcggcgtcttcggccgaagcgccaggcCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGc > 2:1225990‑M2/36‑58 (MQ=255) ccaggcgctcggcgtcttcggccgaagcgccaggcCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGc < 1:1225990‑M2/23‑1 (MQ=255) CTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCTGGCGGAAGTCGCCGGCAACCCCAACGACAGTTTCTGGACCTGGCGAGAcc < 2:1117447‑M1/150‑1 (MQ=255) ccGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCTGGCGGAAGTCGCCGGCAACCCCAACGACATTTTCTGGACCTTGCGAGACCTGATGTACCGcc < 1:328790/150‑1 (MQ=255) cGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCTGGCGGAAGTCGCCGGCAACCCCAACGACAGTTTCTGGACCTGGCGAGACCTGATGTACCGCCt > 2:845520/1‑150 (MQ=255) gAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCTGGCGGAAGTCGCCGGCAACCCCAACGACAGTTTCTGGACCTGGCGAGACCTGATGTACCGCCTg > 2:994946/1‑150 (MQ=255) gAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCTGGCGGAAGTCGCCGGCAACCCCAACGACAGTTTCTGGACCTGGCGAGACCTGATGTACCGCCTg > 1:1181674/1‑150 (MQ=255) aaGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCTGGc < 2:447515/88‑1 (MQ=255) aaGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCTGGc > 1:447515/1‑88 (MQ=255) cGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCTGGCGGAAGTCGCCGGCAACCCCAACGACAGTTTCTGGACCTGGCGAGACCTGATGTACCGCCTGGTCgg < 2:594043/150‑1 (MQ=255) cGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCTGGCGGAAGTCGCCGGCAACCCCAACGACAGTTTCTGGACCTGGCGAGACCTGATGTACCGCCTGGTCGGGCa < 1:994946/150‑1 (MQ=255) aGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCTGGCGGAAGTCGCCGGCAACCCCAACGACAGTTTCTGGACCTGGCGAGACCTGATGTACCGCCTGGTCGGGCAGa < 1:847238/150‑1 (MQ=255) ccTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCTGGCGGAAGTCGCCGGCAACCCCAACGACAGt < 2:558299/103‑1 (MQ=255) ccTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCTGGCGGAAGTCGCCGGCAACCCCAACGACAGt > 1:558299/1‑103 (MQ=255) | AACAGGATTCCACCGATGTCAGCCTACTTCGCCGAACGCGCCCTGCTACCTACGGGTTGGGCCAGCCATGTGCGTATCGAGGTCGCCAGCGATGGCCGTGTGGCCAGCATCGAGCCTGGCGCTTCGGCCGAAGACGCCGAGCGCCTGGCCGGCCCGCTGCTGCCCGGCATGCCCAACCTGCACTCGCATGCCTTCCAGCGCGCCATGGCAGGCCTGGCGGAAGTCGCCGGCAACCCCAACGACAGTTTCTGGACCTGGCGAGACCTGATGTACCGCCTGGTCGGGCAGA > NC_002947/5739112‑5739400 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |