New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1068110 | 105 (1.190) | 9 (0.110) | 10/234 | NT | 8.0% | coding (273/948 nt) | PP_0926 | membrane protein |
? | NC_002947 | = 1068121 | 107 (1.290) | coding (284/948 nt) | PP_0926 | membrane protein |
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
TCGCAGCTGGTATTCAACGTCTGCATGCCGGCGCTGCTCTTCCTCGGCATCTACCACGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCATCTATACCCAGGGCGCCTTCCGCGGCAACAACGGTGTGATCGGCCTGGCCCTGGCCGCCAGCCTGTACGGTGACTATGGCATTTCCCTGGGGGCGGTACTCGCAGGCCTGGTCATCCTCAT > NC_002947/1067961‑1068259 | tCGCAGCTGGTATTCAACGTCTGCATGCCGGCGCTGCTCTTCCTCGGCATCTACCACGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATC > 1:1588662‑M1/1‑150 (MQ=255) cGCAGCTGGTATTCAACGTCTGCATGCCGGCGCTGCTCTTCCTCGGCATCTACCACGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCt < 2:695546/150‑1 (MQ=255) aGCTGGTATTCAACGTCTGCATGCCGGCGCTGCTCTTCCTCGGCATCTACCACGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGgc < 2:1979610/150‑1 (MQ=255) aGCTGGTATTCAACGTCTGCATGCCGGCGCTGCTCTTCCTCGGCATCTACCACGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGgc < 1:2058163/150‑1 (MQ=255) ttCAACGTCTGCATGCCGGCGCTGCTCTTCCTCGGCATCTACCACGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCg < 2:1356286‑M2/150‑2 (MQ=255) cAACGTCTGCATGCCGGCGCTGCTCTTCCTCGGCATCTACCACGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCgat > 1:526259‑M2/1‑147 (MQ=255) aaCGTCTGCATGCCGGCGCTGCTCTTCCTCGGCATCTACCACGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCgatg < 2:868689‑M2/150‑5 (MQ=255) aaCGTCTGCATGCCGGCGCTGCTCTTCCTCGGCATCTACCACGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCgatg > 1:2025297‑M2/1‑146 (MQ=255) cGTCTGCATGCCGGCGCTGCTCTTCCTCGGCATCTACCACGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCgggctgcgccagatggc < 1:907853‑M1/150‑18 (MQ=255) tGCATGCCGGCGCTGCTCTTCCTCGGCATCTACCACGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGAc < 1:1018633/150‑1 (MQ=255) tGCCGGCGCTGCTCTTCCTCGGCATCTACCACGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCggg < 2:288767/150‑1 (MQ=255) cGGCGCTGCTCTTCCTCGGCATCTACCACGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCa < 2:1235138/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGCTCTTCCTCGGCATCTACCACGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTgg > 2:1738752/1‑124 (MQ=255) ggCGCTGCTCTTCCTCGGCATCTACCACGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCAt < 2:485713/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCTCTTCCTCGGCATCTACCACGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCATc < 2:2168929/150‑1 (MQ=255) gctCTTCCTCGGCATCTACCACGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCATCTATAc > 2:82523/1‑150 (MQ=255) ctctTCCTCGGCATCTACCACGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCgatgg > 1:783630‑M2/1‑125 (MQ=255) ctctTCCTCGGCATCTACCACGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCgatgg < 2:783630‑M2/130‑6 (MQ=255) ttCCTCGGCATCTACCACGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCACGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCATCTATACCCAg > 2:663101/1‑150 (MQ=255) ttCCTCGGCATCTACCACGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCATCTATACCCAg > 1:362948/1‑150 (MQ=255) ccTCGGCATTTGCCACGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCATCTATACCCAggg < 1:130355/150‑1 (MQ=255) cTCGGCATCTACCACGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCATCTATACCCAGGgc < 2:2054556/150‑1 (MQ=255) cATCTACCACGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCATCTATACCCAGGGCGCCtt > 1:1961384/1‑150 (MQ=255) 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aCCACGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCCCGGTC‑‑GGCCATCGGGCTGC‑GCCAgatggccatgccccaggcaatgg < 2:402747‑M2/130‑24 (MQ=255) ccACGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCAGCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCATCTATACCCAGGGCGCCTTCCGCgg > 2:584892/1‑150 (MQ=255) aCGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCATCTATACCCAGGGCGCCTTCCGCGGca > 1:1181754/1‑150 (MQ=255) cGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGCCGGACCGGGGCATCTATACCCAGGGCGCCTTCCGCGGcaacaa > 1:1664445/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCGCCGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCATCTATACCCAGGGCGCCTTCCGCGGCAACAACgg < 1:235479/150‑1 (MQ=255) 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gTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCggg > 2:1427355/1‑54 (MQ=255) tttCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCtggcgcagcccgatggccatgccccaggcaatggcgaaaccgaccagggtggcgacgatgaaatacaggatgacacc > 1:1347706‑M1/1‑28 (MQ=255) tttCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCtggcgcagcccgatggccatgccccaggcaatggcgaaaccgaccagggtggcgacgatgaaatacaggatgacacc < 2:1347706‑M1/105‑78 (MQ=255) tttCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCATCTATACCCAGGGCGCCTTCCGCGGCAACAACGGTGTGATCGGCCTGGCCCTGGCCGCCAGCCTGTACGGTGCCTATGGCATTTCCATGCGGGc < 2:974867/150‑1 (MQ=255) tttCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCATCTATACCCAGGGCGCCTTCCGCGGCAACAACGGTGTGATCGGCCTGGCCCTGGCCGCCAGCCTGTACGGTGACTATGGCATTTCCCTGGGGGc < 2:145617/150‑1 (MQ=255) gCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCATCTATACCCAGGGCGCCTTCCGCGGCAACAACGGTGTGATCGGcctgg < 2:959273/100‑1 (MQ=255) gCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCATCTATACCCAGGGCGCCTTCCGCGGCAACAACGGTGTGATCGGcctgg > 1:959273/1‑100 (MQ=255) ccATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCATCTATACCCAGGGCGCCTTCCGCGGCAACAACGGTGTGATCGGCCTGGCCCTGGCCGCCAGCCTGTACGGTGACTATGGCATTTcc > 1:983352/1‑137 (MQ=255) cATTGCCTGGGGCATGGCCATCtggcgcagcccgatggccatgccccaggcaatggcgaaaccgaccagggtggcgacgatgaaatacaggatgacaccgggcttgaccgctgcggccaggtcggcgtggtagat < 1:2208653‑M1/135‑114 (MQ=255) cATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCATCTATACCCAGGGCGCCTTCCGCGGCAACAACGgt > 1:457057/1‑85 (MQ=255) cATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCATCTATACCCAGGGCGCCTTCCGCGGCAACAACGgt < 2:457057/85‑1 (MQ=255) cATTGCCTGGGGCACGGCCATCgggctgcgccagatggccat < 2:1418813‑M1/42‑21 (MQ=255) aTTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCATCTATACCCAGGGCGCCTTCCGCGGCAACAACGGTGTGATCGGCCTGGCCCTGGCCGCCAGCCTGTACGGTGACTATgg < 2:223472/128‑1 (MQ=255) gCCGGGGGCCTGGCCATATGGC‑GAAGCCGGATGGCCGACCGGGGCATCTATACCCAGGGCGCCTTCCGCCGCAACACCGGTGTGATCGGCCTGGCCCTGGCCGCCAGCCTGTACGGTGACTATGGCATTTCCCTGGGGGCGGTACTCGCa < 2:713612/150‑1 (MQ=255) ggggCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCATCTATACCCAGGGCGCCTTCCGCGGCAACAACGGTGTGATCGGCCTGGCCCTGGCCGCCAGCCTGTACGGTGACTATGGCATTTCCCTGGGGGCGGTACTCGCAGGcc < 2:716849/150‑1 (MQ=255) ggggCATGGCCATCTGGA‑GCCGCACGCTGGAGGCCCGGGGCATCTATACCCAGAGCGCCTTCCGCGGCAACAACGGTGTGATCGGCCTGGCCCTGGCCGCCAGCCTGTACGGTGACTATGGCATTTCCCTGGGGGCGGTACTCGCAGGcc < 2:1288123/150‑1 (MQ=255) gCATGGCCATCtggcgcagcccgatggccgtgccccaggcaatggcgaaaccgaccagggtggcgacgatgaaatacaggatgacaccgggcttgaccgctgcggccaggtcggcgtggt > 1:1516035‑M1/1‑11 (MQ=255) gCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCATCTATACCCAGGGCGCCTTCCGCGGCAACAACGGTGTGATCGGCCTGGCCCTGGCCGCCAGCCTGTACGGTGACTATGGCATTTCCCTGGGGGCGGTACTCGCAGGCCTgg > 2:800877/1‑150 (MQ=255) aTGGCCATCTGGC‑GCAGCCCgatggccgtgccccaggcaatg > 1:1418813‑M2/1‑20 (MQ=255) ggCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCATCTATACCCAGGGCGCCTTCCGCGGCAACAACGGTGTGATCGGCCTGGCCCTGGCCGCCAGCCTGTACGGTGACTATGGCATTTCCCTGGGGGCGGTACTCGCAGGCCTGGTCAt < 1:125954/150‑1 (MQ=255) gCCATCTGGC‑GCAGCCCgatggccatgccccaggcaatggcgaaaccgaccagggtggcgacgatgaaatacaggatgacaccgggcttgaccgctgcggccaggtcggcgtggtagatgccgaggaagagcagcgccggcatgcagacg < 1:907853‑M2/150‑134 (MQ=255) gCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCATCTATACCCAGGGCGCCTTCCGCGGCAACAACGGTGTGATCGGCCTGGCCCTGGCCGCCAGCCTGTACGGTGACTATGGCATTTCCCTGGGGGCGGTACTCGCAGGCCTGGTCATc > 2:1121503/1‑150 (MQ=255) ccATCgggctgcgccagatggccatgccccaggcaatggcgaaaccgaccagggtggcgacgatgaaatacaggatgacaccgggcttgaccgctgcggccaggtcggcgtggtagatgccgaggaagag > 1:783630‑M1/1‑5 (MQ=255) cATCgggctgcgccagatggccatgccccaggcaatggcgaaaccgaccagggtggcgacgatgaaatacaggatgacaccgggcttgaccgctgcggccaggtcggcgtggtagatgccgaggaagagcagcgccggcatgcagacgtt < 2:868689‑M1/150‑147 (MQ=255) aTCgggctgcgccagatggccatgccccaggcaatggcgaaaccgaccagggtggcgacgatgaaatacaggatgacaccgggcttgaccgctgcggccaggtcggcgtggtagatgccgaggaagagcagcgccggcatgcagacgttg > 1:526259‑M1/1‑3 (MQ=255) aTCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCATCTATACCCAGGGCGCCTTCCGCGGCAACAACGGTGTGATCGGCCTGGCCCTGGCCGCCAGCCTGTACGGTGACTATGGCATTTCCCTGGGGGCGGTACTCGCAGGCCTGGTCATc < 2:598570/147‑1 (MQ=255) aTCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCATCTATACCCAGGGCGCCTTCCGCGGCAACAACGGTGTGATCGGCCTGGCCCTGGCCGCCAGCCTGTACGGTGACTATGGCATTTCCCTGGGGGCGGTACTCGCAGGCCTGGTCATc > 1:598570/1‑147 (MQ=255) cgggctgcgccagatggccatgccccaggcaatggcgaaaccgaccagggtggcgacgatgaaatacaggatgacaccgggcttgaccgctgcggccaggtcggcgtggtagatgccgaggaagagcagcgccggcatgcagacgttgaa < 2:1356286‑M1/150‑150 (MQ=255) | TCGCAGCTGGTATTCAACGTCTGCATGCCGGCGCTGCTCTTCCTCGGCATCTACCACGCCGACCTGGCCGCAGCGGTCAAGCCCGGTGTCATCCTGTATTTCATCGTCGCCACCCTGGTCGGTTTCGCCATTGCCTGGGGCATGGCCATCTGGC‑GCAGCCCGATGGCCGACCGGGGCATCTATACCCAGGGCGCCTTCCGCGGCAACAACGGTGTGATCGGCCTGGCCCTGGCCGCCAGCCTGTACGGTGACTATGGCATTTCCCTGGGGGCGGTACTCGCAGGCCTGGTCATCCTCAT > NC_002947/1067961‑1068259 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |