New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1622527 = | 80 (0.910) | 11 (0.150) | 9/212 | NT | 14.5% | intergenic (+7/+59) | PP_1421/PP_1422 | sensor histidine kinase TctE/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 1622577 = | 61 (0.810) | intergenic (+57/+9) | PP_1421/PP_1422 | sensor histidine kinase TctE/hypothetical protein |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
GGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGC > NC_002947/1622378‑1622673 | ggTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTg < 2:2337297/150‑1 (MQ=255) gcagatcgcccgctgcatcagtcagcgcgggcgtcaccggccattggctgcgctgccggcgtaccgccatctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGc < 1:697006‑M1/2‑1 (MQ=255) gTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGTGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGc < 1:156078/150‑1 (MQ=255) ttCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGcc > 1:1082334/1‑150 (MQ=255) tCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCt < 2:85717/150‑1 (MQ=255) tCTACCGGCGAAGCGCGAAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGAACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCt < 2:794708/150‑1 (MQ=255) tACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTCGGTTGGAGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCtgt > 1:62561/1‑150 (MQ=255) tACCGGCGAAGTGAGCAGGGAAGTGGGTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGCGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCCAGAAGGGCGGGTTGCGGCTGCGCGTGAGCTTTATCGGGGATTGATGGTTTGCCtgt < 2:269268/150‑1 (MQ=255) ccGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTgtgt > 2:1309610/1‑150 (MQ=255) cccgctgcatcagtcagcgcgggcgtcaccggccattggctgcgctgccggcgtaccgccatctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCg < 2:1988527‑M1/10‑1 (MQ=255) gCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGc > 1:948912/1‑150 (MQ=255) cgctgcatcagtcagcgcgggcgtcaccggccattggctgcgctgccggcgtaccgccatctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCtgt > 2:1303083‑M1/139‑144 (MQ=255) cgctgcatcagtcagcgcgggcgtcaccggccattggctgcgctgccggcgtaccgccatctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCtgt < 1:1303083‑M1/6‑1 (MQ=255) cGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGcc < 1:640690/150‑1 (MQ=255) gcatcagtcagcgcgggcgtcaccggccattggctgcgctgccggcgtaccgccatctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCtt > 1:2016656‑M1/135‑150 (MQ=255) catcagtcagcgcgggcgtcaccggccattggctgcgctgccggcgtaccgccatctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCttt < 1:1705924‑M1/17‑1 (MQ=255) catcagtcagcgcgggcgtcaccggccattggctgcgctgccggcgtaccgccatctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCttt > 1:1198590‑M1/134‑150 (MQ=255) catcagtcagcgcgggcgtcaccggccattggctgcgctgccggcgtaccgccatctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCttt < 2:957382‑M1/17‑1 (MQ=255) gcAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCAt < 1:1251192/150‑1 (MQ=255) gggCAGTGGGTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGCGAGTCATAGAAGCAATTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATg‑gg < 2:1230095/150‑1 (MQ=255) aGTGGGTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCa > 1:1008083/1‑150 (MQ=255) gTGGGTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCAt < 2:1990122/142‑1 (MQ=255) gTGGGTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCAt > 1:1990122/1‑142 (MQ=255) gTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCcgc < 2:1427724/150‑1 (MQ=255) tAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGa > 1:693063/1‑150 (MQ=255) gggCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGaaa < 1:1085382/150‑1 (MQ=255) accggccattggctgcgctgccggcgtaccgccatctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAg > 1:2162069‑M1/114‑150 (MQ=255) gCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAgg < 2:292395/150‑1 (MQ=255) ccggccattggctgcgctgccggcgtaccgccatctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAgg > 1:957382‑M1/113‑150 (MQ=255) ggccattggctgcgctgccggcgtcccgccatctggagttgcggtctggcaccgagctggaggtcgatgaacttctggaggctcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAgggg > 2:1875228‑M1/111‑150 (MQ=255) ggccattggctgcgctgccggcgtaccgccatctggggtagcggtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAgggg > 1:1191961‑M1/111‑150 (MQ=255) gagaTCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGt > 2:1241281/1‑150 (MQ=255) agaTCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTa < 2:1764648/150‑1 (MQ=255) tCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAg > 2:239609/1‑150 (MQ=255) gggCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGATGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAgc < 1:1375904/150‑1 (MQ=255) gggCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCaac < 1:1375958/150‑3 (MQ=255) gggCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGACTGTCTC‑CAGTGCGCAGGTGGCGCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAgc > 2:1228778/1‑150 (MQ=255) gcgcACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTg > 1:2145463/1‑136 (MQ=255) gcgcACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTg < 2:2145463/136‑1 (MQ=255) tctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GACTCACCcgc > 1:1986264‑M1/80‑111 (MQ=255) tctggggttgccgtttggcaccgagctggaggtcgatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GACTCACCcgc < 2:1986264‑M1/32‑1 (MQ=255) cTGGCGCCACGGCCCCTGCGCGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGCGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCTTGTGTCGCCCCTTTCAGG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATg < 1:280312/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAggg > 2:1257702/1‑117 (MQ=255) cTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATg > 1:503745/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATg > 2:2243131/1‑150 (MQ=255) gTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCgcgcg > 1:1981070/1‑149 (MQ=255) gTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGcc > 1:2061275/1‑150 (MQ=255) gACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTa < 1:1681244/122‑1 (MQ=255) aCCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGc > 1:717498/1‑107 (MQ=255) aCCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGc < 2:717498/107‑1 (MQ=255) ccTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCTGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCcag < 1:1309610/150‑1 (MQ=255) tGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCAt < 2:2040102/82‑1 (MQ=255) tGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCAt > 1:2040102/1‑82 (MQ=255) tGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCcagca > 2:2052436/1‑150 (MQ=255) ggCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCCCACGCTAAAGGGGTGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCcagca < 2:1153088/149‑1 (MQ=255) gCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCcagca < 2:2215638/149‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) gagaAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGAcc > 1:492614/1‑150 (MQ=255) gagaAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGAcc < 2:492614/150‑1 (MQ=255) gaAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGAc > 2:2171139/1‑147 (MQ=255) gaAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGAc < 1:2171139/147‑1 (MQ=255) gggCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTg > 2:233490/1‑98 (MQ=255) gggCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTg < 1:233490/98‑1 (MQ=255) ggCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCATCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCAt > 2:866260/1‑139 (MQ=255) ggCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCATCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCAt < 1:866260/139‑1 (MQ=255) atgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAggg < 1:526176‑M1/39‑1 (MQ=255) atgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAggg > 2:526176‑M1/45‑83 (MQ=255) cGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTAc > 2:859826/1‑99 (MQ=255) cGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTAc < 1:859826/99‑1 (MQ=255) cGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTc < 1:2243131/150‑1 (MQ=255) aactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGc > 2:120424‑M1/42‑82 (MQ=255) aactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGc < 1:120424‑M1/41‑1 (MQ=255) gTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGt < 1:239609/150‑1 (MQ=255) tgcgggtgcgggTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGGGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGc < 1:1659564/150‑1 (MQ=255) gtgcgggtgAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAAc < 2:1586290/150‑1 (MQ=255) tgcgggtgAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACg < 2:948912/150‑1 (MQ=255) tgcgggtgAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACg < 1:2052436/150‑1 (MQ=255) gcgggtgAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACgg < 1:2185966/150‑1 (MQ=255) tgAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGGCCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCCAcc > 1:1254531/1‑150 (MQ=255) tgAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGAc < 1:1200989/124‑1 (MQ=255) cTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAg > 2:1705924/1‑150 (MQ=255) tCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCcgc > 2:51387/1‑95 (MQ=255) tCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCcgc < 1:51387/95‑1 (MQ=255) tCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGc > 2:43471/1‑150 (MQ=255) ggATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATg < 1:2105851/85‑1 (MQ=255) aTTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACg > 1:2250667/1‑150 (MQ=255) ttGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGc > 2:2058270/1‑150 (MQ=255) gATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAAccc > 1:666511/1‑133 (MQ=255) gATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAAccc < 2:666511/133‑1 (MQ=255) gATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCg > 2:697006/1‑150 (MQ=255) aTGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCgg > 1:1729150/1‑150 (MQ=255) ggTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGt < 2:1013588/115‑1 (MQ=255) ggTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGt > 1:1013588/1‑115 (MQ=255) tttGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGgcagc > 2:2130052/1‑150 (MQ=255) tttGCCTGTGTCGCCCCCTCCAGG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGACGgcagc < 1:711144/150‑1 (MQ=255) | GGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGATCGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGC > NC_002947/1622378‑1622673 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |