New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3917240 = | 76 (0.860) | 6 (0.070) | 5/232 | NT | 8.0% | coding (978/3129 nt) | mexB | multidrug resistance protein MexB |
? | NC_002947 | 3917268 = | 67 (0.810) | coding (1006/3129 nt) | mexB | multidrug resistance protein MexB |
GGCACGCGCCTGAACGGCAAACCGGCCACGGCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCA > NC_002947/3917091‑3917384 | ggCACGCGCCTGAACGGCAAACCGGCCACGGCCTTCAGCGTGCTGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTAc < 1:824707/150‑1 (MQ=255) atggccagcatcacggcgaaggtgcccatcaatgccactggcacgaccagggtcgggatcagcgtgtagcgcaggttctgcaggaacaggaacatgactgcgaacaccagcagcatggcctcgaacagggtgttgatgacctgctcgatc > 1:1097524‑M1/150‑150 (MQ=255) ccagcatcacggcgaaggtgcccatcaatgccactggcacgaccagggtcgggatcagcgtgtagcgcaggttctgcaggaacaggaacatgactgcgaacaccagcagcatggcctcgaacagggtgttgatgacctgctcgatCGaca < 2:2078938‑M1/5‑1 (MQ=255) gcgcCTGAACGGCAAACCGGCCACGGCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCGATACTTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGacac < 2:1153534/150‑1 (MQ=255) cagcatcacggcgaaggtgcccatcaatgccactggcacgaccagggtcgggatcagcgtgtagcgcaggttctgcaggaacaggaacatgactgcgaacaccagcagcatggcctcgaacagggtgttgatgacctgctcgatCGacac < 1:1901828‑M1/6‑1 (MQ=255) gcatcacggcgaaggtgcccatcaatgccactggcacgaccagggtcgggatcagcgtgtagcgcaggttctgcaggaacaggaacatgactgcgaacaccagcagcatggcctcgaacagggtgttgatgacctgctcgatCGACACCt < 1:1886797‑M1/8‑1 (MQ=255) gcCTGAACGGCAAACCGGCCACGGCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCt > 1:838001/1‑150 (MQ=255) cTGAACGGCAAACCGGCCACGGCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCg > 2:1869670/1‑150 (MQ=255) tGAACGGCAAACCGGCCACGGCCTTCAGCATGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGc > 1:698643/1‑150 (MQ=255) acggcgaaggtgcccatcaatgccactggcacgaccagggtcgggatcagcgtgtagcgcaggttctgcaggaacaggaacatgactgcgaacaccagcagcatggcctcgaacagggtgttgatgacctgctcgatc > 1:1281270‑M1/138‑138 (MQ=255) acggcgaaggtgcccatcaatgccactggcacgaccagggtcgggatcagcgtgtagcgcaggttctgcaggaacaggaacatgactgcgaacaccagcagcatggcctcgaacagggtgttgatgacctgctcgatc < 2:1281270‑M1/1‑1 (MQ=255) gcgaaggtgcccatcaatgccactggcacgaccagggtcgggatcagcgtgtagcgcaggttctgcaggaacaggaacatgactgcgaacaccagcagcatggcctcgaacagggtgttgatgacctgctcgatcga < 1:1560065‑M1/3‑1 (MQ=255) gcgaaggtgcccatcaatgccactggcacgaccagggtcgggatcagcgtgtagcgcaggttctgcaggaacaggaacatgactgcgaacaccagcagcatggcctcgaacagggtgttgatgacctgctcgatcga > 2:1560065‑M1/135‑137 (MQ=255) gCAAACCGGCCACGGCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCg > 2:1989018/1‑150 (MQ=255) cAAACCGGCCACGGCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGt > 1:1340799/1‑150 (MQ=255) cAAACCGGCCACGGCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGt < 2:365332/150‑1 (MQ=255) aaaCCGGCCACGGCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTc > 1:1628352/1‑150 (MQ=255) aCCGGCCACGGCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCaa < 2:1408381/150‑1 (MQ=255) ccGGCCACGGCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAg < 2:1340799/150‑1 (MQ=255) ccGGCCACGGCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAg < 2:1853369/150‑1 (MQ=255) cGGCCACGGCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAgg > 1:2169083/1‑150 (MQ=255) ccACGGCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGgtgt < 2:838001/150‑1 (MQ=255) cACGGCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGtc < 1:1901112/150‑1 (MQ=255) aCGGCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGtcg > 2:1297808/1‑150 (MQ=255) ggCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGtcgat < 2:314092/150‑1 (MQ=255) gCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGtcgatc < 1:640807/150‑1 (MQ=255) cTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGtcgatcga < 1:1087444/150‑1 (MQ=255) ttCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAg < 2:594903/150‑1 (MQ=255) aGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAg < 1:403734/150‑1 (MQ=255) cAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGtcatc < 1:188369/150‑1 (MQ=255) acgaccagggtcgggatcagcgtgtagcgcaggttctgcaggaacaggaacatgactgcgaacaccagcagcatggcctcgaacagggtgttgatgacctgctcgatCGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGtcga < 1:883549‑M1/29‑1 (MQ=255) acgaccagggtcgggatcagcgtgtagcgcaggttctgcaggaacaggaacatgactgcgaacaccagcagcatggcctcgaacagggtgttgatgacctgctcgatCGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGtcga > 2:883549‑M1/108‑136 (MQ=255) tCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAg > 2:1018267/1‑138 (MQ=255) tCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAg < 1:1018267/138‑1 (MQ=255) aCCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCt > 2:691721/1‑150 (MQ=255) cccGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACGTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTg > 1:496370/1‑150 (MQ=255) cccGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCTCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTg < 1:1455934/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGtcatc < 2:1789361/140‑1 (MQ=255) ccGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGtcatc > 2:1669621/1‑140 (MQ=255) ccGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGtcatc < 1:1669621/140‑1 (MQ=255) ccGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGtcatc > 1:1789361/1‑140 (MQ=255) gcgcCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCg > 1:1980442/1‑150 (MQ=255) ccAACGCCATGGAAACCGATACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAgg < 2:637203/150‑1 (MQ=255) cAACGCCATGGAAACCGCTGCCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCGCGCGCTCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGc > 2:913423/1‑150 (MQ=255) gCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCAtg > 1:757679/1‑150 (MQ=255) ccATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCAtgc > 2:987296/1‑150 (MQ=255) cATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGGAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGgt > 2:1005830/1‑108 (MQ=255) cATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGGAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGgt < 1:1005830/108‑1 (MQ=255) cATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCAtgct > 1:745701/1‑150 (MQ=255) gAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGctgctg < 2:1628352/150‑1 (MQ=255) gAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTAGTCAGGCTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGctgctg > 1:746395/1‑150 (MQ=255) ccGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGgtgt < 1:1868182/150‑1 (MQ=255) ccGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGgtgt < 1:1297808/150‑1 (MQ=255) cTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCg < 1:1869670/150‑1 (MQ=255) cTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCg < 2:231275/150‑1 (MQ=255) cccTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAg > 2:1901828/1‑150 (MQ=255) tGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCa > 2:1904542/1‑150 (MQ=255) gTACGGGCGAAGATGCAGGACGTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCAtg > 1:1238814/1‑150 (MQ=255) caggaacatgactgcgaacaccagcagcatggcctcgaacagggtgttgatgacctgctcgatCGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGtcga < 2:889686‑M1/29‑1 (MQ=255) caggaacatgactgcgaacaccagcagcatggcctcgaacagggtgttgatgacctgctcgatCGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGtcga > 1:889686‑M1/64‑92 (MQ=255) cGGGCGACGATGCAGGACCTGGCGTGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCAtgttc < 2:176231/150‑1 (MQ=255) cGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCAtgttc < 2:1238814/150‑1 (MQ=255) gggCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGtca > 2:689730/1‑102 (MQ=255) gggCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGtca < 1:689730/102‑1 (MQ=255) ggCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCAtgttcct < 1:691721/150‑1 (MQ=255) ggCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCAtgttcct < 2:698643/150‑1 (MQ=255) gCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCAtgttcctg > 2:2009651/1‑150 (MQ=255) aagCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTGCGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGttcctgttcctg < 2:1892130/148‑1 (MQ=255) aGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGc < 1:1449332/147‑1 (MQ=255) aGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGc > 2:1449332/1‑147 (MQ=255) cTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAgg < 2:613973/82‑1 (MQ=255) cTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAgg > 1:613973/1‑82 (MQ=255) tGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGgtgt > 2:1196641/1‑69 (MQ=255) tGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGgtgt < 1:1196641/69‑1 (MQ=255) tGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTgc < 1:1989018/150‑1 (MQ=255) gcgcTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAg < 2:277701/119‑1 (MQ=255) gcgcTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAg > 1:277701/1‑119 (MQ=255) gcgcTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTa > 2:1379057/1‑150 (MQ=255) aCTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGc < 2:2147568/150‑1 (MQ=255) ggAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATccc < 2:757679/150‑1 (MQ=255) ggAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATccc < 2:745701/150‑1 (MQ=255) aaGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGa < 1:1772414/150‑1 (MQ=255) gtgttgatgacctgctcgatCGACACCTTGACGAACGGCGAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTg < 2:2140025‑M1/130‑1 (MQ=255) gTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGt > 2:415623/1‑150 (MQ=255) tACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATc < 2:1356463/135‑1 (MQ=255) tACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATc > 1:1356463/1‑135 (MQ=255) tgacctgctcgatCGACACCTTGACGAACGGCGAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGc > 1:2140025‑M1/14‑150 (MQ=255) aCGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGc < 2:2169083/150‑1 (MQ=255) cATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCa < 2:2023378/92‑1 (MQ=255) cATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCa > 1:2023378/1‑92 (MQ=255) aTCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGACAGTg > 2:2003419/1‑150 (MQ=255) cccTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCa > 1:1411327/1‑150 (MQ=255) ccTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAg < 1:2211114/62‑1 (MQ=255) ccTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAg > 2:2211114/1‑62 (MQ=255) ccTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATgctgctt > 2:1370037/1‑73 (MQ=255) ccTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATgctgctt < 1:1370037/74‑2 (MQ=255) | GGCACGCGCCTGAACGGCAAACCGGCCACGGCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCA > NC_002947/3917091‑3917384 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |