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tCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGG‑CTAAAATAGTCTCAAAGGGGGGGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTTGTGGGCCAAGGGACTAAGCACACATTTCATATTTCAACGAAAGACTAGTCTATGAGCACTGATAATAAGCAATCATTGCCCGCGATTACCCTCGCGGCGATTGGAGTTGTCTAc > 2:239888/1‑257 (MQ=255) tCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGG‑CTAAAATAGTCTCAAAGGGGGGGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTTGTGGGCCAAGGGACTAAGCACACATTTCATATTTCAACGAAAGACTAGTCTATGAGCACTGATAATAAGCAATCATTGCCCGCGATTACCCTCGCGGCGATTGGAGTTGTCTAc < 1:239888/257‑1 (MQ=255) gTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGG‑CTAAAATAGTCTCAAAGGGGGGGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTTGTGGGCCAAGGGACTAAGCACACATTTCATATTTCAACGAAAGACTAGTCTATGAGCACTGATAATAAGCAATCATTGCCCGCGATTACCCTCGCGGCGATTGGAGTTGTCTACGGCGATATTGGTACCATCCCGTTATATACACTTCGTGAAt > 1:354339/1‑292 (MQ=255) 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tGCTGGTGG‑CTAAAATAGTCTCAAAGGGGGGGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTTGTGGGCCAAGGGACTAAGCACACATTTCATATTTCAACGAAAGACTAGTCTATGAGCACt < 1:245750/173‑1 (MQ=255) tGCTGGTGG‑CTAAAATAGTCTCAAAGGGGGGGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTTGTGGGCCAAGGGACTAAGCACACATTTCATATTTCAACGAAAGACTAGTCTATGAGCACt > 2:245750/1‑173 (MQ=255) gCTGGTGG‑CTAAAATAGTCTCAAAGGGGGGTTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTTGTGGGCCAAGGGACTAAGCACACATTTCATATTTCAACGAAAGACTAGTCTATGAGCACTGATAATAAGCAATCATTGCCCGCGATTACCCTCGCGGCGATTGGAGTTGTCTACGGCGATATTGGTACCAGCCCGTTATATACACTTCGt < 2:566782/262‑1 (MQ=255) gCTGGTGG‑CTAAAATAGTCTCAAAGGGGGGGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTTGTGGGCCAAGGGACTAAGCACACATTTCATATTTCAACGAAAGACTAGTCTATGAGCACTGATAATAAGCAATCATTGCCCGCGATTACCCTCGCGGCGATTGGAGTTGTCTACGGCGATATTGGTACCAGCCCGTTATATACACTTCGt > 1:566782/1‑262 (MQ=255) 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ATTCAAACGCGCGGGCATTCTGAAAGGCGAATTTTAAGCGCCGGGCGATCAAACTTTTGGCAATACCTGGCGGGCCAAGGAGGAACACACTTTCACCACTTAATGCCGCTAATAAACACAAGCGGATGGCGTGGCTACGTTCATAAAGCCCCTTTTCCAACGAACTGCTCAGGCGGGAAATTCTTTCCGCTAATAAATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGG‑CTAAAATAGTCTCAAAGGGGGGGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTTGTGGGCCAAGGGACTAAGCACACATTTCATATTTCAACGAAAGACTAGTCTATGAGCACTGATAATAAGCAATCATTGCCCGCGATTACCCTCGCGGCGATTGGAGTTGTCTACGGCGATATTGGTACCAGCCCGTTATATACACTTCGTGAATGTTTGTCCGGCCAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCC > NZ_LN832404/3927395‑3927971 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |