| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 2,809,897 | (TTCGCCATGTGTTGTATGG)1→2 | coding (281/738 nt) | ygaZ → | putative L‑valine exporter, norvaline resistance protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2809878 = | 32 (0.140) | 179 (0.820) | 101/194 | 0.7 | 82.4% | coding (262/738 nt) | ygaZ | putative L‑valine exporter, norvaline resistance protein |
| ? | NC_000913 | = 2809896 | 45 (0.200) | coding (280/738 nt) | ygaZ | putative L‑valine exporter, norvaline resistance protein | |||||
Only 100 of 362 total aligned reads displayed.
GCATCATTTATGCAGGCGCGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGAG > NC_000913/2809780‑2809976 | gagccagttcgtcattgccgcgatgctgggagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgggttgtatgg > 2:3896113‑M1/99‑99 (MQ=255)gCATCATTTATGCAGGCGCGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATg > 1:5508707/1‑99 (MQ=255) catcatTTATGCAGGCGCGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGt < 2:779157/99‑1 (MQ=255) tcatTTATGCAGGCGCGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTc < 1:3620970/99‑1 (MQ=255) cagttcgtcattaccgcgatgctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCg < 2:2582573‑M1/5‑1 (MQ=255) agttcgtcattaccgcgatgctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGc > 2:685290‑M1/94‑99 (MQ=255) gttcgtcattaccgcgatgctggcagcagggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgagttgtatggttctac < 1:4764488‑M1/7‑4 (MQ=255) tcgtcattaccgcgatgctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcctggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCAt < 2:3295448‑M1/9‑1 (MQ=255) tcgtcattaccgcgatgctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCAt > 2:3873829‑M1/91‑99 (MQ=255) tGCAGGCGCGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCAtgt < 1:1067193/99‑1 (MQ=255) gtcattaccgcgatgctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCAtgt > 1:878218‑M1/89‑99 (MQ=255) gCAGGCGCGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCAtgtg < 1:3594201/99‑1 (MQ=255) cattaccgcgatgctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtacgGTTCgccatacaa > 1:1338659‑M1/87‑95 (MQ=255) attaccgcgatgctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGtgtt > 1:4991880‑M1/86‑99 (MQ=255) aGGCGCGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGtgtt < 1:1740463/99‑1 (MQ=255) gcgcGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGtgttgt > 1:770552/1‑99 (MQ=255) cgcgAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTa < 2:4031056/99‑1 (MQ=255) accgcgatgctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTa > 1:5477884‑M1/83‑99 (MQ=255) cgcgatgctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATg < 2:4161645‑M1/19‑1 (MQ=255) cgcgatgctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATg < 2:5176387‑M1/19‑1 (MQ=255) cgcgatgctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATg < 1:3778725‑M1/19‑1 (MQ=255) gatgctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGcc < 1:4126998‑M1/22‑1 (MQ=255) gCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgtt < 2:4659609‑M2/99‑4 (MQ=255) ccAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTAGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttc > 1:3940289‑M2/1‑95 (MQ=255) ccAGTTCGGGATGACCGCGACGCTGACAGCCGGGAGTAGTTTGGGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttc > 2:1839884‑M2/1‑95 (MQ=255) gTTCGTCATTGCCGCGGTGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTCGTGGATTGCTGCACTGACCGGCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgcc > 2:4389517‑M2/1‑92 (MQ=255) gTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgcc < 2:4310791‑M2/99‑8 (MQ=255) gTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgcc < 1:1655048‑M2/99‑8 (MQ=255) gTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgcc < 2:3417949‑M2/99‑8 (MQ=255) tCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtg < 2:2427148‑M2/99‑13 (MQ=255) tCATTACCGCGATGCGGGCAGCCGGGAGTAGGTTGTGGGTTGCTGCACTGGCGGTCGTGGCAATGGTTGGTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtg > 2:1027121‑M2/1‑87 (MQ=255) gccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGCGTTGTATGGCCCGTCACTGCg < 1:4209358‑M1/32‑1 (MQ=255) gaTTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCg < 2:5034389/98‑1 (MQ=255) cgggactagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttctccatgtgctgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTa > 1:5343082‑M1/66‑99 (MQ=255) aCCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgta < 1:878898‑M2/99‑18 (MQ=255) gagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGcc > 1:2642561‑M1/63‑99 (MQ=255) ccGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtat > 2:2107550‑M2/1‑81 (MQ=255) cgcgATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatg < 1:329007‑M2/99‑20 (MQ=255) cgcgATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcaccatgtgttgtatg < 1:3132855‑M2/99‑20 (MQ=255) cgATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggc > 1:887050‑M2/1‑78 (MQ=255) gtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGtatt < 2:382184‑M1/42‑1 (MQ=255) aTGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggccc < 1:4862593‑M2/99‑24 (MQ=255) tttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGtatta < 1:2672825‑M1/43‑1 (MQ=255) tttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGtatta < 1:4539943‑M1/43‑1 (MQ=255) tGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtca < 2:3004926‑M2/99‑28 (MQ=255) ggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCcgtattattaga < 1:203480‑M1/48‑4 (MQ=255) ggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAg < 1:1466235‑M1/48‑1 (MQ=255) gCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcact > 1:3500587‑M2/1‑70 (MQ=255) gattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGc < 1:2816807‑M1/49‑1 (MQ=255) cAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactg > 1:5385190‑M2/1‑69 (MQ=255) gCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcg < 2:4545738‑M2/99‑33 (MQ=255) ccGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgt > 2:3463411‑M2/1‑66 (MQ=255) gctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCt > 1:3265594‑M1/47‑99 (MQ=255) gggAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtag > 1:5192823‑M2/1‑64 (MQ=255) gggAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTg < 2:2567183/99‑1 (MQ=255) gggAGTAGTTTGTGGAATGCTGAACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtag > 1:2477902‑M2/1‑64 (MQ=255) ctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTg > 1:735260‑M1/46‑99 (MQ=255) cactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCaa > 1:1356624‑M1/43‑99 (MQ=255) cactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCaa < 2:3552844‑M1/57‑1 (MQ=255) actgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCaaa < 1:3886841‑M1/58‑1 (MQ=255) accgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATc < 2:5268641‑M1/62‑1 (MQ=255) accgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATc < 2:1845955‑M1/62‑1 (MQ=255) accgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATc < 2:2197953‑M1/62‑1 (MQ=255) accgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGGGTTGTATGGCCCGGCACTGCGTAGACGTATTATGCAGCGTCTGCAAAAATc > 2:1231168‑M1/38‑99 (MQ=255) acagtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATc < 1:1198403‑M1/62‑1 (MQ=255) ccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCg > 1:3087860‑M1/37‑99 (MQ=255) gtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGaa < 2:2463248‑M1/65‑1 (MQ=255) gtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGaa < 2:1418289‑M1/65‑1 (MQ=255) gATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagc > 2:1994700‑M2/1‑50 (MQ=255) atggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAAc < 2:3269693‑M1/68‑1 (MQ=255) tggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAAcc < 1:3533278‑M1/69‑1 (MQ=255) ttGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgt < 1:4407920‑M2/99‑52 (MQ=255) ttGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgt < 1:4078579‑M2/99‑52 (MQ=255) ggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCg < 2:2519910‑M1/70‑1 (MQ=255) gctgcACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtct < 1:1860442‑M2/99‑54 (MQ=255) caatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGcc > 1:2506050‑M1/28‑99 (MQ=255) ctgcACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctg > 2:4852700‑M2/1‑45 (MQ=255) aatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGccc > 1:645631‑M1/27‑99 (MQ=255) tgcACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgc > 2:4451650‑M2/1‑44 (MQ=255) tgcACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgc < 2:1728688‑M2/99‑56 (MQ=255) gcACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgca < 2:4831267‑M2/99‑57 (MQ=255) tGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaa < 2:2806828‑M2/99‑61 (MQ=255) tGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaa < 2:5140897‑M2/99‑61 (MQ=255) tcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGt < 2:3560339‑M1/82‑1 (MQ=255) gTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaa > 1:4917909‑M2/1‑34 (MQ=255) atgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGc > 1:1579814‑M1/13‑99 (MQ=255) atgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGc > 1:3393185‑M1/13‑99 (MQ=255) tgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCACAAATCGACAACCGCCCTGTGGCCGTTTGGcc < 2:1613698‑M1/88‑1 (MQ=255) tGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaacc < 1:2185056‑M2/99‑70 (MQ=255) gCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaaccgc < 2:477017‑M2/99‑72 (MQ=255) cAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaaccgcc < 2:3096013‑M2/99‑73 (MQ=255) ttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGAc > 1:2736660‑M1/8‑99 (MQ=255) tgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACg > 1:2907670‑M1/7‑99 (MQ=255) tatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGa > 1:5100324‑M1/5‑99 (MQ=255) ggATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaaccgccctgt > 2:3189190‑M2/1‑23 (MQ=255) ggATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcaacgtctgcaaaaatcgaaaaccgccctgt < 2:691074‑M2/99‑77 (MQ=255) gATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaaccgccctgtg < 1:1246207‑M2/99‑78 (MQ=255) gATGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGAt < 1:5558080/99‑1 (MQ=255) gTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaaccgccctgtgggc < 1:1903138‑M2/99‑81 (MQ=255) GTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGAg < 1:2586761‑M1/99‑1 (MQ=255) | GCATCATTTATGCAGGCGCGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGAG > NC_000913/2809780‑2809976 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |