Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | NC_000913 | 2,809,897 | (TTCGCCATGTGTTGTATGG)1→2 | coding (281/738 nt) | ygaZ → | putative L‑valine exporter, norvaline resistance protein |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2809878 = | 32 (0.140) | 179 (0.820) | 101/194 | 0.7 | 82.4% | coding (262/738 nt) | ygaZ | putative L‑valine exporter, norvaline resistance protein |
? | NC_000913 | = 2809896 | 45 (0.200) | coding (280/738 nt) | ygaZ | putative L‑valine exporter, norvaline resistance protein |
Only 100 of 367 total aligned reads displayed.
CGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGAGGTTTTTGCCGCCGCAACC > NC_000913/2809798‑2809994 | cgcgatgctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATg < 2:4161645‑M1/19‑1 (MQ=255) cgatgctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGc > 1:887050‑M1/79‑99 (MQ=255) gatgctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGcc < 1:4126998‑M1/22‑1 (MQ=255) ccAGTTCGGGATGACCGCGACGCTGACAGCCGGGAGTAGTTTGGGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttc > 2:1839884‑M2/1‑95 (MQ=255) aGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgc < 1:5437653‑M2/99‑7 (MQ=255) tggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCa > 1:35131‑M1/73‑99 (MQ=255) tCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCCTGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccat < 2:3295448‑M2/99‑10 (MQ=255) tCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccat > 2:5241352‑M2/1‑90 (MQ=255) cGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatg < 1:2425513‑M2/99‑11 (MQ=255) gTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgt > 1:462810‑M2/1‑88 (MQ=255) tCATTACCGCGATCCTGGCAGCCGGGAGTAGCTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCCATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtg < 1:2587870‑M2/99‑13 (MQ=255) gccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCg < 2:4545738‑M1/32‑1 (MQ=255) aTTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgtt < 1:1761386‑M2/99‑15 (MQ=255) aTTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgtt > 1:4991713‑M2/1‑85 (MQ=255) aTTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgtt > 1:5479891‑M2/1‑85 (MQ=255) cgggactagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttctccatgtgctgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTa > 1:5343082‑M1/66‑99 (MQ=255) aCCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgta < 1:878898‑M2/99‑18 (MQ=255) cgcgATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatg < 1:3778725‑M2/99‑20 (MQ=255) cgcgATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcaccatgtgttgtatg < 1:3132855‑M2/99‑20 (MQ=255) tttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGtatta < 1:4539943‑M1/43‑1 (MQ=255) tGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtca < 2:3004926‑M2/99‑28 (MQ=255) gtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTc < 1:4082329‑M1/46‑1 (MQ=255) gCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcact > 2:4314927‑M2/1‑70 (MQ=255) gCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcact < 2:2575481‑M2/99‑30 (MQ=255) gattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGc < 1:2816807‑M1/49‑1 (MQ=255) gattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGc > 2:4088124‑M1/51‑99 (MQ=255) cAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactg > 2:2470486‑M2/1‑69 (MQ=255) gggAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtag > 1:5192823‑M2/1‑64 (MQ=255) ctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTg > 1:735260‑M1/46‑99 (MQ=255) tgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGc < 2:1728688‑M1/55‑1 (MQ=255) tgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGc > 2:4451650‑M1/45‑99 (MQ=255) ggAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagc < 1:3324571‑M2/99‑37 (MQ=255) tgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCaaaaa < 1:354961‑M1/60‑1 (MQ=255) gtTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtatt < 1:5584612‑M2/99‑43 (MQ=255) gtTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtatt < 2:382184‑M2/99‑43 (MQ=255) accgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATc < 2:2197953‑M1/62‑1 (MQ=255) accgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGGGTTGTATGGCCCGGCACTGCGTAGACGTATTATGCAGCGTCTGCAAAAATc > 2:1231168‑M1/38‑99 (MQ=255) acagtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATc < 1:1198403‑M1/62‑1 (MQ=255) gtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGaa < 2:1418289‑M1/65‑1 (MQ=255) tcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGaaa > 2:506296‑M1/34‑99 (MQ=255) ggATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattaga < 1:203480‑M2/99‑49 (MQ=255) gATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagc > 2:1994700‑M2/1‑50 (MQ=255) atggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAAc < 2:3269693‑M1/68‑1 (MQ=255) tggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAAcc < 1:2185056‑M1/69‑1 (MQ=255) ttGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgt < 1:4407920‑M2/99‑52 (MQ=255) gctgcACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtct < 1:1860442‑M2/99‑54 (MQ=255) caatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGcc > 1:2506050‑M1/28‑99 (MQ=255) ctgcACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctg > 2:4852700‑M2/1‑45 (MQ=255) aatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGccc < 1:2668851‑M1/73‑1 (MQ=255) atggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCt > 1:2722086‑M1/26‑99 (MQ=255) tggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTTGCCGTCTTATTCAGCGTCTGCAAAACTCGAAAACCGCCCtg < 2:3545585‑M1/75‑1 (MQ=255) gcACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgca < 2:4831267‑M2/99‑57 (MQ=255) ggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCtgt > 1:1391199‑M1/24‑99 (MQ=255) ggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAACGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCtgt < 2:691074‑M1/76‑1 (MQ=255) cACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaa > 1:1355098‑M2/1‑42 (MQ=255) cACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaa < 2:3552844‑M2/99‑58 (MQ=255) aCTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaa < 1:3886841‑M2/99‑59 (MQ=255) cTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaa < 1:3393598‑M2/99‑60 (MQ=255) tGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaa > 1:4022528‑M2/1‑39 (MQ=255) tGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaa < 2:5140897‑M2/99‑61 (MQ=255) aCCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatc < 2:1845955‑M2/99‑63 (MQ=255) gccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGttt > 1:692001‑M1/16‑99 (MQ=255) gccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGttt > 1:80477‑M1/16‑99 (MQ=255) ccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTg < 1:1475900‑M1/85‑1 (MQ=255) tgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCACAAATCGACAACCGCCCTGTGGCCGTTTGGcc < 2:1613698‑M1/88‑1 (MQ=255) gCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaaccgc < 2:477017‑M2/99‑72 (MQ=255) cAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaaccgcc > 2:2837610‑M2/1‑27 (MQ=255) cAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaaccgcc < 2:3096013‑M2/99‑73 (MQ=255) ttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGAc > 1:2736660‑M1/8‑99 (MQ=255) tgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACg > 1:2907670‑M1/7‑99 (MQ=255) tgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACg > 2:323567‑M1/7‑99 (MQ=255) gtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACgg < 2:5497178‑M1/94‑1 (MQ=255) tatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGa < 2:3707138‑M1/95‑1 (MQ=255) tatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGa > 1:3771299‑M1/5‑99 (MQ=255) ggATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaaccgccctgt > 2:24396‑M2/1‑23 (MQ=255) gATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaaccgccctgtg < 1:1246207‑M2/99‑78 (MQ=255) gTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaaccgccctgtgggc < 1:1903138‑M2/99‑81 (MQ=255) GTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGAg > 1:4226367‑M1/1‑99 (MQ=255) tCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaaccgccctgtgggcgt < 2:3560339‑M2/99‑83 (MQ=255) gCCATGTGTTTTATGattcgccatgtgttgtatggcccgacactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaaccgccctgtgggcgttt > 2:2543938‑M2/1‑15 (MQ=255) gCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGAGGttt < 1:3054243/99‑1 (MQ=255) gCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGCCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTTTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGGGGttt > 2:1004701/1‑99 (MQ=255) ccATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGAGGtttt > 2:2378517/1‑99 (MQ=255) cATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAGATCGAAAACCGCCCTGTGGGCCTTTGGCCTGACGGATGAGGttttt < 1:5036986/99‑1 (MQ=255) cATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGAGGttttt < 2:2018413/99‑1 (MQ=255) cATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGAGGttttt < 1:1094941/99‑1 (MQ=255) aTGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaaccgccctgtgggcgtttggc > 1:485964‑M2/1‑12 (MQ=255) aTGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGAGGTTTTTg < 1:3042245/99‑1 (MQ=255) aTGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGAGGTTTTTg < 1:3271610/99‑1 (MQ=255) tgtgTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTTTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGAGGTTTTTgc > 2:767095/1‑99 (MQ=255) ttgtATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGAGGTTTTTgccgcc < 2:3874867/99‑1 (MQ=255) tgtATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGAGGTTTTTGccgccg < 2:782804/99‑1 (MQ=255) gtATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaaccgccctgtgggcgtttggcctgacgg < 1:4864335‑M2/99‑95 (MQ=255) gtATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaaccgccctgtgggcgtttggcctgacgg < 2:2689101‑M2/99‑95 (MQ=255) gtATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGAGGTTTTTGCcgccgc > 1:1616560/1‑99 (MQ=255) tATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaaccgccctgtgggcgtttggcctgacgga > 1:5100324‑M2/1‑4 (MQ=255) aTGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGGTTGGCCTGACGGATGAGGTTTTTGCCGccgcaa > 1:1586371/1‑99 (MQ=255) tGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGAGGTTTTTGCCGccgcaac < 1:4190616/99‑1 (MQ=255) ggttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaaccgccctgtgggcgtttggcctgacggatga < 1:3206741‑M2/99‑99 (MQ=255) ggttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaagcgaaaaccgccctgtgggcgtttggcctgacggatga > 2:4624784‑M2/1‑1 (MQ=255) | CGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGAGGTTTTTGCCGCCGCAACC > NC_000913/2809798‑2809994 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |