| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 2,809,897 | (TTCGCCATGTGTTGTATGG)1→2 | coding (281/738 nt) | ygaZ → | putative L‑valine exporter, norvaline resistance protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2809878 = | 42 (0.240) | 137 (0.810) | 85/194 | 0.9 | 76.8% | coding (262/738 nt) | ygaZ | putative L‑valine exporter, norvaline resistance protein |
| ? | NC_000913 | = 2809896 | 41 (0.240) | coding (280/738 nt) | ygaZ | putative L‑valine exporter, norvaline resistance protein | |||||
Only 100 of 300 total aligned reads displayed.
GCATCATTTATGCAGGCGCGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGAG > NC_000913/2809780‑2809976 | gCATCATTTATGCAGGCGCGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATg > 1:3368414/1‑99 (MQ=255)gCATCATTTATGCAGGCGCGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATg < 2:304955/99‑1 (MQ=255) catcatTTATGCAGGCGCGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGt > 1:3120439/1‑99 (MQ=255) gccagttcgtcattaccgcgatgctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgtgcgccatgtgttgtatgGtt > 1:2557561‑M1/97‑99 (MQ=255) atcatTTATGCAGGCGCGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGtt < 1:1127422/99‑1 (MQ=255) atcatTTATGCAGGCGCGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGtt > 2:90915/1‑99 (MQ=255) cagttcgtcattaccgcgatgctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCg > 1:2640600‑M1/95‑99 (MQ=255) atTTATGCAGGCGTGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGTCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGAAATGGATCTTCga > 2:3983706/1‑98 (MQ=255) ttcgtcattaccgcgatgctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCa < 2:175181‑M1/8‑1 (MQ=255) ttATGCAGGCGCGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCa < 2:1957151/99‑1 (MQ=255) tATGCAGGCGCGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCAt < 1:3110329/99‑1 (MQ=255) tATGCAGGCGCGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCAt < 1:3757037/99‑1 (MQ=255) aTGCAGGCGCGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCAtg > 1:1038871/1‑99 (MQ=255) tGCAGGCGCGAGGCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCAtgt < 2:3731143/99‑1 (MQ=255) gtcattaccgcgatgctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCAtgt > 1:872592‑M1/89‑99 (MQ=255) tcattaccgcgatgctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCAtgtg > 1:705320‑M1/88‑99 (MQ=255) tcattaccgcgatgctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCAtgtg > 1:241622‑M1/88‑99 (MQ=255) cAGGCGCGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGCAGTTTGTGGCTTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATgcgt > 2:3457300/1‑99 (MQ=255) aGGCGCGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGtgtt > 1:2807357/1‑99 (MQ=255) ggCGCGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTCGATTGCTGCACTGACCGTCATCGCAATGGATGTTCGCCATGtgttg < 1:3889190/99‑1 (MQ=255) taccgcgatgctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGtgttgt < 1:1667632‑M1/16‑1 (MQ=255) gcgcGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGcgttgt > 1:2368445/1‑99 (MQ=255) cgcgAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTa < 2:3258309/99‑1 (MQ=255) accgcgatgctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTa > 2:360636‑M1/83‑99 (MQ=255) accgcgatgctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTa > 1:1956019‑M1/83‑99 (MQ=255) gcgAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTAt < 2:2413726/99‑1 (MQ=255) gAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCTTGGTAATGGATGTTCGCCCTGTGTTGTATGg < 2:962123‑M2/99‑2 (MQ=255) cgatgctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTAGTATGGc > 2:4103297‑M1/79‑99 (MQ=255) aGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgt > 2:2682762‑M2/1‑97 (MQ=255) gctggcagtcgggagtagtttgtggattgctgcactgttcgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATTGCCCGt > 2:4034190‑M1/75‑99 (MQ=255) gctggcagccgggagtagtttgtggattgttgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGt > 2:1121840‑M1/75‑99 (MQ=255) gctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGt < 1:4037152‑M1/25‑1 (MQ=255) gTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgcc < 1:1544829‑M2/99‑8 (MQ=255) ttCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgcca < 2:2574123‑M2/99‑9 (MQ=255) tCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccat > 2:1010012‑M2/1‑90 (MQ=255) tCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccat > 1:43247‑M2/1‑90 (MQ=255) gTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgt < 1:1929940‑M2/99‑12 (MQ=255) gTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgt < 2:2203723‑M2/99‑12 (MQ=255) gTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAACGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgt > 1:2418009‑M2/1‑88 (MQ=255) tCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtg > 2:3107207‑M2/1‑87 (MQ=255) tCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtg < 1:62135‑M2/99‑13 (MQ=255) agccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGc < 2:4273115‑M1/31‑1 (MQ=255) cATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCg < 1:844551/99‑1 (MQ=255) tACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgt > 2:346534‑M2/1‑83 (MQ=255) gggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAg < 2:2199091‑M1/35‑1 (MQ=255) gattagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgcaatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGcc > 2:2675256‑M1/63‑99 (MQ=255) cgcgATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcggcatgtgttgtatg < 1:3918531‑M2/99‑20 (MQ=255) cgcgATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatg < 1:1153752‑M2/99‑20 (MQ=255) cgcgATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatg > 1:3519800‑M2/1‑80 (MQ=255) tagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGta > 1:2895963‑M1/60‑99 (MQ=255) gATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGACGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccctgcgttgtatggcc < 2:2526179‑M2/99‑23 (MQ=255) gtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGtatt < 1:2662247‑M1/42‑1 (MQ=255) tttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGtatta < 2:2544007‑M1/43‑1 (MQ=255) tgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTattatt > 2:2409446‑M1/55‑99 (MQ=255) gtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTc < 1:2260377‑M1/46‑1 (MQ=255) tggattgctgcactgaccgtcatggcactggatggtcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTCTTATTCa < 2:1817392‑M1/47‑1 (MQ=255) tggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCa > 2:62960‑M1/53‑99 (MQ=255) ggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAg < 2:2073282‑M1/48‑1 (MQ=255) gCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGCTTGTTGCACTGACCTTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcact > 2:4040667‑M2/1‑70 (MQ=255) gattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGc < 1:3693167‑M1/49‑1 (MQ=255) gattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATATGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGc < 2:2579533‑M1/49‑1 (MQ=255) attgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCg > 1:3507623‑M1/50‑99 (MQ=255) gggAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtag < 1:4348217‑M2/99‑36 (MQ=255) tgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGc < 1:1909976‑M1/55‑1 (MQ=255) tgcactgaacgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCCCTGCGTCGCCGTATTATTCAGCGTCTGc < 2:1475398‑M1/55‑1 (MQ=255) gATTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgcagcc > 2:3753822‑M2/1‑62 (MQ=255) cactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCaa < 1:1267154‑M1/57‑1 (MQ=255) tagtTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgta > 1:2896379‑M2/1‑59 (MQ=255) accgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATc > 1:4276451‑M1/38‑99 (MQ=255) accgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGAATACAAAAATc > 2:3901105‑M1/38‑99 (MQ=255) tgtgGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattatt > 2:4151502‑M2/1‑54 (MQ=255) tgtgGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattatt > 1:39243‑M2/1‑54 (MQ=255) cgtggATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattatt > 1:4353698‑M2/2‑54 (MQ=255) cgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCTCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGa < 2:113691‑M1/64‑1 (MQ=255) tcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGaaa < 2:607534‑M1/66‑1 (MQ=255) tcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGaaa < 1:4162120‑M1/66‑1 (MQ=255) tggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAAcc > 1:1355610‑M1/31‑99 (MQ=255) tggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAAcc < 1:4112723‑M1/69‑1 (MQ=255) tgctgcACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtc > 2:3637612‑M2/1‑47 (MQ=255) 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cGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcga < 1:1379540‑M2/99‑65 (MQ=255) gccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGttt > 1:2335905‑M1/16‑99 (MQ=255) gccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGttt > 1:1160203‑M1/16‑99 (MQ=255) ccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTg > 2:2264776‑M1/15‑99 (MQ=255) aTGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaac > 2:1845404‑M2/1‑31 (MQ=255) ggCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaaccg < 2:1594381‑M2/99‑71 (MQ=255) tgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTg < 2:3588990‑M1/90‑1 (MQ=255) gttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGa < 2:1659525‑M1/91‑1 (MQ=255) aaTGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaaccgccc < 1:2663463‑M2/99‑74 (MQ=255) aaTGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaaccgccc < 2:712342‑M2/99‑74 (MQ=255) tgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACg > 2:2017292‑M1/7‑99 (MQ=255) tatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGa < 2:3236903‑M1/95‑1 (MQ=255) tGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaaccgccctgtggg < 2:1189647‑M2/99‑80 (MQ=255) GTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGAg > 1:2588383‑M1/1‑99 (MQ=255) | GCATCATTTATGCAGGCGCGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGAG > NC_000913/2809780‑2809976 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |