| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 2,809,897 | (TTCGCCATGTGTTGTATGG)1→2 | coding (281/738 nt) | ygaZ → | putative L‑valine exporter, norvaline resistance protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2809878 = | 42 (0.240) | 137 (0.810) | 85/194 | 0.9 | 76.8% | coding (262/738 nt) | ygaZ | putative L‑valine exporter, norvaline resistance protein |
| ? | NC_000913 | = 2809896 | 41 (0.240) | coding (280/738 nt) | ygaZ | putative L‑valine exporter, norvaline resistance protein | |||||
Only 100 of 288 total aligned reads displayed.
CGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGAGGTTTTTGCCGCCGCAACC > NC_000913/2809798‑2809994 | cgcgatgctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATg < 1:1153752‑M1/19‑1 (MQ=255) gAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCTTGGTAATGGATGTTCGCCCTGTGTTGTATGg < 2:962123‑M2/99‑2 (MQ=255) gAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGg < 2:1983715‑M2/99‑2 (MQ=255) cgatgctggcagccgggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGc > 2:3206043‑M1/79‑99 (MQ=255) aGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgt < 2:2223422‑M2/99‑3 (MQ=255) ccAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttc < 2:2305393‑M2/99‑5 (MQ=255) cAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGTATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcg > 1:2496873‑M2/1‑94 (MQ=255) cAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcg > 1:2640600‑M2/1‑94 (MQ=255) gctggcagtcgggagtagtttgtggattgctgcactgttcgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATTGCCCGt > 2:4034190‑M1/75‑99 (MQ=255) gctggcagccgggagtagtttgtggattgttgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGt > 2:1121840‑M1/75‑99 (MQ=255) ttCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgcca < 1:2355442‑M2/99‑9 (MQ=255) gTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgt > 1:872592‑M2/1‑88 (MQ=255) gTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgt < 2:1625467‑M2/99‑12 (MQ=255) gTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgt < 1:1929940‑M2/99‑12 (MQ=255) gggagtagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAg < 2:2199091‑M1/35‑1 (MQ=255) gattagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGCAGcc > 2:3753822‑M1/63‑99 (MQ=255) gattagtttgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgcaatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGcc > 2:2675256‑M1/63‑99 (MQ=255) cgcgATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcggcatgtgttgtatg < 1:3918531‑M2/99‑20 (MQ=255) cgcgATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatg > 1:3519800‑M2/1‑80 (MQ=255) gcgATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGt < 1:4010634/99‑1 (MQ=255) cgATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgtagtatggc > 2:4103297‑M2/1‑78 (MQ=255) aTGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggccc > 2:2448826‑M2/1‑76 (MQ=255) tgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTattatt > 1:39243‑M1/55‑99 (MQ=255) tgtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTattatt > 2:2409446‑M1/55‑99 (MQ=255) gtggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTc < 1:2260377‑M1/46‑1 (MQ=255) tggattgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCa > 2:62960‑M1/53‑99 (MQ=255) gCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGCTTGTTGCACTGACCTTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcact > 2:4040667‑M2/1‑70 (MQ=255) attgctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCg > 1:3507623‑M1/50‑99 (MQ=255) aGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgc < 2:4273115‑M2/99‑32 (MQ=255) gggAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtag < 1:4348217‑M2/99‑36 (MQ=255) ctgcactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTg < 1:260989‑M1/54‑1 (MQ=255) cactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCaa < 1:1267154‑M1/57‑1 (MQ=255) cactgaccgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCaa < 1:3035605‑M1/57‑1 (MQ=255) tagtTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgta > 1:2895963‑M2/1‑59 (MQ=255) tttGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtatta < 2:2544007‑M2/99‑44 (MQ=255) tttGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtatta < 1:2874744‑M2/99‑44 (MQ=255) accgtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGAATACAAAAATc > 2:3901105‑M1/38‑99 (MQ=255) cgtggATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattatt > 1:4353698‑M2/2‑54 (MQ=255) gtcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGaa < 1:1089474‑M1/65‑1 (MQ=255) tgGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCACTGGATGGTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtcttattca < 2:1817392‑M2/99‑48 (MQ=255) tcatggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGaaa < 1:4162120‑M1/66‑1 (MQ=255) ggATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcag < 2:2073282‑M2/99‑49 (MQ=255) catggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGaaaa > 2:4235712‑M1/33‑99 (MQ=255) gATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagc < 1:3693167‑M2/99‑50 (MQ=255) gATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatatgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagc < 2:2579533‑M2/99‑50 (MQ=255) tggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAAcc < 1:4112723‑M1/69‑1 (MQ=255) tggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAAcc > 1:1355610‑M1/31‑99 (MQ=255) ggcaatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCg < 2:1594381‑M1/70‑1 (MQ=255) tgctgcACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtc > 2:3637612‑M2/1‑47 (MQ=255) gctgaACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtct > 2:4075945‑M2/1‑46 (MQ=255) caatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGcc > 2:1886122‑M1/28‑99 (MQ=255) caatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGcc < 2:1674230‑M1/72‑1 (MQ=255) ctgcACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctg > 2:2578796‑M2/1‑45 (MQ=255) ctgcACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctg > 2:1197779‑M2/1‑45 (MQ=255) aatggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGccc < 1:2663463‑M1/73‑1 (MQ=255) tgcACTGAACGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtccctgcgtcgccgtattattcagcgtctgc < 2:1475398‑M2/99‑56 (MQ=255) tggatgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCtg < 2:2527805‑M1/75‑1 (MQ=255) atgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTgg > 1:2755573‑M1/22‑99 (MQ=255) tgttcgccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTggg < 2:1189647‑M1/79‑1 (MQ=255) tGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaa < 2:3551352‑M2/99‑61 (MQ=255) tGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaa > 1:3956243‑M2/1‑39 (MQ=255) gACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaat > 1:129070‑M2/1‑38 (MQ=255) aCCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatc > 1:4276451‑M2/1‑37 (MQ=255) cGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcga < 1:1379540‑M2/99‑65 (MQ=255) gccatgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGttt > 1:1160203‑M1/16‑99 (MQ=255) tCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaa < 2:607534‑M2/99‑67 (MQ=255) catgtgttgtatgGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTgg > 2:1020357‑M1/14‑99 (MQ=255) aTGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaac < 1:424205‑M2/99‑69 (MQ=255) aTGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaac < 2:3592006‑M2/99‑69 (MQ=255) 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gtgtTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGAGGTTTTTgcc < 1:698646/99‑1 (MQ=255) gtgtTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGAGGTTTTTgcc < 1:3849689/99‑1 (MQ=255) ttgtATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGAGGTTTTTgccgcc > 1:2952488/1‑99 (MQ=255) tgtATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaaccgccctgtgggcgtttggcctgacg > 1:1646200‑M2/1‑6 (MQ=255) gtATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGAGGTTTTTGCcgccgc > 1:1660911/1‑99 (MQ=255) tATGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaaccgccctgtgggcgtttggcctgacgga < 2:3236903‑M2/99‑96 (MQ=255) aTGgttcgccatgtgttgtatggcccgtcactgcgtagccgtattattcagcgtctgcaaaaatcgaaaaccgccctgtgggcgtttggcctgacggat > 1:308365‑M2/1‑3 (MQ=255) tGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGAGGTTTTTGCCGccgcaac > 2:326968/1‑99 (MQ=255) ggCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCATGTGTGCGTTTGGCGTGACGGATGAGGTTGTTGCCGccgcaacc < 1:3774012/99‑1 (MQ=255) | CGAGCCAGTTCGTCATTACCGCGATGCTGGCAGCCGGGAGTAGTTTGTGGATTGCTGCACTGACCGTCATGGCAATGGATGTTCGCCATGTGTTGTATGGCCCGTCACTGCGTAGCCGTATTATTCAGCGTCTGCAAAAATCGAAAACCGCCCTGTGGGCGTTTGGCCTGACGGATGAGGTTTTTGCCGCCGCAACC > NC_000913/2809798‑2809994 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |