| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 88432 = | 213 (1.250) | 6 (0.040) | 5/350 | 9.4 | 3.3% | coding (405/1005 nt) | cra | transcriptional repressor‑activator for carbon metabolism |
| ? | NC_000913 | 88504 = | 143 (0.870) | coding (477/1005 nt) | cra | transcriptional repressor‑activator for carbon metabolism | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
CGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAA‑TGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTT > NC_000913/88196‑88668 | cGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACg < 1:2173993/239‑1 (MQ=255)cGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACg < 1:809303/239‑1 (MQ=255) tGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAAc > 1:1618332/1‑236 (MQ=255) gCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTAAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTg < 2:561311/239‑1 (MQ=255) tGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTggg < 1:2110369/239‑1 (MQ=255) tGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTggg < 1:616052/239‑1 (MQ=255) tGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTggg < 1:1508611/239‑1 (MQ=255) acacGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACg > 2:14538/1‑238 (MQ=255) gTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCg < 2:1816413/239‑1 (MQ=255) ttGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCACg > 2:1365897/1‑239 (MQ=255) tCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCg > 1:2156018/1‑235 (MQ=255) cTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACTCCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTg < 1:1774488/238‑1 (MQ=255) cTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCAATTATTGTTACGACGTCGTTGCCTCCGGAGCGTCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTg < 1:519067/238‑1 (MQ=255) ttGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTg < 1:991229/237‑1 (MQ=255) ttGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTc > 1:904972/1‑239 (MQ=255) ccccGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTgg > 1:1486722/1‑239 (MQ=255) cccGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTCAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTTGGCTAACGACCCGTTCCCCATTGTCGCGCTgg > 1:890333/1‑238 (MQ=255) aTCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTggg < 2:444496/204‑1 (MQ=255) aTCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACcgc > 1:1965989/1‑239 (MQ=255) tcgggAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACcgc < 2:1658431/235‑1 (MQ=255) gagaACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTggg > 2:1524790/1‑199 (MQ=255) gagaACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTggg < 1:1524790/199‑1 (MQ=255) acacCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCg < 1:1995392/237‑1 (MQ=255) gCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGa > 1:1049154/1‑238 (MQ=255) tataCCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGGTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTg < 1:393648/235‑1 (MQ=255) tataCCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTg < 1:1320374/235‑1 (MQ=255) tataCCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTg < 1:155680/235‑1 (MQ=255) tataCCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTg < 1:1341462/235‑1 (MQ=255) aCCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTaa > 2:868700/1‑188 (MQ=255) aCCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACt > 1:856612/1‑238 (MQ=255) cccGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTc > 1:1146954/1‑239 (MQ=255) ccGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCa < 1:1198390/239‑1 (MQ=255) cATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCt < 1:1732451/176‑1 (MQ=255) cATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCt > 2:447207/1‑176 (MQ=255) cATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCt < 1:447207/176‑1 (MQ=255) cATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCgcgc > 2:907855/1‑216 (MQ=255) cATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCa > 1:1168503/1‑239 (MQ=255) cATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGACTGTCGCGCTGGACAGCGCCCTCGATCGTg > 2:1694259/1‑227 (MQ=255) aTCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTggg < 2:2044890/178‑1 (MQ=255) aTCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCa > 1:2072699/1‑238 (MQ=255) aTCCCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTCTCAACTGCTGATTTCCTGCTCAGAAGATCACACAGCCAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CACCGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCTCCa > 2:1744044/1‑238 (MQ=255) aaCTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGtggt < 1:1906526/239‑1 (MQ=255) tCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCGGGTTGATGCCAATATTGTTGCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGAGCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTg < 2:2189715/239‑1 (MQ=255) tCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTg < 2:1948186/239‑1 (MQ=255) tCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTg < 2:1152233/239‑1 (MQ=255) tCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCCGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTg < 2:2156018/239‑1 (MQ=255) aCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTggg < 1:1672472/161‑1 (MQ=255) cgcgGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGgatga < 1:286939/238‑1 (MQ=255) cgcgGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGgatga < 1:253153/238‑1 (MQ=255) aCGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGaaa < 1:2044919/239‑1 (MQ=255) cGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTggg < 1:534509/145‑1 (MQ=255) cGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTggg > 2:534509/1‑145 (MQ=255) ggTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAA‑TGc < 2:1436124/238‑1 (MQ=255) 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agaTCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCGGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCCCCCTCGATCGTGAACGCTTCACCAGGGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAA‑TGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCccgc < 2:194351/237‑1 (MQ=255) cAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTg > 2:124260/1‑157 (MQ=255) cAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTg < 1:124260/157‑1 (MQ=255) ccAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGtggt > 2:1317495/1‑173 (MQ=255) 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cACCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAA‑TGCTGGCGGAAGAGt < 1:1811741/187‑1 (MQ=255) aCCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAA‑TGCTGGCGGAAGAGTTACGt > 2:426691/1‑191 (MQ=255) aCCTTTTACA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAA‑TGCTGGCGGAAGAGTTACGt < 1:426691/191‑1 (MQ=255) aCA‑GCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAA‑TGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATc > 1:955930/1‑212 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |